MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_004347	AAG	2	6	1176162	1176167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372718
21003	NC_004347	GA	3	6	1176178	1176183	50 %	0 %	50 %	0 %	24372718
21004	NC_004347	TGA	2	6	1176244	1176249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372718
21005	NC_004347	ATT	2	6	1176258	1176263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372718
21006	NC_004347	GCAT	2	8	1176351	1176358	25 %	25 %	25 %	25 %	24372718
21007	NC_004347	TGC	2	6	1176415	1176420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372718
21008	NC_004347	TTA	2	6	1176441	1176446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372718
21009	NC_004347	AAT	2	6	1176530	1176535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372718
21010	NC_004347	AGC	2	6	1176573	1176578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372718
21011	NC_004347	AAGC	2	8	1176671	1176678	50 %	0 %	25 %	25 %	24372718
21012	NC_004347	ACA	2	6	1176700	1176705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372718
21013	NC_004347	AAAAG	2	10	1176712	1176721	80 %	0 %	20 %	0 %	24372718
21014	NC_004347	AAAG	2	8	1176864	1176871	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21015	NC_004347	CAT	2	6	1176974	1176979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21016	NC_004347	GAT	2	6	1176981	1176986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21017	NC_004347	TAAT	2	8	1177058	1177065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21018	NC_004347	ACG	2	6	1177152	1177157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21019	NC_004347	TTGATT	2	12	1177158	1177169	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21020	NC_004347	ATT	2	6	1177199	1177204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21021	NC_004347	AG	3	6	1177215	1177220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21022	NC_004347	GCAAAT	2	12	1177232	1177243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21023	NC_004347	A	6	6	1177249	1177254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21024	NC_004347	ACA	2	6	1177283	1177288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21025	NC_004347	TGA	2	6	1177346	1177351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372719
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21027	NC_004347	TGC	2	6	1177568	1177573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372719
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21029	NC_004347	ACG	2	6	1177603	1177608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372719
21030	NC_004347	GCT	2	6	1177624	1177629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372719
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21032	NC_004347	TG	3	6	1177745	1177750	0 %	50 %	50 %	0 %	24372719
21033	NC_004347	AGC	2	6	1177766	1177771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372719
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21037	NC_004347	GTA	2	6	1178111	1178116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372719
21038	NC_004347	ATTG	2	8	1178127	1178134	25 %	50 %	25 %	0 %	24372719
21039	NC_004347	GAT	2	6	1178188	1178193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372719
21040	NC_004347	GCT	2	6	1178236	1178241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372719
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21042	NC_004347	GGGC	2	8	1178435	1178442	0 %	0 %	75 %	25 %	24372719
21043	NC_004347	A	6	6	1178573	1178578	100 %	0 %	0 %	0 %	24372719
21044	NC_004347	TCG	2	6	1178640	1178645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372719
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21047	NC_004347	GTAAA	2	10	1178823	1178832	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21048	NC_004347	TGA	2	6	1178933	1178938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372720
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21052	NC_004347	AGC	2	6	1179062	1179067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372720
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21055	NC_004347	CA	3	6	1179093	1179098	50 %	0 %	0 %	50 %	24372720
21056	NC_004347	GTT	2	6	1179168	1179173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372720
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21058	NC_004347	ATT	2	6	1179234	1179239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372720
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21060	NC_004347	G	6	6	1179384	1179389	0 %	0 %	100 %	0 %	24372720
21061	NC_004347	TA	3	6	1179407	1179412	50 %	50 %	0 %	0 %	24372720
21062	NC_004347	AG	3	6	1179471	1179476	50 %	0 %	50 %	0 %	24372720
21063	NC_004347	GCGG	2	8	1179510	1179517	0 %	0 %	75 %	25 %	24372720
21064	NC_004347	GCGG	2	8	1179565	1179572	0 %	0 %	75 %	25 %	24372720
21065	NC_004347	ACA	2	6	1179611	1179616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372720
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21067	NC_004347	GCGCC	2	10	1179698	1179707	0 %	0 %	40 %	60 %	24372720
