MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004347	TA	3	6	22	27	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004347	TCT	2	6	30	35	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004347	TAT	2	6	36	41	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004347	AATC	2	8	111	118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_004347	ATG	2	6	201	206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004347	ATA	2	6	236	241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004347	T	6	6	272	277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004347	GTT	2	6	304	309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004347	AGA	2	6	326	331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004347	TCT	2	6	377	382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371601
11	NC_004347	TTG	2	6	394	399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371601
12	NC_004347	GTGG	2	8	604	611	0 %	25 %	75 %	0 %	24371601
13	NC_004347	TA	3	6	721	726	50 %	50 %	0 %	0 %	24371601
14	NC_004347	GCT	2	6	730	735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371601
15	NC_004347	GGT	2	6	742	747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371601
16	NC_004347	CT	3	6	783	788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_004347	TGT	2	6	841	846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004347	T	6	6	924	929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004347	TAT	2	6	1001	1006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371602
20	NC_004347	GAG	2	6	1098	1103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24371602
21	NC_004347	GT	3	6	1150	1155	0 %	50 %	50 %	0 %	24371602
22	NC_004347	T	7	7	1193	1199	0 %	100 %	0 %	0 %	24371602
23	NC_004347	AATAC	2	10	1204	1213	60 %	20 %	0 %	20 %	24371602
24	NC_004347	TGG	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371602
25	NC_004347	CTT	2	6	1436	1441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371602
26	NC_004347	CAT	2	6	1444	1449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371602
27	NC_004347	TGC	2	6	1481	1486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371602
28	NC_004347	TACA	2	8	1557	1564	50 %	25 %	0 %	25 %	24371602
29	NC_004347	GCC	2	6	1568	1573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371602
30	NC_004347	T	6	6	1595	1600	0 %	100 %	0 %	0 %	24371602
31	NC_004347	TGT	2	6	1737	1742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371602
32	NC_004347	TTG	2	6	1765	1770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371602
33	NC_004347	TGC	2	6	1820	1825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371602
34	NC_004347	TTC	2	6	1846	1851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371602
35	NC_004347	GAT	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371602
36	NC_004347	TGT	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371602
37	NC_004347	TAA	2	6	2015	2020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371602
38	NC_004347	CTGCG	2	10	2065	2074	0 %	20 %	40 %	40 %	24371602
39	NC_004347	TGG	2	6	2119	2124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371602
40	NC_004347	TGA	2	6	2137	2142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371602
41	NC_004347	TGG	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371602
42	NC_004347	TCT	2	6	2167	2172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371602
43	NC_004347	TTAC	2	8	2193	2200	25 %	50 %	0 %	25 %	24371602
44	NC_004347	TAT	2	6	2276	2281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371602
45	NC_004347	CT	3	6	2293	2298	0 %	50 %	0 %	50 %	24371602
46	NC_004347	CGGT	2	8	2305	2312	0 %	25 %	50 %	25 %	24371602
47	NC_004347	TTGC	2	8	2325	2332	0 %	50 %	25 %	25 %	24371602
48	NC_004347	A	6	6	2539	2544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004347	T	6	6	2561	2566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004347	TTAC	2	8	2589	2596	25 %	50 %	0 %	25 %	414561717
51	NC_004347	TTC	2	6	2688	2693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561717
52	NC_004347	TTC	2	6	2907	2912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561717
53	NC_004347	TTA	2	6	2947	2952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561717
54	NC_004347	TGG	2	6	2975	2980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561717
55	NC_004347	GTT	2	6	3031	3036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561717
56	NC_004347	ATAA	2	8	3049	3056	75 %	25 %	0 %	0 %	414561717
57	NC_004347	GC	3	6	3088	3093	0 %	0 %	50 %	50 %	414561717
58	NC_004347	ATA	2	6	3148	3153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561717
59	NC_004347	GAC	2	6	3281	3286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561717
60	NC_004347	CAC	2	6	3294	3299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561717
61	NC_004347	CTTG	2	8	3326	3333	0 %	50 %	25 %	25 %	414561717
62	NC_004347	GAT	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561717
63	NC_004347	CTT	2	6	3413	3418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561717
64	NC_004347	GGC	2	6	3435	3440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561717
65	NC_004347	CCA	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561717
66	NC_004347	GC	3	6	3521	3526	0 %	0 %	50 %	50 %	414561717
67	NC_004347	CCG	2	6	3697	3702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561717
