MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004631	GCA	2	6	210114	210119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140724
4502	NC_004631	TAG	2	6	210126	210131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140724
4503	NC_004631	ATA	2	6	210158	210163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_004631	TGA	2	6	210165	210170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_004631	TTGCG	2	10	210229	210238	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4506	NC_004631	GATT	2	8	210301	210308	25 %	50 %	25 %	0 %	29140725
4507	NC_004631	TGG	2	6	210397	210402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140725
4508	NC_004631	ACT	2	6	210458	210463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140725
4509	NC_004631	TTG	2	6	210519	210524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140725
4510	NC_004631	TAG	2	6	210527	210532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140725
4511	NC_004631	ATT	2	6	210554	210559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140725
4512	NC_004631	ATT	2	6	210581	210586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140725
4513	NC_004631	AGG	2	6	210598	210603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140725
4514	NC_004631	GGC	2	6	210749	210754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140725
4515	NC_004631	CTG	2	6	211030	211035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140725
4516	NC_004631	GAAG	2	8	211039	211046	50 %	0 %	50 %	0 %	29140725
4517	NC_004631	CAG	2	6	211117	211122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140725
4518	NC_004631	AGGT	2	8	211146	211153	25 %	25 %	50 %	0 %	29140725
4519	NC_004631	CAT	2	6	211309	211314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140725
4520	NC_004631	GTA	2	6	211347	211352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140725
4521	NC_004631	CAT	2	6	211382	211387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140725
4522	NC_004631	GGC	2	6	211397	211402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140725
4523	NC_004631	TGT	2	6	211409	211414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140725
4524	NC_004631	T	6	6	211416	211421	0 %	100 %	0 %	0 %	29140725
4525	NC_004631	TAA	2	6	211450	211455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_004631	ATT	2	6	211465	211470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140726
4527	NC_004631	GCT	2	6	211496	211501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140726
4528	NC_004631	GTC	2	6	211512	211517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140726
4529	NC_004631	T	6	6	211537	211542	0 %	100 %	0 %	0 %	29140726
4530	NC_004631	GCA	2	6	211587	211592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140726
4531	NC_004631	GTG	2	6	211636	211641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140726
4532	NC_004631	GGT	2	6	211646	211651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140726
4533	NC_004631	CAC	2	6	211658	211663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140726
4534	NC_004631	CCA	2	6	211680	211685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140726
4535	NC_004631	TTG	2	6	211715	211720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140726
4536	NC_004631	GTG	2	6	211747	211752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140726
4537	NC_004631	C	7	7	211826	211832	0 %	0 %	0 %	100 %	29140726
4538	NC_004631	GGCG	2	8	211871	211878	0 %	0 %	75 %	25 %	29140726
4539	NC_004631	TGG	2	6	211882	211887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140726
4540	NC_004631	ATCT	2	8	211910	211917	25 %	50 %	0 %	25 %	29140726
4541	NC_004631	GGT	2	6	212083	212088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140727
4542	NC_004631	CCG	2	6	212129	212134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140727
4543	NC_004631	CAT	2	6	212146	212151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140727
4544	NC_004631	GTT	2	6	212177	212182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140727
4545	NC_004631	CAG	2	6	212225	212230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140727
4546	NC_004631	GTC	2	6	212267	212272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140727
4547	NC_004631	TGC	2	6	212293	212298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140727
4548	NC_004631	TGT	2	6	212302	212307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140727
4549	NC_004631	GCT	2	6	212344	212349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140727
4550	NC_004631	ATT	2	6	212365	212370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140727
4551	NC_004631	T	6	6	212392	212397	0 %	100 %	0 %	0 %	29140727
4552	NC_004631	TTTTA	2	10	212440	212449	20 %	80 %	0 %	0 %	29140727
4553	NC_004631	ACG	2	6	212645	212650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140727
4554	NC_004631	ATC	2	6	212672	212677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140727
4555	NC_004631	TGC	2	6	212787	212792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140728
4556	NC_004631	GC	3	6	212791	212796	0 %	0 %	50 %	50 %	29140728
4557	NC_004631	TCG	2	6	212797	212802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140728
4558	NC_004631	TGAGCC	2	12	212817	212828	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	29140728
4559	NC_004631	TGG	2	6	212885	212890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140728
4560	NC_004631	GTG	3	9	212956	212964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140728
4561	NC_004631	T	7	7	213030	213036	0 %	100 %	0 %	0 %	29140728
4562	NC_004631	TGG	2	6	213083	213088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140728
