MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 40307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004606	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004606	T	6	6	15	20	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004606	T	6	6	22	27	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004606	A	6	6	40	45	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004606	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004606	ACTA	2	8	147	154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_004606	AAG	2	6	217	222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004606	T	6	6	251	256	0 %	100 %	0 %	0 %	28894913
9	NC_004606	T	6	6	310	315	0 %	100 %	0 %	0 %	28894913
10	NC_004606	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894913
11	NC_004606	A	7	7	395	401	100 %	0 %	0 %	0 %	28894913
12	NC_004606	CTG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894913
13	NC_004606	GAA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894913
14	NC_004606	ATCA	2	8	508	515	50 %	25 %	0 %	25 %	28894913
15	NC_004606	AGC	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894913
16	NC_004606	TGC	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894913
17	NC_004606	TTA	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894913
18	NC_004606	AT	3	6	768	773	50 %	50 %	0 %	0 %	28894913
19	NC_004606	TTA	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894913
20	NC_004606	GAAA	2	8	837	844	75 %	0 %	25 %	0 %	28894913
21	NC_004606	TGA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894913
22	NC_004606	A	7	7	895	901	100 %	0 %	0 %	0 %	28894913
23	NC_004606	CT	3	6	904	909	0 %	50 %	0 %	50 %	28894913
24	NC_004606	AAG	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894913
25	NC_004606	ATA	3	9	950	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894913
26	NC_004606	ACAA	2	8	959	966	75 %	0 %	0 %	25 %	28894913
27	NC_004606	ATC	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894913
28	NC_004606	AGA	2	6	1011	1016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894913
29	NC_004606	CCT	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28894913
30	NC_004606	CAAA	2	8	1224	1231	75 %	0 %	0 %	25 %	28894913
31	NC_004606	TGC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894913
32	NC_004606	GAA	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894913
33	NC_004606	CTA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894913
34	NC_004606	TGG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894913
35	NC_004606	TAA	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894913
36	NC_004606	A	6	6	1569	1574	100 %	0 %	0 %	0 %	28894913
37	NC_004606	AAC	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_004606	TC	3	6	1656	1661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_004606	TTTA	2	8	1663	1670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004606	TA	3	6	1682	1687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004606	CTA	4	12	1696	1707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_004606	TTA	3	9	1709	1717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004606	TTA	2	6	1721	1726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004606	ATT	2	6	1768	1773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
45	NC_004606	TCA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894914
46	NC_004606	GTAA	2	8	1919	1926	50 %	25 %	25 %	0 %	28894914
47	NC_004606	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
48	NC_004606	T	7	7	1981	1987	0 %	100 %	0 %	0 %	28894914
49	NC_004606	ATT	2	6	1994	1999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
50	NC_004606	AAC	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894914
51	NC_004606	GTT	2	6	2051	2056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894914
52	NC_004606	AAG	2	6	2121	2126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894914
53	NC_004606	ATT	2	6	2161	2166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
54	NC_004606	TAT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
55	NC_004606	GTC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894914
56	NC_004606	GACT	2	8	2278	2285	25 %	25 %	25 %	25 %	28894914
57	NC_004606	CAG	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894914
58	NC_004606	GA	3	6	2365	2370	50 %	0 %	50 %	0 %	28894914
59	NC_004606	CAG	2	6	2376	2381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894914
60	NC_004606	GAT	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894914
61	NC_004606	TTA	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
62	NC_004606	GTT	2	6	2531	2536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894914
63	NC_004606	GGTAA	2	10	2666	2675	40 %	20 %	40 %	0 %	28894914
64	NC_004606	AGTC	2	8	2696	2703	25 %	25 %	25 %	25 %	28894914
65	NC_004606	GAA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894914
66	NC_004606	AATT	2	8	2850	2857	50 %	50 %	0 %	0 %	28894914
67	NC_004606	TAAG	2	8	2876	2883	50 %	25 %	25 %	0 %	28894914
68	NC_004606	T	7	7	2904	2910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004606	TTA	2	6	2912	2917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004606	ATA	2	6	2930	2935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004606	TGAAA	2	10	2976	2985	60 %	20 %	20 %	0 %	28894915
72	NC_004606	A	6	6	2983	2988	100 %	0 %	0 %	0 %	28894915
73	NC_004606	ATG	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894915
74	NC_004606	A	7	7	3129	3135	100 %	0 %	0 %	0 %	28894915
75	NC_004606	TAAA	2	8	3160	3167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004606	A	6	6	3202	3207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004606	AGA	2	6	3253	3258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004606	AAT	2	6	3331	3336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004606	TCT	2	6	3403	3408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_004606	TCT	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_004606	T	6	6	3432	3437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004606	TAA	2	6	3442	3447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004606	TTGA	2	8	3450	3457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004606	CAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894916
