MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_004347	GTT	2	6	1061444	1061449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19002	NC_004347	A	6	6	1061535	1061540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19003	NC_004347	TCA	2	6	1061551	1061556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19004	NC_004347	ATT	2	6	1061587	1061592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19005	NC_004347	TAT	2	6	1061593	1061598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19006	NC_004347	AGT	2	6	1061702	1061707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19007	NC_004347	CTT	2	6	1061754	1061759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19008	NC_004347	ATTT	2	8	1061769	1061776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19009	NC_004347	CA	3	6	1061805	1061810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19010	NC_004347	TCA	2	6	1061811	1061816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19011	NC_004347	ATT	2	6	1061838	1061843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19012	NC_004347	ATAA	2	8	1061904	1061911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19013	NC_004347	AAC	2	6	1062016	1062021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19014	NC_004347	TTA	2	6	1062122	1062127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561843
19015	NC_004347	TTG	2	6	1062195	1062200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561843
19016	NC_004347	CAA	2	6	1062252	1062257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561843
19017	NC_004347	AGC	2	6	1062317	1062322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561843
19018	NC_004347	TTA	2	6	1062408	1062413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561843
19019	NC_004347	CAC	2	6	1062490	1062495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561843
19020	NC_004347	GTCAC	2	10	1062533	1062542	20 %	20 %	20 %	40 %	414561843
19021	NC_004347	GTC	2	6	1062626	1062631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561843
19022	NC_004347	ACGA	2	8	1062685	1062692	50 %	0 %	25 %	25 %	414561843
19023	NC_004347	CCTT	2	8	1062713	1062720	0 %	50 %	0 %	50 %	414561843
19024	NC_004347	TTC	2	6	1062728	1062733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561843
19025	NC_004347	TGA	2	6	1062918	1062923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561843
19026	NC_004347	TC	3	6	1062943	1062948	0 %	50 %	0 %	50 %	414561843
19027	NC_004347	AAG	2	6	1062952	1062957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561843
19028	NC_004347	T	6	6	1062967	1062972	0 %	100 %	0 %	0 %	414561843
19029	NC_004347	TCA	2	6	1063027	1063032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561843
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19032	NC_004347	T	6	6	1063209	1063214	0 %	100 %	0 %	0 %	414561843
19033	NC_004347	AATG	2	8	1063290	1063297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19034	NC_004347	TAA	2	6	1063319	1063324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19035	NC_004347	ACTCT	2	10	1063384	1063393	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19036	NC_004347	GGC	2	6	1063568	1063573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19037	NC_004347	CTT	2	6	1063610	1063615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19038	NC_004347	TGGAA	2	10	1063625	1063634	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19039	NC_004347	TTTGAT	2	12	1063644	1063655	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19040	NC_004347	GGT	2	6	1063752	1063757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19041	NC_004347	AGC	2	6	1063942	1063947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372612
19042	NC_004347	TCCG	2	8	1064009	1064016	0 %	25 %	25 %	50 %	24372612
19043	NC_004347	A	6	6	1064378	1064383	100 %	0 %	0 %	0 %	24372612
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19048	NC_004347	AAG	2	6	1064656	1064661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372612
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19053	NC_004347	TTC	2	6	1065069	1065074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19054	NC_004347	GGT	2	6	1065095	1065100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19055	NC_004347	GAT	2	6	1065138	1065143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19056	NC_004347	TAT	2	6	1065162	1065167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372613
19057	NC_004347	TG	3	6	1065191	1065196	0 %	50 %	50 %	0 %	24372613
19058	NC_004347	GCTG	2	8	1065205	1065212	0 %	25 %	50 %	25 %	24372613
19059	NC_004347	GAG	2	6	1065245	1065250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24372613
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19063	NC_004347	TAA	2	6	1065569	1065574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19064	NC_004347	TTG	2	6	1065602	1065607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19065	NC_004347	AT	3	6	1065659	1065664	50 %	50 %	0 %	0 %	24372614
19066	NC_004347	T	6	6	1065668	1065673	0 %	100 %	0 %	0 %	24372614
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19073	NC_004347	TGC	2	6	1065939	1065944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372615
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19081	NC_004347	A	6	6	1066474	1066479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19088	NC_004347	GCCA	2	8	1066831	1066838	25 %	0 %	25 %	50 %	24372616
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19093	NC_004347	GCT	2	6	1067129	1067134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372616
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19095	NC_004347	TACG	2	8	1067162	1067169	25 %	25 %	25 %	25 %	24372616
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19101	NC_004347	ACCC	2	8	1067376	1067383	25 %	0 %	0 %	75 %	24372616
19102	NC_004347	TGA	2	6	1067404	1067409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372616
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19106	NC_004347	T	7	7	1067531	1067537	0 %	100 %	0 %	0 %	24372616
19107	NC_004347	CAC	2	6	1067583	1067588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372616
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19119	NC_004347	TCA	2	6	1068317	1068322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372616
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19121	NC_004347	ACC	2	6	1068337	1068342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372616
19122	NC_004347	CGA	2	6	1068380	1068385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372616
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19124	NC_004347	TCA	2	6	1068463	1068468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372616
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19132	NC_004347	TCG	2	6	1069045	1069050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372616
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19234	NC_004347	ATAA	2	8	1074169	1074176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19235	NC_004347	T	6	6	1074198	1074203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19236	NC_004347	TTAAT	2	10	1074335	1074344	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19237	NC_004347	GAGTG	2	10	1074404	1074413	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19238	NC_004347	TCAA	2	8	1074422	1074429	50 %	25 %	0 %	25 %	24372621
19239	NC_004347	GCC	2	6	1074506	1074511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372621
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19473	NC_004347	TTTTG	2	10	1086628	1086637	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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