MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_004347	TCA	2	6	1038633	1038638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561842
18503	NC_004347	TGC	2	6	1038867	1038872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561842
18504	NC_004347	TGT	2	6	1038903	1038908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561842
18505	NC_004347	TGC	2	6	1038965	1038970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561842
18506	NC_004347	GAT	2	6	1039032	1039037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561842
18507	NC_004347	CGC	2	6	1039084	1039089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561842
18508	NC_004347	CGA	2	6	1039115	1039120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561842
18509	NC_004347	CAT	2	6	1039129	1039134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561842
18510	NC_004347	CGA	2	6	1039290	1039295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561842
18511	NC_004347	AAT	2	6	1039384	1039389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561842
18512	NC_004347	CAT	2	6	1039479	1039484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561842
18513	NC_004347	TGC	2	6	1039610	1039615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561842
18514	NC_004347	TAA	2	6	1039621	1039626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561842
18515	NC_004347	TAA	2	6	1039632	1039637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561842
18516	NC_004347	ATC	2	6	1039702	1039707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561842
18517	NC_004347	ATC	2	6	1039732	1039737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561842
18518	NC_004347	ACGAT	2	10	1039787	1039796	40 %	20 %	20 %	20 %	414561842
18519	NC_004347	TGC	2	6	1039806	1039811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561842
18520	NC_004347	TTC	2	6	1039819	1039824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561842
18521	NC_004347	A	6	6	1039831	1039836	100 %	0 %	0 %	0 %	414561842
18522	NC_004347	CT	3	6	1039844	1039849	0 %	50 %	0 %	50 %	414561842
18523	NC_004347	AACC	2	8	1039850	1039857	50 %	0 %	0 %	50 %	414561842
18524	NC_004347	CCAT	2	8	1039970	1039977	25 %	25 %	0 %	50 %	414561842
18525	NC_004347	TTA	2	6	1040048	1040053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561842
18526	NC_004347	GCA	2	6	1040244	1040249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561842
18527	NC_004347	A	6	6	1040263	1040268	100 %	0 %	0 %	0 %	414561842
18528	NC_004347	GCC	2	6	1040303	1040308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561842
18529	NC_004347	CT	3	6	1040312	1040317	0 %	50 %	0 %	50 %	414561842
18530	NC_004347	CAG	2	6	1040338	1040343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561842
18531	NC_004347	CAT	2	6	1040379	1040384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561842
18532	NC_004347	AAT	2	6	1040401	1040406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561842
18533	NC_004347	TAT	2	6	1040454	1040459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561842
18534	NC_004347	A	6	6	1040595	1040600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18535	NC_004347	ATT	2	6	1040664	1040669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18536	NC_004347	GA	3	6	1040778	1040783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18537	NC_004347	GAT	2	6	1040798	1040803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372592
18538	NC_004347	ATG	2	6	1040862	1040867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372592
18539	NC_004347	ATC	2	6	1040882	1040887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372592
18540	NC_004347	CCG	2	6	1040890	1040895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372592
18541	NC_004347	ATG	2	6	1040903	1040908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372592
18542	NC_004347	TTCC	2	8	1041036	1041043	0 %	50 %	0 %	50 %	24372592
18543	NC_004347	A	6	6	1041143	1041148	100 %	0 %	0 %	0 %	24372592
18544	NC_004347	GTG	2	6	1041155	1041160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372592
18545	NC_004347	CGC	2	6	1041212	1041217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372592
18546	NC_004347	TGG	2	6	1041268	1041273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372592
18547	NC_004347	ATG	3	9	1041285	1041293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372592
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18549	NC_004347	TGG	2	6	1041418	1041423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372592
18550	NC_004347	CGC	2	6	1041442	1041447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372592
18551	NC_004347	CAT	2	6	1041448	1041453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372592
18552	NC_004347	CGC	2	6	1041622	1041627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372592
18553	NC_004347	ATG	2	6	1041681	1041686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372592
18554	NC_004347	TTC	2	6	1041791	1041796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18555	NC_004347	GTT	2	6	1041820	1041825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18556	NC_004347	GC	3	6	1041905	1041910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18557	NC_004347	ACT	2	6	1041919	1041924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18558	NC_004347	AAGGA	2	10	1041953	1041962	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18559	NC_004347	TCA	2	6	1041984	1041989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18560	NC_004347	GCT	2	6	1041996	1042001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18561	NC_004347	GAG	2	6	1042068	1042073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18562	NC_004347	ATC	2	6	1042219	1042224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372593
18563	NC_004347	CGC	2	6	1042228	1042233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372593
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18565	NC_004347	CAATAT	2	12	1042368	1042379	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	24372593
18566	NC_004347	TGC	2	6	1042394	1042399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372593
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18570	NC_004347	CGC	2	6	1042480	1042485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372593
18571	NC_004347	CAT	2	6	1042506	1042511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372593
18572	NC_004347	T	6	6	1042522	1042527	0 %	100 %	0 %	0 %	24372593
18573	NC_004347	GAT	2	6	1042531	1042536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372593
18574	NC_004347	T	6	6	1042536	1042541	0 %	100 %	0 %	0 %	24372593
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18586	NC_004347	CGG	2	6	1042935	1042940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372593
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18589	NC_004347	GC	3	6	1043024	1043029	0 %	0 %	50 %	50 %	24372593
18590	NC_004347	A	6	6	1043154	1043159	100 %	0 %	0 %	0 %	24372593
18591	NC_004347	TGC	2	6	1043195	1043200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372593
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18599	NC_004347	A	6	6	1043774	1043779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18600	NC_004347	GAT	2	6	1044008	1044013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372594
18601	NC_004347	A	6	6	1044042	1044047	100 %	0 %	0 %	0 %	24372594
18602	NC_004347	TGA	2	6	1044108	1044113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372594
18603	NC_004347	CAT	3	9	1044115	1044123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372594
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18611	NC_004347	GAAA	2	8	1044628	1044635	75 %	0 %	25 %	0 %	24372594
18612	NC_004347	TGT	2	6	1044663	1044668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372594
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18614	NC_004347	A	6	6	1044706	1044711	100 %	0 %	0 %	0 %	24372594
18615	NC_004347	TC	3	6	1044714	1044719	0 %	50 %	0 %	50 %	24372594
18616	NC_004347	TTAA	2	8	1044878	1044885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18617	NC_004347	TG	3	6	1044891	1044896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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