MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_004347	GC	3	6	900438	900443	0 %	0 %	50 %	50 %	24372459
16002	NC_004347	ACC	2	6	900517	900522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372459
16003	NC_004347	GTG	2	6	900659	900664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372459
16004	NC_004347	CAG	2	6	900721	900726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372459
16005	NC_004347	ACGC	2	8	900745	900752	25 %	0 %	25 %	50 %	24372459
16006	NC_004347	CGG	2	6	900774	900779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372459
16007	NC_004347	ATC	2	6	900796	900801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372459
16008	NC_004347	CAT	2	6	900885	900890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372459
16009	NC_004347	GTG	2	6	900990	900995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_004347	AGT	2	6	901036	901041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372460
16011	NC_004347	TGA	2	6	901067	901072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372460
16012	NC_004347	GAT	2	6	901191	901196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372460
16013	NC_004347	TAG	2	6	901387	901392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372460
16014	NC_004347	ATT	2	6	901507	901512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372460
16015	NC_004347	CGA	3	9	901542	901550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561823
16016	NC_004347	G	6	6	901558	901563	0 %	0 %	100 %	0 %	414561823
16017	NC_004347	CAA	2	6	901636	901641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561823
16018	NC_004347	CCA	2	6	901649	901654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561823
16019	NC_004347	CAC	2	6	901690	901695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561823
16020	NC_004347	CAGTAA	2	12	901697	901708	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414561823
16021	NC_004347	GC	3	6	901752	901757	0 %	0 %	50 %	50 %	414561823
16022	NC_004347	TGC	2	6	901848	901853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561823
16023	NC_004347	CGC	2	6	901871	901876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561823
16024	NC_004347	TCT	2	6	901920	901925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561823
16025	NC_004347	CGC	2	6	901955	901960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561823
16026	NC_004347	ATC	2	6	902003	902008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561823
16027	NC_004347	ATG	2	6	902019	902024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561823
16028	NC_004347	CAT	2	6	902117	902122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561823
16029	NC_004347	GAA	2	6	902150	902155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561823
16030	NC_004347	CTT	2	6	902167	902172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561823
16031	NC_004347	GC	3	6	902180	902185	0 %	0 %	50 %	50 %	414561823
16032	NC_004347	GTG	2	6	902206	902211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561823
16033	NC_004347	TCG	2	6	902241	902246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561823
16034	NC_004347	CCG	3	9	902367	902375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561823
16035	NC_004347	GTG	2	6	902528	902533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561823
16036	NC_004347	CGA	2	6	902595	902600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561823
16037	NC_004347	ACA	2	6	902604	902609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561823
16038	NC_004347	T	6	6	902627	902632	0 %	100 %	0 %	0 %	414561823
16039	NC_004347	TTC	2	6	902636	902641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561823
16040	NC_004347	GAG	2	6	902687	902692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414561823
16041	NC_004347	CCCA	2	8	902708	902715	25 %	0 %	0 %	75 %	414561823
16042	NC_004347	GCC	2	6	902831	902836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561823
16043	NC_004347	GCT	2	6	902911	902916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561823
16044	NC_004347	GGC	2	6	902985	902990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16045	NC_004347	TA	3	6	903019	903024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_004347	ACG	2	6	903044	903049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16047	NC_004347	TTAAG	2	10	903094	903103	40 %	40 %	20 %	0 %	24372462
16048	NC_004347	TGC	2	6	903177	903182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372462
16049	NC_004347	A	6	6	903211	903216	100 %	0 %	0 %	0 %	24372462
16050	NC_004347	TGC	2	6	903247	903252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372462
16051	NC_004347	GGC	2	6	903371	903376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372462
16052	NC_004347	TCAA	2	8	903385	903392	50 %	25 %	0 %	25 %	24372462
16053	NC_004347	TGG	2	6	903424	903429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372462
16054	NC_004347	ATA	2	6	903484	903489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372462
16055	NC_004347	GCG	2	6	903596	903601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372462
16056	NC_004347	TTTG	2	8	903650	903657	0 %	75 %	25 %	0 %	24372462
16057	NC_004347	GC	3	6	903729	903734	0 %	0 %	50 %	50 %	24372462
16058	NC_004347	ATC	2	6	903795	903800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372462
16059	NC_004347	GGC	2	6	903801	903806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372462
16060	NC_004347	TGG	2	6	903822	903827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372462
16061	NC_004347	ACC	2	6	903858	903863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372462
16062	NC_004347	GC	3	6	903870	903875	0 %	0 %	50 %	50 %	24372462
16063	NC_004347	GCG	2	6	903895	903900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372462
16064	NC_004347	CGAAGG	2	12	903927	903938	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	24372462