85	NC_004606	GCT	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894916
86	NC_004606	TGGTA	2	10	3602	3611	20 %	40 %	40 %	0 %	28894916
87	NC_004606	A	7	7	3660	3666	100 %	0 %	0 %	0 %	28894916
88	NC_004606	AAAT	2	8	3740	3747	75 %	25 %	0 %	0 %	28894916
89	NC_004606	TGA	3	9	3800	3808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894916
90	NC_004606	TCAA	2	8	3906	3913	50 %	25 %	0 %	25 %	28894916
91	NC_004606	A	6	6	3934	3939	100 %	0 %	0 %	0 %	28894916
92	NC_004606	GTT	2	6	4062	4067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894916
93	NC_004606	AAC	2	6	4085	4090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894916
94	NC_004606	CAAA	2	8	4160	4167	75 %	0 %	0 %	25 %	28894916
95	NC_004606	AGT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894916
96	NC_004606	AGA	3	9	4223	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894916
97	NC_004606	AGA	2	6	4259	4264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894916
98	NC_004606	AGC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894916
99	NC_004606	ATC	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894916
100	NC_004606	CAG	2	6	4354	4359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894916
101	NC_004606	GCT	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894916
102	NC_004606	TAT	2	6	4421	4426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894916
103	NC_004606	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894916
104	NC_004606	AAG	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894916
105	NC_004606	GAA	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894916
106	NC_004606	TGT	2	6	4550	4555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894916
107	NC_004606	CAT	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894916
108	NC_004606	GAA	2	6	4623	4628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004606	TTG	2	6	4678	4683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894917
110	NC_004606	A	6	6	4711	4716	100 %	0 %	0 %	0 %	28894917
111	NC_004606	GAT	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894917
112	NC_004606	TTA	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894917
113	NC_004606	CTA	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894917
114	NC_004606	AAT	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894917
115	NC_004606	CTA	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894917
116	NC_004606	ATG	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894917
117	NC_004606	TTACGT	2	12	4968	4979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28894917
118	NC_004606	CAG	2	6	4990	4995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894917
119	NC_004606	GAC	2	6	5071	5076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894917
120	NC_004606	TTA	2	6	5095	5100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894917
121	NC_004606	ATA	2	6	5131	5136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894917
122	NC_004606	TTTA	2	8	5182	5189	25 %	75 %	0 %	0 %	28894917
123	NC_004606	A	6	6	5206	5211	100 %	0 %	0 %	0 %	28894917
124	NC_004606	ATT	2	6	5251	5256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894918
125	NC_004606	ACC	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28894918
126	NC_004606	GAT	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
127	NC_004606	A	9	9	5379	5387	100 %	0 %	0 %	0 %	28894918
128	NC_004606	TGA	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
129	NC_004606	T	6	6	5474	5479	0 %	100 %	0 %	0 %	28894918
130	NC_004606	TGA	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
131	NC_004606	T	6	6	5819	5824	0 %	100 %	0 %	0 %	28894918
132	NC_004606	GAT	2	6	5828	5833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
133	NC_004606	AAC	2	6	5880	5885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894918
134	NC_004606	TTA	2	6	5898	5903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894918
135	NC_004606	GAT	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
136	NC_004606	A	6	6	5993	5998	100 %	0 %	0 %	0 %	28894918
137	NC_004606	AGA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894918
138	NC_004606	A	6	6	6028	6033	100 %	0 %	0 %	0 %	28894918
139	NC_004606	ATT	2	6	6070	6075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894918
140	NC_004606	ATT	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894918
141	NC_004606	T	6	6	6128	6133	0 %	100 %	0 %	0 %	28894918
142	NC_004606	GAT	2	6	6134	6139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
143	NC_004606	GATTT	2	10	6168	6177	20 %	60 %	20 %	0 %	28894918
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147	NC_004606	T	6	6	6368	6373	0 %	100 %	0 %	0 %	28894918
148	NC_004606	TTGA	2	8	6389	6396	25 %	50 %	25 %	0 %	28894918
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152	NC_004606	CCTT	2	8	6502	6509	0 %	50 %	0 %	50 %	28894918
153	NC_004606	AGTG	2	8	6511	6518	25 %	25 %	50 %	0 %	28894918
154	NC_004606	TGA	2	6	6586	6591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
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166	NC_004606	TGA	3	9	7048	7056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
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168	NC_004606	TAG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
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174	NC_004606	TGAT	2	8	7449	7456	25 %	50 %	25 %	0 %	28894918
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270	NC_004606	A	6	6	11276	11281	100 %	0 %	0 %	0 %	28894923
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274	NC_004606	A	6	6	11441	11446	100 %	0 %	0 %	0 %	28894923
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409	NC_004606	TAA	2	6	16830	16835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_004606	A	6	6	16870	16875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_004606	TAA	2	6	19031	19036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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