MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_004347	T	6	6	1204253	1204258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21502	NC_004347	AAAGT	2	10	1204263	1204272	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21503	NC_004347	ACTTC	2	10	1204276	1204285	20 %	40 %	0 %	40 %	24372744
21504	NC_004347	TCA	2	6	1204383	1204388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372744
21505	NC_004347	CAT	2	6	1204532	1204537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372744
21506	NC_004347	TAG	2	6	1204586	1204591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372744
21507	NC_004347	GGC	2	6	1204677	1204682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372744
21508	NC_004347	GCG	2	6	1204704	1204709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372744
21509	NC_004347	GTC	2	6	1204820	1204825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372744
21510	NC_004347	TGA	2	6	1204840	1204845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372744
21511	NC_004347	TCA	2	6	1204902	1204907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372744
21512	NC_004347	GAC	2	6	1204918	1204923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372744
21513	NC_004347	AGG	2	6	1205023	1205028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24372744
21514	NC_004347	GCTT	2	8	1205067	1205074	0 %	50 %	25 %	25 %	24372744
21515	NC_004347	GCT	2	6	1205243	1205248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561863
21516	NC_004347	TGA	3	9	1205255	1205263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561863
21517	NC_004347	TAA	2	6	1205298	1205303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561863
21518	NC_004347	GCC	2	6	1205338	1205343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561863
21519	NC_004347	AGC	2	6	1205448	1205453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561863
21520	NC_004347	AC	3	6	1205502	1205507	50 %	0 %	0 %	50 %	414561863
21521	NC_004347	ATG	2	6	1205561	1205566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561863
21522	NC_004347	TGC	2	6	1205607	1205612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561863
21523	NC_004347	GAG	2	6	1205623	1205628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414561863
21524	NC_004347	GCC	2	6	1205671	1205676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561863
21525	NC_004347	GTT	2	6	1205794	1205799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561863
21526	NC_004347	TGC	2	6	1205816	1205821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561863
21527	NC_004347	TTG	2	6	1205848	1205853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561863
21528	NC_004347	GTG	2	6	1205876	1205881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561863
21529	NC_004347	TAT	2	6	1205921	1205926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21530	NC_004347	AGAT	2	8	1205949	1205956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21531	NC_004347	TAG	2	6	1206079	1206084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372746
21532	NC_004347	TCA	2	6	1206226	1206231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372746
21533	NC_004347	TGG	2	6	1206284	1206289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21534	NC_004347	AAC	2	6	1206326	1206331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21535	NC_004347	ACCA	2	8	1206378	1206385	50 %	0 %	0 %	50 %	414561864
21536	NC_004347	CTT	2	6	1206441	1206446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561864
21537	NC_004347	T	6	6	1206520	1206525	0 %	100 %	0 %	0 %	414561864
21538	NC_004347	TTG	2	6	1206655	1206660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561864
21539	NC_004347	GAA	2	6	1206703	1206708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561864
21540	NC_004347	T	6	6	1206730	1206735	0 %	100 %	0 %	0 %	414561864
21541	NC_004347	GGC	2	6	1206751	1206756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561864
21542	NC_004347	AAC	2	6	1206775	1206780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561864
21543	NC_004347	TTC	2	6	1206955	1206960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561864
21544	NC_004347	TCA	2	6	1207092	1207097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561864
21545	NC_004347	CGA	2	6	1207101	1207106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561864
21546	NC_004347	CA	3	6	1207144	1207149	50 %	0 %	0 %	50 %	414561864
21547	NC_004347	GAT	3	9	1207168	1207176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561864
21548	NC_004347	TGA	2	6	1207231	1207236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561864
21549	NC_004347	T	6	6	1207247	1207252	0 %	100 %	0 %	0 %	414561864
21550	NC_004347	CAT	3	9	1207278	1207286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561864
21551	NC_004347	TCA	2	6	1207335	1207340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561864
21552	NC_004347	TTC	2	6	1207381	1207386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561864
21553	NC_004347	AAT	3	9	1207404	1207412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561864
21554	NC_004347	GGC	2	6	1207432	1207437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561864
21555	NC_004347	GCA	2	6	1207472	1207477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561864
21556	NC_004347	AGC	2	6	1207505	1207510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561864
21557	NC_004347	TCA	2	6	1207539	1207544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561864
21558	NC_004347	GAAA	2	8	1207574	1207581	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21559	NC_004347	CAT	2	6	1207670	1207675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21560	NC_004347	TTTCT	2	10	1207834	1207843	0 %	80 %	0 %	20 %	24372748
21561	NC_004347	GTT	2	6	1207869	1207874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372748
21562	NC_004347	GAG	2	6	1207913	1207918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24372748
21563	NC_004347	TA	3	6	1207960	1207965	50 %	50 %	0 %	0 %	24372748
21564	NC_004347	CCGTGC	2	12	1207989	1208000	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	24372748
21565	NC_004347	GCA	2	6	1208024	1208029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372748
21566	NC_004347	TTA	2	6	1208303	1208308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372748
21567	NC_004347	CGG	2	6	1208312	1208317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372748
21568	NC_004347	TTCTTA	2	12	1208426	1208437	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	24372748
21569	NC_004347	GCC	2	6	1208477	1208482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372748
21570	NC_004347	ATT	2	6	1208521	1208526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372748
