MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 chromosome

Total Repeats: 60846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004461	AC	3	6	81	86	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_004461	AAC	2	6	102	107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004461	ATTT	2	8	189	196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004461	TA	3	6	205	210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004461	ATT	2	6	278	283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004461	ATT	2	6	295	300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004461	AAGA	2	8	343	350	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004461	TTAT	2	8	356	363	25 %	75 %	0 %	0 %	27466919
9	NC_004461	AGAA	2	8	369	376	75 %	0 %	25 %	0 %	27466919
10	NC_004461	TAT	2	6	550	555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466919
11	NC_004461	ATG	2	6	558	563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466919
12	NC_004461	AGA	2	6	598	603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466919
13	NC_004461	ACA	2	6	618	623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466919
14	NC_004461	AAG	2	6	636	641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466919
15	NC_004461	ACA	2	6	658	663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466919
16	NC_004461	TTC	2	6	664	669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27466919
17	NC_004461	GAT	2	6	674	679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466919
18	NC_004461	TGC	2	6	760	765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466919
19	NC_004461	ATT	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466919
20	NC_004461	TA	3	6	814	819	50 %	50 %	0 %	0 %	27466919
21	NC_004461	ATGC	2	8	851	858	25 %	25 %	25 %	25 %	27466919
22	NC_004461	CAA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466919
23	NC_004461	TTA	2	6	936	941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466919
24	NC_004461	TGA	2	6	1009	1014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466919
25	NC_004461	ATTCA	2	10	1016	1025	40 %	40 %	0 %	20 %	27466919
26	NC_004461	AAG	2	6	1047	1052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466919
27	NC_004461	TTC	2	6	1055	1060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27466919
28	NC_004461	ATA	2	6	1086	1091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27466919
29	NC_004461	CCA	2	6	1118	1123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27466919
30	NC_004461	GAA	3	9	1238	1246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466919
31	NC_004461	CCAA	2	8	1284	1291	50 %	0 %	0 %	50 %	27466919
32	NC_004461	TCAA	2	8	1294	1301	50 %	25 %	0 %	25 %	27466919
33	NC_004461	A	6	6	1499	1504	100 %	0 %	0 %	0 %	27466919
34	NC_004461	TATC	2	8	1544	1551	25 %	50 %	0 %	25 %	27466919
35	NC_004461	GAA	2	6	1589	1594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466919
36	NC_004461	ACA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466919
37	NC_004461	AAG	2	6	1677	1682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466919
38	NC_004461	AAAT	2	8	1722	1729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004461	AAT	2	6	1779	1784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004461	A	6	6	1866	1871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004461	ACA	2	6	1878	1883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_004461	T	6	6	1926	1931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004461	CCA	2	6	1940	1945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_004461	CTA	3	9	1957	1965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_004461	TA	3	6	1985	1990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004461	TA	4	8	1993	2000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004461	ATG	2	6	2026	2031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466920
48	NC_004461	ATT	2	6	2051	2056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466920
49	NC_004461	TTA	2	6	2057	2062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466920
50	NC_004461	AAC	2	6	2100	2105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466920
51	NC_004461	GAA	2	6	2218	2223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466920
52	NC_004461	TTG	2	6	2225	2230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27466920
53	NC_004461	TTC	2	6	2269	2274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27466920
54	NC_004461	ATT	2	6	2281	2286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466920
55	NC_004461	A	6	6	2287	2292	100 %	0 %	0 %	0 %	27466920
56	NC_004461	AAG	2	6	2303	2308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466920
57	NC_004461	ATT	2	6	2400	2405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466920
58	NC_004461	A	6	6	2454	2459	100 %	0 %	0 %	0 %	27466920
59	NC_004461	TACT	2	8	2510	2517	25 %	50 %	0 %	25 %	27466920
60	NC_004461	AGA	2	6	2601	2606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466920
61	NC_004461	TCA	2	6	2627	2632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27466920
62	NC_004461	CGA	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27466920
63	NC_004461	GATATT	2	12	2686	2697	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27466920
64	NC_004461	TTA	2	6	2863	2868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466920
65	NC_004461	TTA	2	6	2891	2896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466920
66	NC_004461	AGA	2	6	2961	2966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466920
67	NC_004461	ATG	2	6	2978	2983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466920
68	NC_004461	TTTC	2	8	3005	3012	0 %	75 %	0 %	25 %	27466920
69	NC_004461	ATG	2	6	3025	3030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466920
70	NC_004461	ATG	2	6	3053	3058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466920
71	NC_004461	AAGTAG	2	12	3059	3070	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27466920
72	NC_004461	GAT	3	9	3112	3120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466920
73	NC_004461	AATT	2	8	3131	3138	50 %	50 %	0 %	0 %	27466920
74	NC_004461	TAA	2	6	3157	3162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27466920
