MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 40307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004606	ATT	2	6	137509	137514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895035
3002	NC_004606	TC	3	6	137594	137599	0 %	50 %	0 %	50 %	28895035
3003	NC_004606	A	6	6	137634	137639	100 %	0 %	0 %	0 %	28895035
3004	NC_004606	AGA	2	6	137675	137680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895035
3005	NC_004606	ACCC	2	8	137688	137695	25 %	0 %	0 %	75 %	28895035
3006	NC_004606	ATT	2	6	137733	137738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895035
3007	NC_004606	TA	3	6	137752	137757	50 %	50 %	0 %	0 %	28895035
3008	NC_004606	TGC	2	6	137849	137854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28895035
3009	NC_004606	TGT	2	6	137912	137917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895035
3010	NC_004606	GAA	3	9	137979	137987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895035
3011	NC_004606	GAA	2	6	138024	138029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895035
3012	NC_004606	TTGGG	2	10	138039	138048	0 %	40 %	60 %	0 %	28895035
3013	NC_004606	TTG	2	6	138051	138056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895035
3014	NC_004606	GAT	2	6	138093	138098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895035
3015	NC_004606	TTG	2	6	138148	138153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895035
3016	NC_004606	ATT	2	6	138292	138297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895036
3017	NC_004606	TGC	2	6	138385	138390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28895036
3018	NC_004606	AGA	2	6	138442	138447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895036
3019	NC_004606	AG	3	6	138548	138553	50 %	0 %	50 %	0 %	28895036
3020	NC_004606	A	6	6	138666	138671	100 %	0 %	0 %	0 %	28895036
3021	NC_004606	TGA	2	6	138688	138693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895036
3022	NC_004606	TAT	2	6	138736	138741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895036
3023	NC_004606	AGA	2	6	138784	138789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895036
3024	NC_004606	TAT	2	6	138814	138819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895036
3025	NC_004606	CAT	2	6	138828	138833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895036
3026	NC_004606	ATT	2	6	138863	138868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_004606	AGT	2	6	138874	138879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_004606	A	6	6	138880	138885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_004606	TGA	2	6	138913	138918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_004606	GTT	2	6	138965	138970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895037
3031	NC_004606	T	6	6	138981	138986	0 %	100 %	0 %	0 %	28895037
3032	NC_004606	AAG	2	6	139006	139011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895037
3033	NC_004606	ATA	2	6	139073	139078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28895037
3034	NC_004606	CGC	2	6	139120	139125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28895037
3035	NC_004606	ATT	2	6	139135	139140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895037
3036	NC_004606	CTA	2	6	139146	139151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895037
3037	NC_004606	CTT	2	6	139227	139232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28895037
3038	NC_004606	GCA	2	6	139259	139264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28895037
3039	NC_004606	TTA	2	6	139265	139270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895037
3040	NC_004606	CAG	2	6	139287	139292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28895037
3041	NC_004606	TTG	2	6	139312	139317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895037
3042	NC_004606	CAT	2	6	139318	139323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895037
3043	NC_004606	GCG	2	6	139366	139371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28895037
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3045	NC_004606	GT	3	6	139472	139477	0 %	50 %	50 %	0 %	28895037
3046	NC_004606	TGT	3	9	139475	139483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895037
3047	NC_004606	TGA	2	6	139494	139499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895037
3048	NC_004606	GC	3	6	139589	139594	0 %	0 %	50 %	50 %	28895037
3049	NC_004606	CTT	2	6	139602	139607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28895037
3050	NC_004606	TAT	2	6	139662	139667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895037
3051	NC_004606	CTG	2	6	139683	139688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28895037
3052	NC_004606	TCT	2	6	139712	139717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28895037
3053	NC_004606	T	6	6	139749	139754	0 %	100 %	0 %	0 %	28895037
3054	NC_004606	GAA	2	6	139821	139826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895037
3055	NC_004606	ATC	2	6	139915	139920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895037
3056	NC_004606	T	8	8	139939	139946	0 %	100 %	0 %	0 %	28895037
3057	NC_004606	CAG	2	6	139989	139994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28895037
3058	NC_004606	CTG	2	6	140074	140079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28895037
3059	NC_004606	A	7	7	140098	140104	100 %	0 %	0 %	0 %	28895037
