MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 40307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_004606	ACG	2	6	618206	618211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28895501
13003	NC_004606	ATC	2	6	618261	618266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_004606	AT	3	6	618352	618357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_004606	CTT	2	6	618366	618371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_004606	AAG	2	6	618385	618390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_004606	A	7	7	618409	618415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_004606	T	6	6	618454	618459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_004606	ATT	2	6	618465	618470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_004606	TAAA	2	8	618474	618481	75 %	25 %	0 %	0 %	28895502
13011	NC_004606	TCT	2	6	618520	618525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28895502
13012	NC_004606	TA	3	6	618542	618547	50 %	50 %	0 %	0 %	28895502
13013	NC_004606	ATC	2	6	618567	618572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895502
13014	NC_004606	TAA	2	6	618606	618611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28895502
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13016	NC_004606	TTG	2	6	618807	618812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895502
13017	NC_004606	CTTT	2	8	618859	618866	0 %	75 %	0 %	25 %	28895502
13018	NC_004606	TCC	2	6	618883	618888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28895502
13019	NC_004606	ATT	2	6	618894	618899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895502
13020	NC_004606	ATC	2	6	618903	618908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895502
13021	NC_004606	GA	3	6	618937	618942	50 %	0 %	50 %	0 %	28895502
13022	NC_004606	AAT	2	6	619009	619014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28895502
13023	NC_004606	TTCT	2	8	619032	619039	0 %	75 %	0 %	25 %	28895502
13024	NC_004606	TC	3	6	619050	619055	0 %	50 %	0 %	50 %	28895502
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13029	NC_004606	A	6	6	619294	619299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_004606	T	7	7	619300	619306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_004606	CAT	2	6	619340	619345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_004606	TGT	2	6	619359	619364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_004606	ATA	2	6	619373	619378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_004606	TAG	2	6	619380	619385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_004606	TAT	2	6	619393	619398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_004606	TAG	2	6	619418	619423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_004606	CAA	2	6	619461	619466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_004606	AT	3	6	619469	619474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13041	NC_004606	AT	3	6	619619	619624	50 %	50 %	0 %	0 %	28895503
13042	NC_004606	AGAT	2	8	619632	619639	50 %	25 %	25 %	0 %	28895503
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13046	NC_004606	AGT	2	6	619772	619777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13048	NC_004606	TTTAG	2	10	619845	619854	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_004606	TGA	2	6	619860	619865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_004606	TGTA	2	8	619893	619900	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_004606	AC	3	6	619930	619935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13052	NC_004606	A	6	6	619955	619960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_004606	AAT	2	6	620081	620086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13056	NC_004606	GTA	2	6	620184	620189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_004606	TGT	2	6	620192	620197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13059	NC_004606	TGA	2	6	620430	620435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895504
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13064	NC_004606	TGG	2	6	620537	620542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28895504
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13101	NC_004606	AG	3	6	622449	622454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13109	NC_004606	TACT	2	8	622734	622741	25 %	50 %	0 %	25 %	28895506
13110	NC_004606	TCA	2	6	622769	622774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895506
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13113	NC_004606	TG	3	6	622902	622907	0 %	50 %	50 %	0 %	28895506
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13125	NC_004606	AAAG	2	8	623309	623316	75 %	0 %	25 %	0 %	28895507
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13128	NC_004606	ATG	2	6	623383	623388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895507
13129	NC_004606	A	6	6	623460	623465	100 %	0 %	0 %	0 %	28895507
13130	NC_004606	CGT	2	6	623570	623575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28895507
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13133	NC_004606	A	6	6	623748	623753	100 %	0 %	0 %	0 %	28895507
13134	NC_004606	A	6	6	623769	623774	100 %	0 %	0 %	0 %	28895507
13135	NC_004606	AGGA	2	8	623809	623816	50 %	0 %	50 %	0 %	28895507
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13137	NC_004606	GAGTT	2	10	623842	623851	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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13153	NC_004606	A	7	7	624586	624592	100 %	0 %	0 %	0 %	28895508
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13157	NC_004606	ATC	2	6	624944	624949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895508
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13160	NC_004606	TAC	2	6	625045	625050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13166	NC_004606	T	7	7	625420	625426	0 %	100 %	0 %	0 %	28895509
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13240	NC_004606	A	6	6	628449	628454	100 %	0 %	0 %	0 %	28895513
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13250	NC_004606	A	7	7	629232	629238	100 %	0 %	0 %	0 %	28895514
13251	NC_004606	ATCA	2	8	629244	629251	50 %	25 %	0 %	25 %	28895514
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