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21069	NC_004347	GTT	2	6	1179786	1179791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21074	NC_004347	CGC	2	6	1179989	1179994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21075	NC_004347	AGC	2	6	1180006	1180011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21077	NC_004347	AGCA	2	8	1180116	1180123	50 %	0 %	25 %	25 %	24372722
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21081	NC_004347	CTG	2	6	1180326	1180331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372722
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21083	NC_004347	GTAC	2	8	1180451	1180458	25 %	25 %	25 %	25 %	24372722
21084	NC_004347	TTCA	2	8	1180471	1180478	25 %	50 %	0 %	25 %	24372722
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21087	NC_004347	GCTG	2	8	1180550	1180557	0 %	25 %	50 %	25 %	24372722
21088	NC_004347	TCC	2	6	1180654	1180659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24372722
21089	NC_004347	TTA	2	6	1180688	1180693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372722
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21091	NC_004347	GAG	2	6	1180766	1180771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21092	NC_004347	GCGG	2	8	1180811	1180818	0 %	0 %	75 %	25 %	229220630
21093	NC_004347	GGAC	2	8	1180826	1180833	25 %	0 %	50 %	25 %	229220630
21094	NC_004347	ATC	2	6	1180851	1180856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229220630
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21098	NC_004347	GAT	2	6	1180985	1180990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229220630
21099	NC_004347	TTGA	2	8	1181000	1181007	25 %	50 %	25 %	0 %	229220630
21100	NC_004347	GT	3	6	1181047	1181052	0 %	50 %	50 %	0 %	229220630
21101	NC_004347	CAC	2	6	1181249	1181254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229220630
21102	NC_004347	A	6	6	1181261	1181266	100 %	0 %	0 %	0 %	229220630
21103	NC_004347	GC	3	6	1181407	1181412	0 %	0 %	50 %	50 %	229220630
21104	NC_004347	GCC	2	6	1181522	1181527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229220630
21105	NC_004347	GCA	2	6	1181566	1181571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229220630
21106	NC_004347	A	6	6	1181594	1181599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21107	NC_004347	T	9	9	1181612	1181620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21108	NC_004347	TAACA	2	10	1181715	1181724	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21109	NC_004347	TGGCT	2	10	1181744	1181753	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21110	NC_004347	TACTCG	2	12	1181786	1181797	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	24372724
21111	NC_004347	TC	3	6	1181841	1181846	0 %	50 %	0 %	50 %	24372724
21112	NC_004347	GTT	2	6	1181857	1181862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372724
21113	NC_004347	AAT	2	6	1181965	1181970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372724
21114	NC_004347	AGT	2	6	1182037	1182042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372724
21115	NC_004347	CAA	2	6	1182052	1182057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372724
21116	NC_004347	GTT	2	6	1182088	1182093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372724
21117	NC_004347	TCC	2	6	1182131	1182136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24372724
21118	NC_004347	CAT	2	6	1182162	1182167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372724
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21120	NC_004347	TGCC	2	8	1182311	1182318	0 %	25 %	25 %	50 %	24372724
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21479	NC_004347	CAC	2	6	1202752	1202757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372741
21480	NC_004347	TTG	2	6	1202926	1202931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372741
21481	NC_004347	TCT	2	6	1203050	1203055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372741
21482	NC_004347	TCC	2	6	1203095	1203100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21483	NC_004347	GAT	2	6	1203114	1203119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21484	NC_004347	TGG	2	6	1203229	1203234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21485	NC_004347	CTT	2	6	1203343	1203348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372742
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21487	NC_004347	GAT	2	6	1203399	1203404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372742
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21489	NC_004347	TGGT	2	8	1203552	1203559	0 %	50 %	50 %	0 %	24372742
21490	NC_004347	GC	3	6	1203602	1203607	0 %	0 %	50 %	50 %	24372742
21491	NC_004347	A	6	6	1203739	1203744	100 %	0 %	0 %	0 %	24372743
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21497	NC_004347	CG	4	8	1204086	1204093	0 %	0 %	50 %	50 %	24372743
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21500	NC_004347	A	7	7	1204230	1204236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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