75	NC_004461	TTG	2	6	3222	3227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004461	T	6	6	3235	3240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004461	AATT	2	8	3314	3321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004461	AAT	2	6	3349	3354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004461	TATT	2	8	3369	3376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004461	TTTAAA	2	12	3406	3417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004461	GTAA	2	8	3443	3450	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004461	GTA	2	6	3463	3468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004461	ATAAA	2	10	3476	3485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004461	AT	4	8	3486	3493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004461	A	6	6	3538	3543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004461	AT	3	6	3551	3556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004461	AAG	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004461	TTG	2	6	3602	3607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004461	TAAT	2	8	3704	3711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004461	A	6	6	3736	3741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004461	ATC	2	6	3802	3807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_004461	A	6	6	4086	4091	100 %	0 %	0 %	0 %	27466921
93	NC_004461	ATC	2	6	4111	4116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27466921
94	NC_004461	AT	3	6	4139	4144	50 %	50 %	0 %	0 %	27466921
95	NC_004461	GTC	2	6	4158	4163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466921
96	NC_004461	CAC	2	6	4201	4206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27466921
97	NC_004461	CGA	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27466921
98	NC_004461	CTG	2	6	4249	4254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466921
99	NC_004461	AGA	2	6	4333	4338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466921
100	NC_004461	ACA	2	6	4344	4349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466921
101	NC_004461	CAA	2	6	4368	4373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466921
102	NC_004461	TTG	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27466921
103	NC_004461	GTTAC	2	10	4395	4404	20 %	40 %	20 %	20 %	27466921
104	NC_004461	GACACT	2	12	4478	4489	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27466921
105	NC_004461	CAAT	2	8	4529	4536	50 %	25 %	0 %	25 %	27466921
106	NC_004461	GAA	2	6	4548	4553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466921
107	NC_004461	TGA	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466921
108	NC_004461	GAT	2	6	4770	4775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466921
109	NC_004461	TGAG	2	8	4780	4787	25 %	25 %	50 %	0 %	27466921
110	NC_004461	TGA	2	6	4790	4795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466921
111	NC_004461	AAT	2	6	4883	4888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27466921
112	NC_004461	ACA	2	6	4973	4978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466922
113	NC_004461	GTAT	2	8	5045	5052	25 %	50 %	25 %	0 %	27466922
114	NC_004461	TTG	2	6	5099	5104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27466922
115	NC_004461	ATA	2	6	5105	5110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27466922
116	NC_004461	CTG	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466922
117	NC_004461	GTT	2	6	5335	5340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27466922
118	NC_004461	ATC	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27466922
119	NC_004461	ACA	2	6	5506	5511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466922
120	NC_004461	GCTT	2	8	5550	5557	0 %	50 %	25 %	25 %	27466922
121	NC_004461	TAAA	2	8	5561	5568	75 %	25 %	0 %	0 %	27466922
122	NC_004461	AGA	2	6	5598	5603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466922
123	NC_004461	AGA	2	6	5613	5618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466922
124	NC_004461	TTA	2	6	5659	5664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466922
125	NC_004461	TA	4	8	5697	5704	50 %	50 %	0 %	0 %	27466922
126	NC_004461	GAT	2	6	5719	5724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466922
127	NC_004461	CAAC	2	8	5765	5772	50 %	0 %	0 %	50 %	27466922
128	NC_004461	TTA	2	6	5773	5778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466922
129	NC_004461	AAT	2	6	5788	5793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27466922
130	NC_004461	CATA	2	8	5797	5804	50 %	25 %	0 %	25 %	27466922
131	NC_004461	GGT	2	6	5809	5814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27466922
132	NC_004461	ATT	2	6	5881	5886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466922
133	NC_004461	CAG	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27466922
134	NC_004461	GTT	2	6	6019	6024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27466922
135	NC_004461	ATT	2	6	6030	6035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466922
136	NC_004461	ATT	2	6	6085	6090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466922
137	NC_004461	TAT	2	6	6102	6107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466922
138	NC_004461	A	6	6	6133	6138	100 %	0 %	0 %	0 %	27466922
139	NC_004461	CGT	2	6	6154	6159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466922
140	NC_004461	GAA	2	6	6223	6228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466922
141	NC_004461	G	6	6	6262	6267	0 %	0 %	100 %	0 %	27466922
142	NC_004461	CTA	2	6	6269	6274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27466922
143	NC_004461	GGA	2	6	6412	6417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27466922
144	NC_004461	AT	3	6	6425	6430	50 %	50 %	0 %	0 %	27466922
145	NC_004461	TACG	2	8	6491	6498	25 %	25 %	25 %	25 %	27466922
146	NC_004461	TTA	2	6	6499	6504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466922
147	NC_004461	TTC	2	6	6511	6516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27466922
148	NC_004461	GCC	2	6	6567	6572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27466922
149	NC_004461	TA	3	6	6575	6580	50 %	50 %	0 %	0 %	27466922
150	NC_004461	GTA	2	6	6817	6822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466922
151	NC_004461	TGAAC	2	10	6886	6895	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_004461	AGG	2	6	6902	6907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_004461	TCAA	2	8	6930	6937	50 %	25 %	0 %	25 %	27466923
154	NC_004461	CTATG	2	10	6987	6996	20 %	40 %	20 %	20 %	27466923
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156	NC_004461	TTC	2	6	7164	7169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27466923
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163	NC_004461	TAAG	2	8	7508	7515	50 %	25 %	25 %	0 %	27466923