21571	NC_004347	T	6	6	1208525	1208530	0 %	100 %	0 %	0 %	24372748
21572	NC_004347	TGT	2	6	1208538	1208543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372748
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21574	NC_004347	CAT	2	6	1208881	1208886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372749
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21577	NC_004347	T	6	6	1209230	1209235	0 %	100 %	0 %	0 %	24372749
21578	NC_004347	TTTGGC	2	12	1209350	1209361	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	24372749
21579	NC_004347	TAA	2	6	1209412	1209417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372749
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21582	NC_004347	TCA	2	6	1209659	1209664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561865
21583	NC_004347	GCC	2	6	1209681	1209686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561865
21584	NC_004347	GAA	2	6	1209765	1209770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561865
21585	NC_004347	CTGC	2	8	1209784	1209791	0 %	25 %	25 %	50 %	414561865
21586	NC_004347	ATG	2	6	1209847	1209852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561865
21587	NC_004347	TGC	2	6	1209878	1209883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561865
21588	NC_004347	ATA	2	6	1210024	1210029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561865
21589	NC_004347	AAG	2	6	1210105	1210110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561865
21590	NC_004347	CGG	2	6	1210139	1210144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561865
21591	NC_004347	GCC	2	6	1210152	1210157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561865
21592	NC_004347	GTT	2	6	1210238	1210243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561865
21593	NC_004347	CAG	2	6	1210266	1210271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561865
21594	NC_004347	CGCCCG	2	12	1210277	1210288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561865
21595	NC_004347	T	6	6	1210299	1210304	0 %	100 %	0 %	0 %	414561865
21596	NC_004347	A	6	6	1210434	1210439	100 %	0 %	0 %	0 %	414561865
21597	NC_004347	CAG	2	6	1210449	1210454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561865
21598	NC_004347	GATT	2	8	1210508	1210515	25 %	50 %	25 %	0 %	414561865
21599	NC_004347	CAT	2	6	1210572	1210577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561865
21600	NC_004347	CAC	2	6	1210589	1210594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561865
21601	NC_004347	AGG	2	6	1210636	1210641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414561865
21602	NC_004347	AGT	2	6	1210645	1210650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561865
21603	NC_004347	AT	3	6	1210734	1210739	50 %	50 %	0 %	0 %	24372751
21604	NC_004347	CCCCA	2	10	1210777	1210786	20 %	0 %	0 %	80 %	24372751
21605	NC_004347	CAGC	2	8	1210807	1210814	25 %	0 %	25 %	50 %	24372751
21606	NC_004347	CGC	2	6	1210946	1210951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372751
21607	NC_004347	TGA	2	6	1211008	1211013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372751
21608	NC_004347	TAT	2	6	1211083	1211088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372751
21609	NC_004347	TTGA	2	8	1211091	1211098	25 %	50 %	25 %	0 %	24372751
21610	NC_004347	GCG	2	6	1211110	1211115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372751
21611	NC_004347	ACG	2	6	1211120	1211125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372751
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21613	NC_004347	GCCAAA	2	12	1211312	1211323	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	24372751
21614	NC_004347	GT	3	6	1211505	1211510	0 %	50 %	50 %	0 %	24372751
21615	NC_004347	AAT	2	6	1211546	1211551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372751
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21854	NC_004347	CGT	2	6	1224248	1224253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372764
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21970	NC_004347	AATCT	2	10	1231097	1231106	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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21974	NC_004347	GCT	2	6	1231252	1231257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561868
21975	NC_004347	GTT	2	6	1231274	1231279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561868
21976	NC_004347	TGC	2	6	1231303	1231308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561868
21977	NC_004347	AAC	2	6	1231417	1231422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561868
21978	NC_004347	TGGT	2	8	1231435	1231442	0 %	50 %	50 %	0 %	414561868
21979	NC_004347	TGG	2	6	1231562	1231567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561868
21980	NC_004347	CAT	2	6	1231634	1231639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561868
21981	NC_004347	ATA	2	6	1231747	1231752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561868
21982	NC_004347	T	7	7	1231766	1231772	0 %	100 %	0 %	0 %	414561868
21983	NC_004347	GAT	2	6	1231791	1231796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21984	NC_004347	CGG	3	9	1231825	1231833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21985	NC_004347	TTG	2	6	1231946	1231951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21986	NC_004347	AACC	2	8	1231988	1231995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21987	NC_004347	TCT	2	6	1232007	1232012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21988	NC_004347	ATA	2	6	1232060	1232065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21989	NC_004347	CTG	2	6	1232116	1232121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21990	NC_004347	T	6	6	1232159	1232164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21991	NC_004347	AGTC	2	8	1232168	1232175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21992	NC_004347	ATC	2	6	1232197	1232202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561869
21993	NC_004347	TTA	2	6	1232252	1232257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561869
21994	NC_004347	T	6	6	1232264	1232269	0 %	100 %	0 %	0 %	414561869
21995	NC_004347	ATC	2	6	1232292	1232297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561869
21996	NC_004347	CGG	2	6	1232313	1232318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561869
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21998	NC_004347	GGATAT	2	12	1232428	1232439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561869
21999	NC_004347	ATT	2	6	1232645	1232650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561869
22000	NC_004347	A	6	6	1232702	1232707	100 %	0 %	0 %	0 %	414561869

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