MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_004347	GGAA	2	8	1011620	1011627	50 %	0 %	50 %	0 %	414561839
18002	NC_004347	CAA	2	6	1011643	1011648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561839
18003	NC_004347	AGA	2	6	1011660	1011665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561839
18004	NC_004347	TGA	2	6	1011675	1011680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561839
18005	NC_004347	A	6	6	1011735	1011740	100 %	0 %	0 %	0 %	414561839
18006	NC_004347	CTT	2	6	1011750	1011755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561839
18007	NC_004347	GA	3	6	1011759	1011764	50 %	0 %	50 %	0 %	414561839
18008	NC_004347	TCA	2	6	1011784	1011789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561839
18009	NC_004347	GAA	2	6	1011974	1011979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561839
18010	NC_004347	AAGG	2	8	1011987	1011994	50 %	0 %	50 %	0 %	414561839
18011	NC_004347	TCGT	2	8	1012015	1012022	0 %	50 %	25 %	25 %	414561839
18012	NC_004347	GAC	2	6	1012076	1012081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561839
18013	NC_004347	GTGAC	2	10	1012165	1012174	20 %	20 %	40 %	20 %	414561839
18014	NC_004347	TAA	2	6	1012294	1012299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561839
18015	NC_004347	GCT	2	6	1012385	1012390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561839
18016	NC_004347	GTT	2	6	1012449	1012454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561839
18017	NC_004347	CAAC	2	8	1012503	1012510	50 %	0 %	0 %	50 %	414561839
18018	NC_004347	TAA	2	6	1012580	1012585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561839
18019	NC_004347	GAA	2	6	1012700	1012705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_004347	GAT	2	6	1012803	1012808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18021	NC_004347	TGA	2	6	1012835	1012840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_004347	AATT	2	8	1012855	1012862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18023	NC_004347	TATT	2	8	1012986	1012993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18024	NC_004347	TGA	2	6	1013033	1013038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18025	NC_004347	TCA	2	6	1013097	1013102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18026	NC_004347	TATT	2	8	1013297	1013304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18027	NC_004347	CTG	2	6	1013359	1013364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18028	NC_004347	CA	3	6	1013376	1013381	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18029	NC_004347	TGC	2	6	1013474	1013479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18030	NC_004347	GTG	2	6	1013535	1013540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_004347	GCCTGA	2	12	1013543	1013554	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18032	NC_004347	TGG	3	9	1013564	1013572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18033	NC_004347	CTAT	2	8	1013586	1013593	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18034	NC_004347	AGA	2	6	1013619	1013624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_004347	TGA	2	6	1013640	1013645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18036	NC_004347	T	6	6	1013711	1013716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18037	NC_004347	TTCATT	2	12	1013751	1013762	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18038	NC_004347	TGC	2	6	1013821	1013826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561840
18039	NC_004347	T	7	7	1013840	1013846	0 %	100 %	0 %	0 %	414561840
18040	NC_004347	TGA	2	6	1013857	1013862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561840
18041	NC_004347	GCG	2	6	1013877	1013882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561840
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18043	NC_004347	GAT	2	6	1013931	1013936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561840
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18048	NC_004347	CCTT	2	8	1014069	1014076	0 %	50 %	0 %	50 %	414561840
18049	NC_004347	GAC	2	6	1014101	1014106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561840
18050	NC_004347	AT	3	6	1014128	1014133	50 %	50 %	0 %	0 %	414561840
18051	NC_004347	TGG	2	6	1014175	1014180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561840
18052	NC_004347	TGC	2	6	1014251	1014256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561840
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18056	NC_004347	TTAT	2	8	1014399	1014406	25 %	75 %	0 %	0 %	414561840
18057	NC_004347	T	6	6	1014471	1014476	0 %	100 %	0 %	0 %	414561840
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18060	NC_004347	CGAT	2	8	1014557	1014564	25 %	25 %	25 %	25 %	414561840
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18065	NC_004347	GGC	3	9	1014806	1014814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561840
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18072	NC_004347	A	6	6	1015064	1015069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18107	NC_004347	GAA	2	6	1016622	1016627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372574
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18111	NC_004347	T	7	7	1016816	1016822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18112	NC_004347	AGA	2	6	1016848	1016853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18113	NC_004347	CA	3	6	1016872	1016877	50 %	0 %	0 %	50 %	24372575
18114	NC_004347	CA	3	6	1016908	1016913	50 %	0 %	0 %	50 %	24372575