4563	NC_004631	CGC	2	6	213117	213122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140728
4564	NC_004631	TGC	2	6	213131	213136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140728
4565	NC_004631	GCT	2	6	213223	213228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140728
4566	NC_004631	TATT	2	8	213235	213242	25 %	75 %	0 %	0 %	29140728
4567	NC_004631	TTA	2	6	213275	213280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140729
4568	NC_004631	CTGG	2	8	213313	213320	0 %	25 %	50 %	25 %	29140729
4569	NC_004631	GTTGC	2	10	213333	213342	0 %	40 %	40 %	20 %	29140729
4570	NC_004631	GCTG	2	8	213371	213378	0 %	25 %	50 %	25 %	29140729
4571	NC_004631	TTC	2	6	213382	213387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140729
4572	NC_004631	TGT	2	6	213456	213461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140729
4573	NC_004631	TCG	2	6	213690	213695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140729
4574	NC_004631	CGAT	2	8	213710	213717	25 %	25 %	25 %	25 %	29140729
4575	NC_004631	GCC	2	6	213727	213732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140729
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4577	NC_004631	GCGA	2	8	213851	213858	25 %	0 %	50 %	25 %	29140729
4578	NC_004631	GCT	2	6	213868	213873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140729
4579	NC_004631	ATT	2	6	213877	213882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140729
4580	NC_004631	CTG	2	6	214016	214021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140729
4581	NC_004631	CCG	2	6	214049	214054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140729
4582	NC_004631	CCG	2	6	214109	214114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140729
4583	NC_004631	CAG	2	6	214117	214122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140729
4584	NC_004631	ATC	2	6	214159	214164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140729
4585	NC_004631	AGT	2	6	214275	214280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140729
4586	NC_004631	GGTT	2	8	214337	214344	0 %	50 %	50 %	0 %	29140729
4587	NC_004631	TCA	2	6	214424	214429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140729
4588	NC_004631	CAT	2	6	214443	214448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140729
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4591	NC_004631	TTA	2	6	214700	214705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140729
4592	NC_004631	GTA	2	6	214711	214716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140729
4593	NC_004631	TTCAC	2	10	214763	214772	20 %	40 %	0 %	40 %	29140729
4594	NC_004631	CTGCAT	2	12	214807	214818	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29140729
4595	NC_004631	GAG	2	6	214823	214828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140729
4596	NC_004631	TGGC	2	8	214831	214838	0 %	25 %	50 %	25 %	29140729
4597	NC_004631	CCT	2	6	214863	214868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29140729
4598	NC_004631	GCC	2	6	214963	214968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140729
4599	NC_004631	CGC	2	6	215004	215009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140729
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4601	NC_004631	ACA	2	6	215126	215131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140729
4602	NC_004631	CGC	2	6	215269	215274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140729
4603	NC_004631	ATAC	2	8	215275	215282	50 %	25 %	0 %	25 %	29140729
4604	NC_004631	TCT	2	6	215501	215506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140729
4605	NC_004631	TCC	2	6	215507	215512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29140729
4606	NC_004631	T	6	6	215515	215520	0 %	100 %	0 %	0 %	29140729
4607	NC_004631	T	7	7	215576	215582	0 %	100 %	0 %	0 %	29140729
4608	NC_004631	CAGG	2	8	215587	215594	25 %	0 %	50 %	25 %	29140729
4609	NC_004631	TTC	2	6	215834	215839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_004631	TTC	2	6	215876	215881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_004631	TCAA	2	8	215923	215930	50 %	25 %	0 %	25 %	29140730
4612	NC_004631	GAT	2	6	216004	216009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140730
4613	NC_004631	TGG	2	6	216029	216034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140730
4614	NC_004631	GTAG	2	8	216066	216073	25 %	25 %	50 %	0 %	29140730
4615	NC_004631	GAGTT	2	10	216098	216107	20 %	40 %	40 %	0 %	29140730
4616	NC_004631	GTA	2	6	216116	216121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140730
4617	NC_004631	TCGC	2	8	216136	216143	0 %	25 %	25 %	50 %	29140730
4618	NC_004631	GTT	2	6	216158	216163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140730
4619	NC_004631	CAG	2	6	216173	216178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140730
4620	NC_004631	TCT	2	6	216256	216261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140730
4621	NC_004631	AGA	2	6	216305	216310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140730
4622	NC_004631	GC	3	6	216332	216337	0 %	0 %	50 %	50 %	29140730
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4624	NC_004631	TCG	2	6	216436	216441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140730
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4752	NC_004631	CA	3	6	222414	222419	50 %	0 %	0 %	50 %	29140737
4753	NC_004631	CG	3	6	222421	222426	0 %	0 %	50 %	50 %	29140737
4754	NC_004631	GC	4	8	222502	222509	0 %	0 %	50 %	50 %	29140737
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5000	NC_004631	TGG	2	6	232587	232592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140742

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