164	NC_004461	TCG	2	6	7605	7610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466923
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168	NC_004461	AGTT	2	8	7751	7758	25 %	50 %	25 %	0 %	27466923
169	NC_004461	TGA	2	6	7794	7799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466923
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172	NC_004461	CAT	2	6	7901	7906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27466923
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174	NC_004461	A	6	6	7991	7996	100 %	0 %	0 %	0 %	27466923
175	NC_004461	GAC	2	6	8006	8011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27466923
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177	NC_004461	TGA	2	6	8088	8093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466923
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220	NC_004461	T	6	6	9789	9794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_004461	TGTA	2	8	11156	11163	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_004461	AG	3	6	11390	11395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_004461	TAA	2	6	11462	11467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_004461	GTT	2	6	11520	11525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_004461	T	7	7	11574	11580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_004461	AT	3	6	11616	11621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_004461	TTTA	2	8	11662	11669	25 %	75 %	0 %	0 %	27466925
264	NC_004461	CGA	2	6	11713	11718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27466925
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269	NC_004461	TGA	2	6	11854	11859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466925
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271	NC_004461	ATA	2	6	11928	11933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27466925
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273	NC_004461	TGA	2	6	11998	12003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466925
274	NC_004461	A	6	6	12020	12025	100 %	0 %	0 %	0 %	27466925
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297	NC_004461	CA	3	6	13144	13149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
298	NC_004461	A	6	6	13161	13166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_004461	ATA	2	6	13211	13216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_004461	CAT	2	6	13362	13367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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406	NC_004461	TA	3	6	17233	17238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_004461	GTA	2	6	17285	17290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
408	NC_004461	CTTTA	2	10	17294	17303	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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411	NC_004461	AGT	2	6	17421	17426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466930
412	NC_004461	ACA	2	6	17557	17562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466930
413	NC_004461	TTA	2	6	17563	17568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466930
414	NC_004461	ATG	2	6	17590	17595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466930
415	NC_004461	TTA	3	9	17605	17613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466930
416	NC_004461	TGGA	2	8	17706	17713	25 %	25 %	50 %	0 %	27466930
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419	NC_004461	ATGCA	2	10	17774	17783	40 %	20 %	20 %	20 %	27466930
420	NC_004461	TTAA	2	8	17902	17909	50 %	50 %	0 %	0 %	27466930
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427	NC_004461	TTG	2	6	18218	18223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27466930
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433	NC_004461	GTC	2	6	18380	18385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466931
434	NC_004461	TGA	2	6	18441	18446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466931
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441	NC_004461	TAGAAA	2	12	18705	18716	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27466931
442	NC_004461	ACA	2	6	18717	18722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466931
443	NC_004461	ATT	2	6	18723	18728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466931
444	NC_004461	CTT	2	6	18769	18774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27466931
445	NC_004461	ACTGAA	2	12	18782	18793	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	27466931
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452	NC_004461	TGG	2	6	19225	19230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27466931
453	NC_004461	AAT	2	6	19397	19402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27466931
454	NC_004461	CGT	2	6	19451	19456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466931
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462	NC_004461	TATG	2	8	19774	19781	25 %	50 %	25 %	0 %	27466931
463	NC_004461	TAT	2	6	19786	19791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466931
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479	NC_004461	ACA	2	6	20445	20450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466932
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482	NC_004461	A	7	7	20577	20583	100 %	0 %	0 %	0 %	27466932
483	NC_004461	AAG	2	6	20675	20680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466932
484	NC_004461	AAT	2	6	20714	20719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27466932
485	NC_004461	TAT	2	6	20754	20759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_004461	TA	3	6	20769	20774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_004461	ATAAA	2	10	20847	20856	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_004461	ATGG	2	8	20889	20896	25 %	25 %	50 %	0 %	27466933
489	NC_004461	ATT	2	6	20958	20963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466933
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493	NC_004461	TGT	2	6	21086	21091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27466933
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497	NC_004461	AATTAG	2	12	21286	21297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27466933
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499	NC_004461	TCT	2	6	21339	21344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27466933
500	NC_004461	AGA	2	6	21407	21412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466933

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