MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_004347	T	7	7	1399089	1399095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25004	NC_004347	ATG	2	6	1399488	1399493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372920
25005	NC_004347	A	6	6	1399583	1399588	100 %	0 %	0 %	0 %	24372920
25006	NC_004347	GAA	2	6	1399619	1399624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372920
25007	NC_004347	CAT	3	9	1399681	1399689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372920
25008	NC_004347	GA	3	6	1399863	1399868	50 %	0 %	50 %	0 %	24372921
25009	NC_004347	TGC	2	6	1399894	1399899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372921
25010	NC_004347	ATA	2	6	1399914	1399919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372921
25011	NC_004347	G	6	6	1399956	1399961	0 %	0 %	100 %	0 %	24372921
25012	NC_004347	TGC	2	6	1400002	1400007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372921
25013	NC_004347	GCA	2	6	1400074	1400079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372921
25014	NC_004347	GCA	2	6	1400147	1400152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372921
25015	NC_004347	TCAA	2	8	1400190	1400197	50 %	25 %	0 %	25 %	24372921
25016	NC_004347	GAT	2	6	1400204	1400209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372921
25017	NC_004347	TCA	2	6	1400232	1400237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372921
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25019	NC_004347	ATGA	2	8	1400321	1400328	50 %	25 %	25 %	0 %	24372921
25020	NC_004347	CGT	2	6	1400333	1400338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372921
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25028	NC_004347	CAG	2	6	1400778	1400783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372922
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25033	NC_004347	CAAG	2	8	1401049	1401056	50 %	0 %	25 %	25 %	24372922
25034	NC_004347	GTG	3	9	1401137	1401145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372922
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25036	NC_004347	TCTA	2	8	1401221	1401228	25 %	50 %	0 %	25 %	24372922
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25039	NC_004347	TCA	2	6	1401395	1401400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372923
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25043	NC_004347	CTG	2	6	1401592	1401597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372923
25044	NC_004347	GCG	3	9	1401631	1401639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372923
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25046	NC_004347	CT	3	6	1401909	1401914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25047	NC_004347	AGC	2	6	1402032	1402037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25052	NC_004347	GCC	2	6	1402470	1402475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372924
25053	NC_004347	CGATG	2	10	1402499	1402508	20 %	20 %	40 %	20 %	24372924
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25062	NC_004347	A	6	6	1402905	1402910	100 %	0 %	0 %	0 %	24372924
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25081	NC_004347	TTTA	2	8	1403880	1403887	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25082	NC_004347	T	6	6	1403910	1403915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25118	NC_004347	CGC	2	6	1406053	1406058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372927
25119	NC_004347	ATA	2	6	1406102	1406107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372927
25120	NC_004347	AAG	2	6	1406117	1406122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372927
25121	NC_004347	AAG	2	6	1406152	1406157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372927
25122	NC_004347	GGC	2	6	1406226	1406231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372927
25123	NC_004347	TCT	2	6	1406255	1406260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372927
25124	NC_004347	ACCG	2	8	1406278	1406285	25 %	0 %	25 %	50 %	24372927
25125	NC_004347	CGTG	2	8	1406313	1406320	0 %	25 %	50 %	25 %	24372927
25126	NC_004347	GAT	2	6	1406388	1406393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372927
25127	NC_004347	GAT	2	6	1406581	1406586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372927
25128	NC_004347	TCA	2	6	1406655	1406660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25129	NC_004347	GC	3	6	1406726	1406731	0 %	0 %	50 %	50 %	24372928
25130	NC_004347	CG	3	6	1406775	1406780	0 %	0 %	50 %	50 %	24372928
25131	NC_004347	TCC	2	6	1406813	1406818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24372928
25132	NC_004347	GCG	2	6	1406887	1406892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372928
25133	NC_004347	TATC	2	8	1407000	1407007	25 %	50 %	0 %	25 %	24372928
25134	NC_004347	TGC	2	6	1407074	1407079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372928
25135	NC_004347	TTG	2	6	1407247	1407252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372928
25136	NC_004347	TAA	2	6	1407312	1407317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372928
25137	NC_004347	GCA	2	6	1407349	1407354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372928
25138	NC_004347	AAT	2	6	1407373	1407378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372928
25139	NC_004347	T	6	6	1407394	1407399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25140	NC_004347	ATCCTG	2	12	1407536	1407547	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	24372929
25141	NC_004347	CATT	2	8	1407594	1407601	25 %	50 %	0 %	25 %	24372929
25142	NC_004347	TTG	2	6	1407643	1407648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372929
25143	NC_004347	GAA	2	6	1407694	1407699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372929
25144	NC_004347	AAG	2	6	1407761	1407766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372929
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25147	NC_004347	GCCAT	2	10	1408109	1408118	20 %	20 %	20 %	40 %	24372929
25148	NC_004347	CGC	2	6	1408128	1408133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372929
25149	NC_004347	GTC	2	6	1408187	1408192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372929
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25153	NC_004347	TGC	2	6	1408364	1408369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372930
25154	NC_004347	GCA	2	6	1408380	1408385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372930
25155	NC_004347	CATATT	2	12	1408428	1408439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	24372930
25156	NC_004347	GC	3	6	1408456	1408461	0 %	0 %	50 %	50 %	24372930
25157	NC_004347	GC	3	6	1408483	1408488	0 %	0 %	50 %	50 %	24372930
25158	NC_004347	AGC	2	6	1408489	1408494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372930