16065	NC_004347	CAT	2	6	903993	903998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372462
16066	NC_004347	GGA	2	6	904072	904077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_004347	TCT	2	6	904262	904267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372463
16068	NC_004347	T	6	6	904272	904277	0 %	100 %	0 %	0 %	24372463
16069	NC_004347	TCT	2	6	904293	904298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372463
16070	NC_004347	CG	3	6	904320	904325	0 %	0 %	50 %	50 %	24372463
16071	NC_004347	CTT	2	6	904347	904352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372463
16072	NC_004347	TGC	2	6	904357	904362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372463
16073	NC_004347	TGC	2	6	904387	904392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372463
16074	NC_004347	CTC	2	6	904498	904503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24372463
16075	NC_004347	T	6	6	904555	904560	0 %	100 %	0 %	0 %	24372463
16076	NC_004347	TCA	2	6	904589	904594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16077	NC_004347	CTAT	2	8	904628	904635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16078	NC_004347	TTTCA	2	10	904663	904672	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16079	NC_004347	TGAAA	2	10	904706	904715	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_004347	CAT	2	6	904737	904742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372464
16081	NC_004347	T	6	6	904832	904837	0 %	100 %	0 %	0 %	24372464
16082	NC_004347	TG	3	6	904864	904869	0 %	50 %	50 %	0 %	24372464
16083	NC_004347	CAC	2	6	904904	904909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372464
16084	NC_004347	TA	3	6	905042	905047	50 %	50 %	0 %	0 %	24372464
16085	NC_004347	T	6	6	905056	905061	0 %	100 %	0 %	0 %	24372464
16086	NC_004347	ACTTC	2	10	905107	905116	20 %	40 %	0 %	40 %	24372464
16087	NC_004347	GCG	2	6	905117	905122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372464
16088	NC_004347	TGA	2	6	905149	905154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372464
16089	NC_004347	TTA	2	6	905160	905165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372464
16090	NC_004347	GTC	2	6	905229	905234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372464
16091	NC_004347	GCC	2	6	905564	905569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16092	NC_004347	ATGT	2	8	905575	905582	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_004347	TGA	2	6	905637	905642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372465
16094	NC_004347	GCGTT	2	10	905643	905652	0 %	40 %	40 %	20 %	24372465
16095	NC_004347	GGC	2	6	905761	905766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372465
16096	NC_004347	GCG	2	6	905892	905897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372465
16097	NC_004347	TC	3	6	905980	905985	0 %	50 %	0 %	50 %	24372465
16098	NC_004347	CAA	2	6	906002	906007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372465
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16101	NC_004347	CTT	2	6	906346	906351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372465
16102	NC_004347	TGC	2	6	906353	906358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372465
16103	NC_004347	TAT	2	6	906511	906516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372465
16104	NC_004347	GCA	2	6	906521	906526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372465
16105	NC_004347	GCT	2	6	906539	906544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372465
16106	NC_004347	GCCATT	2	12	906646	906657	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	24372465
16107	NC_004347	GCC	2	6	906711	906716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372465
16108	NC_004347	GGT	2	6	906728	906733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372465
16109	NC_004347	CGG	2	6	906736	906741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372465
16110	NC_004347	ACC	2	6	906860	906865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372465
16111	NC_004347	TTAA	2	8	906890	906897	50 %	50 %	0 %	0 %	24372465
16112	NC_004347	ATAAG	2	10	906935	906944	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_004347	CTG	2	6	906967	906972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_004347	GCGG	2	8	906990	906997	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16115	NC_004347	T	6	6	906998	907003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_004347	GCG	2	6	907045	907050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16117	NC_004347	ATG	2	6	907090	907095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561824
16118	NC_004347	ATT	2	6	907096	907101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561824
16119	NC_004347	TAA	2	6	907161	907166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561824
16120	NC_004347	ATG	2	6	907184	907189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561824
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16122	NC_004347	TCG	2	6	907244	907249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561824
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16240	NC_004347	G	6	6	913660	913665	0 %	0 %	100 %	0 %	24372474
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16493	NC_004347	TA	3	6	928700	928705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16494	NC_004347	GTTAA	2	10	928706	928715	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16495	NC_004347	T	6	6	928815	928820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16496	NC_004347	TTAC	2	8	928828	928835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16497	NC_004347	AACA	2	8	928878	928885	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16498	NC_004347	A	6	6	928963	928968	100 %	0 %	0 %	0 %	24372490
16499	NC_004347	ATC	2	6	929005	929010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372490
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