68	NC_004347	AAT	2	6	3809	3814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561717
69	NC_004347	TCG	2	6	3863	3868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561717
70	NC_004347	ATC	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_004347	GGC	2	6	3993	3998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_004347	GCC	2	6	4006	4011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_004347	T	6	6	4070	4075	0 %	100 %	0 %	0 %	24371604
74	NC_004347	ATAA	2	8	4088	4095	75 %	25 %	0 %	0 %	24371604
75	NC_004347	TCT	2	6	4096	4101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371604
76	NC_004347	GAT	2	6	4106	4111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371604
77	NC_004347	GAA	2	6	4166	4171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371604
78	NC_004347	CAT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371604
79	NC_004347	TCT	2	6	4246	4251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371604
80	NC_004347	ATG	2	6	4254	4259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371604
81	NC_004347	CAG	2	6	4277	4282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371604
82	NC_004347	GTA	2	6	4292	4297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371604
83	NC_004347	CATAA	2	10	4326	4335	60 %	20 %	0 %	20 %	24371604
84	NC_004347	CTT	2	6	4445	4450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371604
85	NC_004347	CAT	2	6	4460	4465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371604
86	NC_004347	TCA	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371604
87	NC_004347	TGAT	2	8	4640	4647	25 %	50 %	25 %	0 %	24371604
88	NC_004347	ACC	2	6	4681	4686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371604
89	NC_004347	ACT	2	6	4704	4709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371604
90	NC_004347	CAC	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371604
91	NC_004347	TGG	2	6	4886	4891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371604
92	NC_004347	ACC	2	6	4934	4939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371604
93	NC_004347	TTGA	2	8	4949	4956	25 %	50 %	25 %	0 %	24371604
94	NC_004347	ACGC	2	8	4997	5004	25 %	0 %	25 %	50 %	24371604
95	NC_004347	GCG	2	6	5019	5024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371604
96	NC_004347	CAT	3	9	5039	5047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371604
97	NC_004347	GCT	2	6	5048	5053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371604
98	NC_004347	GTT	2	6	5120	5125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371604
99	NC_004347	TTGC	2	8	5262	5269	0 %	50 %	25 %	25 %	24371604
100	NC_004347	CTAT	2	8	5298	5305	25 %	50 %	0 %	25 %	24371604
101	NC_004347	TG	3	6	5401	5406	0 %	50 %	50 %	0 %	24371604
102	NC_004347	GCA	2	6	5415	5420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371604
103	NC_004347	CAC	2	6	5431	5436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371604
104	NC_004347	CTG	3	9	5503	5511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371604
105	NC_004347	AGT	2	6	5646	5651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371604
106	NC_004347	AT	3	6	5662	5667	50 %	50 %	0 %	0 %	24371604
107	NC_004347	TATT	2	8	5688	5695	25 %	75 %	0 %	0 %	24371605
108	NC_004347	G	6	6	5712	5717	0 %	0 %	100 %	0 %	24371605
109	NC_004347	CCG	2	6	5730	5735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371605
110	NC_004347	CAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371605
111	NC_004347	TGA	2	6	5872	5877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371605
112	NC_004347	GCG	2	6	5920	5925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371605
113	NC_004347	TTG	2	6	5957	5962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371606
114	NC_004347	TTTCCA	2	12	5973	5984	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	24371606
115	NC_004347	CAA	2	6	6006	6011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371606
116	NC_004347	TGT	2	6	6027	6032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371606
117	NC_004347	TTGA	2	8	6034	6041	25 %	50 %	25 %	0 %	24371606
118	NC_004347	CAGT	2	8	6114	6121	25 %	25 %	25 %	25 %	24371606
119	NC_004347	GCAA	2	8	6155	6162	50 %	0 %	25 %	25 %	24371606
120	NC_004347	CAG	2	6	6171	6176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371606
121	NC_004347	TTAA	2	8	6277	6284	50 %	50 %	0 %	0 %	24371607
122	NC_004347	ACG	3	9	6311	6319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371607
123	NC_004347	GCC	2	6	6335	6340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371607
124	NC_004347	ATG	2	6	6417	6422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371607
125	NC_004347	TTA	2	6	6437	6442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004347	A	6	6	6481	6486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004347	CAA	2	6	6521	6526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_004347	CAC	2	6	6585	6590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_004347	TAG	2	6	6626	6631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004347	TAA	2	6	6689	6694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004347	TTG	2	6	6712	6717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004347	TGA	2	6	6742	6747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004347	TGA	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004347	TTG	2	6	6783	6788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004347	ATT	2	6	6795	6800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004347	T	6	6	6799	6804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004347	TGA	2	6	6849	6854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004347	CAA	2	6	6891	6896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371608