18115	NC_004347	GCCT	2	8	1017008	1017015	0 %	25 %	25 %	50 %	24372575
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18120	NC_004347	AAGT	2	8	1017143	1017150	50 %	25 %	25 %	0 %	24372575
18121	NC_004347	GAC	2	6	1017202	1017207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372575
18122	NC_004347	TAAA	2	8	1017274	1017281	75 %	25 %	0 %	0 %	24372575
18123	NC_004347	TC	3	6	1017395	1017400	0 %	50 %	0 %	50 %	24372575
18124	NC_004347	TGC	2	6	1017452	1017457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372575
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18228	NC_004347	AACC	2	8	1023185	1023192	50 %	0 %	0 %	50 %	24372577
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18236	NC_004347	CTC	2	6	1023892	1023897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24372577
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18356	NC_004347	TGG	2	6	1030150	1030155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372585
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18359	NC_004347	CCA	2	6	1030418	1030423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372585
18360	NC_004347	TTA	2	6	1030447	1030452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372585
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18362	NC_004347	TTG	2	6	1030501	1030506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372585
18363	NC_004347	GTG	2	6	1030554	1030559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372585
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18369	NC_004347	AATA	2	8	1030972	1030979	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18370	NC_004347	T	6	6	1030999	1031004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18371	NC_004347	GAT	2	6	1031032	1031037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18372	NC_004347	GAT	2	6	1031127	1031132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372586
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18379	NC_004347	ATTG	2	8	1031387	1031394	25 %	50 %	25 %	0 %	24372586
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18424	NC_004347	TTGGG	2	10	1033920	1033929	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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18452	NC_004347	ATCC	2	8	1035221	1035228	25 %	25 %	0 %	50 %	24372588
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18467	NC_004347	CTG	2	6	1036230	1036235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372588
18468	NC_004347	CAT	2	6	1036248	1036253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372588
18469	NC_004347	TAT	2	6	1036337	1036342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372588
18470	NC_004347	GC	3	6	1036374	1036379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18471	NC_004347	TA	3	6	1036391	1036396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18472	NC_004347	T	7	7	1036407	1036413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18473	NC_004347	TA	3	6	1036445	1036450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18474	NC_004347	CAC	2	6	1036540	1036545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372589
18475	NC_004347	GGC	2	6	1036547	1036552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372589
18476	NC_004347	CTC	2	6	1036615	1036620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24372589
18477	NC_004347	CCTGC	2	10	1036645	1036654	0 %	20 %	20 %	60 %	24372589
18478	NC_004347	TTG	2	6	1036859	1036864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372589
18479	NC_004347	TTA	2	6	1036908	1036913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372589
18480	NC_004347	TCA	2	6	1036973	1036978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372589
18481	NC_004347	TTC	2	6	1037012	1037017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372589
18482	NC_004347	T	6	6	1037200	1037205	0 %	100 %	0 %	0 %	24372589
18483	NC_004347	CGA	2	6	1037219	1037224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372589
18484	NC_004347	GCT	3	9	1037319	1037327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372589
18485	NC_004347	GGT	2	6	1037365	1037370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372589
18486	NC_004347	T	7	7	1037370	1037376	0 %	100 %	0 %	0 %	24372589
18487	NC_004347	TTC	2	6	1037653	1037658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372589
18488	NC_004347	CA	3	6	1037692	1037697	50 %	0 %	0 %	50 %	24372589
18489	NC_004347	CTT	2	6	1037763	1037768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372589
18490	NC_004347	GGT	2	6	1037782	1037787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372589
18491	NC_004347	CCA	2	6	1037804	1037809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372589
18492	NC_004347	TA	3	6	1037865	1037870	50 %	50 %	0 %	0 %	24372589
18493	NC_004347	T	6	6	1037890	1037895	0 %	100 %	0 %	0 %	24372589
18494	NC_004347	AAGC	2	8	1037896	1037903	50 %	0 %	25 %	25 %	24372589
18495	NC_004347	TGT	2	6	1038012	1038017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372589
18496	NC_004347	A	6	6	1038039	1038044	100 %	0 %	0 %	0 %	24372589
18497	NC_004347	TAA	2	6	1038062	1038067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372589
18498	NC_004347	CTTT	2	8	1038296	1038303	0 %	75 %	0 %	25 %	414561842
18499	NC_004347	GGC	2	6	1038328	1038333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561842
18500	NC_004347	GCT	2	6	1038384	1038389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561842

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