25159	NC_004347	TGA	3	9	1408598	1408606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25160	NC_004347	T	7	7	1408682	1408688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25161	NC_004347	CCG	2	6	1408764	1408769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372931
25162	NC_004347	TCATT	2	10	1408825	1408834	20 %	60 %	0 %	20 %	24372931
25163	NC_004347	ATT	2	6	1408847	1408852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372931
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25166	NC_004347	TATT	2	8	1409067	1409074	25 %	75 %	0 %	0 %	24372931
25167	NC_004347	GAT	2	6	1409135	1409140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372931
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25170	NC_004347	T	6	6	1409333	1409338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25171	NC_004347	GTG	2	6	1409357	1409362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372932
25172	NC_004347	TGC	2	6	1409371	1409376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372932
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25178	NC_004347	TCTAAG	2	12	1410028	1410039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24372932
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25190	NC_004347	TGC	2	6	1410840	1410845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372933
25191	NC_004347	CATAG	2	10	1410846	1410855	40 %	20 %	20 %	20 %	24372933
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25198	NC_004347	ATC	2	6	1411068	1411073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372933
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25202	NC_004347	GTAAAG	2	12	1411278	1411289	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	24372933
25203	NC_004347	GAT	2	6	1411292	1411297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372933
25204	NC_004347	GGC	2	6	1411370	1411375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372933
25205	NC_004347	ACC	2	6	1411386	1411391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372933
25206	NC_004347	CAATG	2	10	1411466	1411475	40 %	20 %	20 %	20 %	24372933
25207	NC_004347	A	7	7	1411480	1411486	100 %	0 %	0 %	0 %	24372933
25208	NC_004347	A	6	6	1411501	1411506	100 %	0 %	0 %	0 %	24372933
25209	NC_004347	GTT	2	6	1411533	1411538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25210	NC_004347	TGT	2	6	1411582	1411587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25211	NC_004347	GTAGCA	2	12	1411770	1411781	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25212	NC_004347	CACG	2	8	1411875	1411882	25 %	0 %	25 %	50 %	24372934
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25218	NC_004347	GGCGA	2	10	1412105	1412114	20 %	0 %	60 %	20 %	24372934
25219	NC_004347	GTG	2	6	1412150	1412155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372934
25220	NC_004347	ATG	2	6	1412156	1412161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372934
25221	NC_004347	ACC	2	6	1412186	1412191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372934
25222	NC_004347	ACT	2	6	1412212	1412217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372934
25223	NC_004347	A	6	6	1412231	1412236	100 %	0 %	0 %	0 %	24372934
25224	NC_004347	TTC	2	6	1412321	1412326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372934
25225	NC_004347	ATG	2	6	1412447	1412452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372934
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25228	NC_004347	TGC	2	6	1412617	1412622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372934
25229	NC_004347	GAA	2	6	1412759	1412764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372934
25230	NC_004347	GGC	2	6	1412822	1412827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372934
25231	NC_004347	CAA	2	6	1412861	1412866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372934
25232	NC_004347	ATG	2	6	1412885	1412890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372934
25233	NC_004347	ATC	2	6	1412984	1412989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372934
25234	NC_004347	TGC	2	6	1413055	1413060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372934
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25356	NC_004347	TGA	2	6	1419241	1419246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372941
25357	NC_004347	GGT	2	6	1419253	1419258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372941
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25461	NC_004347	A	6	6	1425103	1425108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25462	NC_004347	AGGGCG	2	12	1425145	1425156	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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25464	NC_004347	ATT	2	6	1425173	1425178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25467	NC_004347	TAA	2	6	1425252	1425257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25469	NC_004347	A	6	6	1425295	1425300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25470	NC_004347	GAA	2	6	1425304	1425309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25471	NC_004347	TTC	2	6	1425314	1425319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25472	NC_004347	ATT	2	6	1425341	1425346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372946
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25475	NC_004347	CAC	2	6	1425611	1425616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372946
25476	NC_004347	CA	3	6	1425699	1425704	50 %	0 %	0 %	50 %	24372946
25477	NC_004347	AGTG	2	8	1425711	1425718	25 %	25 %	50 %	0 %	24372946
25478	NC_004347	CA	3	6	1425773	1425778	50 %	0 %	0 %	50 %	24372946
25479	NC_004347	GGT	2	6	1425834	1425839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372946
25480	NC_004347	CGA	2	6	1425902	1425907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372946
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25483	NC_004347	TGGCGC	2	12	1426121	1426132	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	24372946
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25491	NC_004347	TGA	2	6	1426571	1426576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372946
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25494	NC_004347	CGC	2	6	1426700	1426705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372946
25495	NC_004347	CGG	2	6	1426771	1426776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372946
25496	NC_004347	GTT	2	6	1426811	1426816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372946
25497	NC_004347	TATT	2	8	1426884	1426891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25498	NC_004347	TTA	2	6	1426926	1426931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25499	NC_004347	TTA	2	6	1427182	1427187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372947
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