MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus mutans UA159 chromosome

Total Repeats: 44921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004350	CAG	2	6	21944	21949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_004350	AGT	2	6	21970	21975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_004350	GTC	2	6	22001	22006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_004350	TTAG	2	8	22111	22118	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_004350	GTG	2	6	22126	22131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_004350	AG	3	6	22206	22211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_004350	ATC	2	6	22214	22219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_004350	TCA	2	6	22290	22295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_004350	CGT	2	6	22534	22539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_004350	AGG	2	6	22547	22552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_004350	ATAA	2	8	22637	22644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_004350	ATT	2	6	22851	22856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_004350	CGC	2	6	22923	22928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_004350	ATTA	2	8	22934	22941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_004350	GGA	2	6	23042	23047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_004350	GCGT	2	8	23101	23108	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
517	NC_004350	TCC	2	6	23125	23130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_004350	TCG	2	6	23168	23173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_004350	CGG	2	6	23274	23279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_004350	TGT	2	6	23345	23350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_004350	CTTTT	2	10	23375	23384	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
522	NC_004350	GGT	2	6	23460	23465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_004350	AT	4	8	23484	23491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_004350	GTA	2	6	23581	23586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_004350	TG	3	6	23627	23632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_004350	GATGA	2	10	23640	23649	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
527	NC_004350	A	7	7	23649	23655	100 %	0 %	0 %	0 %	24378548
528	NC_004350	TAT	2	6	23692	23697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378548
529	NC_004350	T	8	8	23716	23723	0 %	100 %	0 %	0 %	24378548
530	NC_004350	TTA	2	6	23740	23745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378548
531	NC_004350	GTT	2	6	23775	23780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378548
532	NC_004350	TGA	2	6	23789	23794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378548
533	NC_004350	ATA	2	6	23824	23829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378548
534	NC_004350	AG	3	6	23912	23917	50 %	0 %	50 %	0 %	24378548
535	NC_004350	AGA	2	6	23924	23929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378548
536	NC_004350	GTTC	2	8	24006	24013	0 %	50 %	25 %	25 %	24378548
537	NC_004350	AT	3	6	24031	24036	50 %	50 %	0 %	0 %	24378548
538	NC_004350	A	6	6	24053	24058	100 %	0 %	0 %	0 %	24378548
539	NC_004350	A	6	6	24071	24076	100 %	0 %	0 %	0 %	24378548
540	NC_004350	TGA	2	6	24173	24178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378548
541	NC_004350	CCT	3	9	24274	24282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24378548
542	NC_004350	ACA	2	6	24309	24314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378548
543	NC_004350	GT	3	6	24343	24348	0 %	50 %	50 %	0 %	24378548
544	NC_004350	GAA	2	6	24369	24374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378548
545	NC_004350	AAT	2	6	24375	24380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378548
546	NC_004350	TAG	2	6	24451	24456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378548
547	NC_004350	ATT	2	6	24486	24491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378549
548	NC_004350	TAT	2	6	24542	24547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378549
549	NC_004350	T	6	6	24588	24593	0 %	100 %	0 %	0 %	24378549
550	NC_004350	TTATT	2	10	24633	24642	20 %	80 %	0 %	0 %	24378549
551	NC_004350	ATT	2	6	24667	24672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378549
552	NC_004350	TAT	2	6	24682	24687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378549
553	NC_004350	TA	3	6	24695	24700	50 %	50 %	0 %	0 %	24378549
554	NC_004350	TGT	2	6	24719	24724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378549
555	NC_004350	TTA	2	6	24740	24745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378549
556	NC_004350	T	8	8	24797	24804	0 %	100 %	0 %	0 %	24378549
557	NC_004350	T	6	6	24814	24819	0 %	100 %	0 %	0 %	24378549
558	NC_004350	CCTT	2	8	24904	24911	0 %	50 %	0 %	50 %	24378549
559	NC_004350	TCT	2	6	24935	24940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24378549
560	NC_004350	TAAA	2	8	24993	25000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_004350	TAA	2	6	25005	25010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_004350	AT	3	6	25018	25023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_004350	T	8	8	25031	25038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_004350	A	7	7	25085	25091	100 %	0 %	0 %	0 %	24378550
