MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae NEM316

Total Repeats: 49573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49501	NC_004368	A	7	7	2208453	2208459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49502	NC_004368	GCCT	2	8	2208501	2208508	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49503	NC_004368	CTG	2	6	2208599	2208604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49504	NC_004368	TAGA	2	8	2208624	2208631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49505	NC_004368	GTT	2	6	2208661	2208666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49506	NC_004368	ATT	2	6	2208681	2208686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25012167
49507	NC_004368	TGA	2	6	2208758	2208763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25012167
49508	NC_004368	AAT	2	6	2208792	2208797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25012167
49509	NC_004368	T	6	6	2208805	2208810	0 %	100 %	0 %	0 %	25012167
49510	NC_004368	ACC	2	6	2208835	2208840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	25012167
49511	NC_004368	TAG	2	6	2208855	2208860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25012167
49512	NC_004368	T	6	6	2208876	2208881	0 %	100 %	0 %	0 %	25012167
49513	NC_004368	TCA	2	6	2209040	2209045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25012167
49514	NC_004368	CTT	2	6	2209107	2209112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25012167
49515	NC_004368	ATT	2	6	2209145	2209150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25012167
49516	NC_004368	CTATAA	2	12	2209245	2209256	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49517	NC_004368	T	7	7	2209288	2209294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49518	NC_004368	AAG	2	6	2209313	2209318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49519	NC_004368	A	9	9	2209365	2209373	100 %	0 %	0 %	0 %	25012168
49520	NC_004368	TCA	2	6	2209380	2209385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25012168
49521	NC_004368	ATT	2	6	2209407	2209412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25012168
49522	NC_004368	TGG	2	6	2209424	2209429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	25012168
49523	NC_004368	TGG	2	6	2209475	2209480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	25012168
49524	NC_004368	AGTAA	2	10	2209494	2209503	60 %	20 %	20 %	0 %	25012168
49525	NC_004368	TAA	2	6	2209508	2209513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25012168
49526	NC_004368	ACA	2	6	2209524	2209529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25012168
49527	NC_004368	GTT	2	6	2209557	2209562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25012168
49528	NC_004368	ACA	2	6	2209580	2209585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25012168
49529	NC_004368	AG	3	6	2209586	2209591	50 %	0 %	50 %	0 %	25012168
49530	NC_004368	T	7	7	2209622	2209628	0 %	100 %	0 %	0 %	25012168
49531	NC_004368	G	6	6	2209637	2209642	0 %	0 %	100 %	0 %	25012168
49532	NC_004368	A	6	6	2209695	2209700	100 %	0 %	0 %	0 %	25012168
49533	NC_004368	TGT	2	6	2209718	2209723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25012168
49534	NC_004368	TAA	2	6	2209727	2209732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25012168
49535	NC_004368	TTG	2	6	2209801	2209806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25012168
49536	NC_004368	CGT	2	6	2209832	2209837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25012168
49537	NC_004368	TCA	2	6	2209884	2209889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25012168
49538	NC_004368	GAA	2	6	2210007	2210012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25012168
49539	NC_004368	TGC	2	6	2210048	2210053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25012168
49540	NC_004368	AATT	2	8	2210111	2210118	50 %	50 %	0 %	0 %	25012168
49541	NC_004368	TCT	2	6	2210130	2210135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25012168
49542	NC_004368	ATCAA	2	10	2210138	2210147	60 %	20 %	0 %	20 %	25012168
49543	NC_004368	ATG	2	6	2210206	2210211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25012168
49544	NC_004368	ATCA	2	8	2210223	2210230	50 %	25 %	0 %	25 %	25012168
49545	NC_004368	AG	3	6	2210252	2210257	50 %	0 %	50 %	0 %	25012168
49546	NC_004368	TTA	2	6	2210308	2210313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25012168
49547	NC_004368	GTA	2	6	2210352	2210357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25012168
49548	NC_004368	AGT	2	6	2210435	2210440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25012168
49549	NC_004368	CCA	2	6	2210474	2210479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	25012168
49550	NC_004368	GTG	2	6	2210512	2210517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	25012168
49551	NC_004368	AAAC	2	8	2210523	2210530	75 %	0 %	0 %	25 %	25012168
49552	NC_004368	AAC	2	6	2210572	2210577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25012168
49553	NC_004368	ATCA	2	8	2210713	2210720	50 %	25 %	0 %	25 %	25012169
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49559	NC_004368	TGA	2	6	2210937	2210942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25012169
49560	NC_004368	AAAAG	2	10	2211029	2211038	80 %	0 %	20 %	0 %	25012169
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49562	NC_004368	TA	3	6	2211085	2211090	50 %	50 %	0 %	0 %	25012169
49563	NC_004368	ATACG	2	10	2211095	2211104	40 %	20 %	20 %	20 %	25012169
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49572	NC_004368	ATT	2	6	2211471	2211476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49573	NC_004368	T	7	7	2211475	2211481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.