3060	NC_004606	ATA	2	6	140141	140146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28895037
3061	NC_004606	GGT	2	6	140149	140154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28895037
3062	NC_004606	ACA	2	6	140168	140173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28895037
3063	NC_004606	GTT	2	6	140249	140254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895038
3064	NC_004606	CGA	2	6	140324	140329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28895038
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3066	NC_004606	TTG	2	6	140356	140361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895038
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3070	NC_004606	GCAA	2	8	140483	140490	50 %	0 %	25 %	25 %	28895038
3071	NC_004606	TTC	2	6	140491	140496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28895038
3072	NC_004606	TGA	2	6	140534	140539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895038
3073	NC_004606	TCTG	2	8	140540	140547	0 %	50 %	25 %	25 %	28895038
3074	NC_004606	ATA	2	6	140557	140562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28895038
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3079	NC_004606	TCA	2	6	140807	140812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895038
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3081	NC_004606	TCT	2	6	140879	140884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28895038
3082	NC_004606	TGA	2	6	140921	140926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895038
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3087	NC_004606	T	6	6	141074	141079	0 %	100 %	0 %	0 %	28895038
3088	NC_004606	TAT	2	6	141160	141165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_004606	GAAA	2	8	141189	141196	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_004606	T	7	7	141280	141286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_004606	A	7	7	141306	141312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_004606	TAA	2	6	141330	141335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_004606	A	6	6	141354	141359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_004606	T	6	6	141363	141368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_004606	TAA	2	6	141373	141378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_004606	AT	3	6	141387	141392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_004606	CCTG	2	8	141409	141416	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_004606	CTT	2	6	141464	141469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_004606	GTT	3	9	141558	141566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895039
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3101	NC_004606	GGT	2	6	141648	141653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28895039
3102	NC_004606	TGAT	2	8	141676	141683	25 %	50 %	25 %	0 %	28895039
3103	NC_004606	AAG	2	6	141687	141692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895039
3104	NC_004606	TTC	2	6	141723	141728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28895039
3105	NC_004606	A	6	6	141733	141738	100 %	0 %	0 %	0 %	28895039
3106	NC_004606	ATG	2	6	141805	141810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895039
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3109	NC_004606	AAC	2	6	141923	141928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28895039
3110	NC_004606	GCT	2	6	141963	141968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28895039
3111	NC_004606	GAA	2	6	142104	142109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895039
3112	NC_004606	ATG	2	6	142168	142173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895039
3113	NC_004606	TGG	2	6	142277	142282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28895039
3114	NC_004606	CAA	2	6	142319	142324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28895039
3115	NC_004606	AGT	2	6	142325	142330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895039
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3117	NC_004606	GGTT	2	8	142464	142471	0 %	50 %	50 %	0 %	28895039
3118	NC_004606	GTC	2	6	142495	142500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28895039
3119	NC_004606	CT	4	8	142521	142528	0 %	50 %	0 %	50 %	28895039
3120	NC_004606	TG	3	6	142572	142577	0 %	50 %	50 %	0 %	28895039
3121	NC_004606	AAC	2	6	142627	142632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28895039
3122	NC_004606	GAA	2	6	142656	142661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895039
3123	NC_004606	TGA	2	6	142703	142708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895039
3124	NC_004606	CGT	2	6	142737	142742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28895039
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3382	NC_004606	AAG	2	6	154553	154558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895049
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3385	NC_004606	CGTCA	2	10	154693	154702	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3386	NC_004606	GTT	2	6	154787	154792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3389	NC_004606	TG	3	6	154872	154877	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3390	NC_004606	T	6	6	154888	154893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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