565	NC_004350	CAG	2	6	25101	25106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378550
566	NC_004350	AGTG	2	8	25111	25118	25 %	25 %	50 %	0 %	24378550
567	NC_004350	ACA	2	6	25139	25144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378550
568	NC_004350	TGA	2	6	25162	25167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378550
569	NC_004350	CAA	2	6	25204	25209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378550
570	NC_004350	AGCA	2	8	25224	25231	50 %	0 %	25 %	25 %	24378550
571	NC_004350	GCACAA	2	12	25232	25243	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	24378550
572	NC_004350	AAGT	2	8	25263	25270	50 %	25 %	25 %	0 %	24378550
573	NC_004350	ACA	2	6	25282	25287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378550
574	NC_004350	CAA	2	6	25343	25348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378550
575	NC_004350	TTG	2	6	25371	25376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378550
576	NC_004350	CAA	2	6	25397	25402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378550
577	NC_004350	A	6	6	25416	25421	100 %	0 %	0 %	0 %	24378550
578	NC_004350	A	6	6	25524	25529	100 %	0 %	0 %	0 %	24378550
579	NC_004350	CAA	3	9	25535	25543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378550
580	NC_004350	AGC	2	6	25555	25560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378550
581	NC_004350	CAA	2	6	25574	25579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378550
582	NC_004350	AGC	2	6	25588	25593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378550
583	NC_004350	AGC	2	6	25672	25677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378550
584	NC_004350	ACT	2	6	25703	25708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378550
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587	NC_004350	GCA	2	6	25790	25795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378550
588	NC_004350	GCA	2	6	25808	25813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378550
589	NC_004350	AGC	2	6	25837	25842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378550
590	NC_004350	CAAGCA	2	12	25844	25855	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	24378550
591	NC_004350	GCA	3	9	25853	25861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378550
592	NC_004350	AAT	3	9	25862	25870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378550
593	NC_004350	CAA	2	6	25895	25900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378550
594	NC_004350	AGC	2	6	25924	25929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378550
595	NC_004350	CAG	2	6	25956	25961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378550
596	NC_004350	AAT	2	6	25973	25978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378550
597	NC_004350	TAC	2	6	25993	25998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378550
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599	NC_004350	AGC	2	6	26047	26052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378550
600	NC_004350	CTT	2	6	26058	26063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24378550
601	NC_004350	CAG	2	6	26079	26084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378550
602	NC_004350	ACT	2	6	26130	26135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378550
603	NC_004350	TGG	2	6	26143	26148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24378550
604	NC_004350	GCA	2	6	26156	26161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378550
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606	NC_004350	AGCTGT	2	12	26209	26220	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	24378550
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610	NC_004350	TATC	2	8	26362	26369	25 %	50 %	0 %	25 %	24378550
611	NC_004350	TATCT	2	10	26403	26412	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
612	NC_004350	TCA	2	6	26431	26436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_004350	ATT	2	6	26452	26457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_004350	GGA	2	6	26493	26498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_004350	CAAA	2	8	26539	26546	75 %	0 %	0 %	25 %	24378551
616	NC_004350	GAA	2	6	26640	26645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378551
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618	NC_004350	TTA	2	6	26777	26782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378551
619	NC_004350	AGTT	2	8	26836	26843	25 %	50 %	25 %	0 %	24378551
620	NC_004350	TGCT	2	8	26851	26858	0 %	50 %	25 %	25 %	24378551
621	NC_004350	TGCA	2	8	26893	26900	25 %	25 %	25 %	25 %	24378551
622	NC_004350	T	7	7	26915	26921	0 %	100 %	0 %	0 %	24378551
623	NC_004350	ATT	2	6	26965	26970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378551
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629	NC_004350	ACG	2	6	27089	27094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378551
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892	NC_004350	A	7	7	38967	38973	100 %	0 %	0 %	0 %	24378562
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