139	NC_004347	GAC	2	6	6904	6909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371608
140	NC_004347	CAG	2	6	6930	6935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371608
141	NC_004347	ATGG	2	8	6969	6976	25 %	25 %	50 %	0 %	24371608
142	NC_004347	T	6	6	7056	7061	0 %	100 %	0 %	0 %	24371608
143	NC_004347	ATG	2	6	7078	7083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371608
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150	NC_004347	TGG	2	6	7364	7369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371608
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152	NC_004347	AAC	2	6	7425	7430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371608
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154	NC_004347	GTT	2	6	7544	7549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371608
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158	NC_004347	ATC	2	6	7633	7638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371608
159	NC_004347	ATC	2	6	7641	7646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371608
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164	NC_004347	GCC	2	6	7903	7908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371608
165	NC_004347	GATT	2	8	7916	7923	25 %	50 %	25 %	0 %	24371608
166	NC_004347	TAC	2	6	8007	8012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371608
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170	NC_004347	TAAC	2	8	8101	8108	50 %	25 %	0 %	25 %	24371608
171	NC_004347	TGG	2	6	8138	8143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371608
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174	NC_004347	AGA	2	6	8216	8221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371608
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183	NC_004347	ACGT	2	8	8724	8731	25 %	25 %	25 %	25 %	24371609
184	NC_004347	TAC	2	6	8732	8737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371609
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189	NC_004347	ACC	2	6	8951	8956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371609
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215	NC_004347	ATA	2	6	10633	10638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371611
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251	NC_004347	GC	3	6	12423	12428	0 %	0 %	50 %	50 %	24371611
252	NC_004347	ACC	2	6	12472	12477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371611
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256	NC_004347	CAAT	2	8	12687	12694	50 %	25 %	0 %	25 %	24371611
257	NC_004347	TTGA	2	8	12738	12745	25 %	50 %	25 %	0 %	24371611
258	NC_004347	GGT	2	6	12750	12755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371611
259	NC_004347	AAG	2	6	12781	12786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371611
260	NC_004347	TGC	2	6	12925	12930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371611
261	NC_004347	TGA	2	6	12941	12946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371611
262	NC_004347	CTTG	2	8	12973	12980	0 %	50 %	25 %	25 %	24371611
263	NC_004347	CGT	2	6	13002	13007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371611
264	NC_004347	GATA	2	8	13066	13073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
265	NC_004347	AGCTT	2	10	13097	13106	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
266	NC_004347	TTTG	2	8	13113	13120	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
267	NC_004347	GCG	2	6	13181	13186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371612
268	NC_004347	TGGC	2	8	13207	13214	0 %	25 %	50 %	25 %	24371612
269	NC_004347	GCTCG	2	10	13235	13244	0 %	20 %	40 %	40 %	24371612
270	NC_004347	AAG	2	6	13271	13276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371612
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272	NC_004347	CAT	2	6	13297	13302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371612
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278	NC_004347	T	6	6	13723	13728	0 %	100 %	0 %	0 %	24371612
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282	NC_004347	GCT	2	6	13988	13993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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381	NC_004347	CA	3	6	19416	19421	50 %	0 %	0 %	50 %	414561719
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398	NC_004347	T	6	6	20241	20246	0 %	100 %	0 %	0 %	414561719
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400	NC_004347	CTG	2	6	20499	20504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561719
401	NC_004347	TTGA	2	8	20535	20542	25 %	50 %	25 %	0 %	414561719
402	NC_004347	AGCT	2	8	20543	20550	25 %	25 %	25 %	25 %	414561719
403	NC_004347	ATC	3	9	20558	20566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561719
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