MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_004347	CTC	2	6	814247	814252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24372390
14502	NC_004347	TGG	2	6	814388	814393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_004347	GT	3	6	814427	814432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_004347	T	7	7	814477	814483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_004347	TGA	2	6	814567	814572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_004347	TCA	2	6	814635	814640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14507	NC_004347	CAA	2	6	814716	814721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372391
14508	NC_004347	CAT	2	6	814730	814735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372391
14509	NC_004347	TGC	2	6	814768	814773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372391
14510	NC_004347	ATT	2	6	814813	814818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372391
14511	NC_004347	GCA	2	6	814833	814838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372391
14512	NC_004347	CAC	2	6	814847	814852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372391
14513	NC_004347	T	6	6	814863	814868	0 %	100 %	0 %	0 %	24372391
14514	NC_004347	ATG	2	6	814869	814874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372391
14515	NC_004347	GAT	2	6	814883	814888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372391
14516	NC_004347	AAT	2	6	814923	814928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372391
14517	NC_004347	GTTTAG	2	12	814984	814995	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	24372391
14518	NC_004347	GGT	2	6	814997	815002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372391
14519	NC_004347	T	7	7	815019	815025	0 %	100 %	0 %	0 %	24372391
14520	NC_004347	CTG	2	6	815091	815096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372391
14521	NC_004347	TGA	2	6	815125	815130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372391
14522	NC_004347	GCC	2	6	815142	815147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372391
14523	NC_004347	CTCG	2	8	815170	815177	0 %	25 %	25 %	50 %	24372391
14524	NC_004347	TGA	2	6	815206	815211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372391
14525	NC_004347	CCAG	2	8	815296	815303	25 %	0 %	25 %	50 %	24372391
14526	NC_004347	GCTG	2	8	815324	815331	0 %	25 %	50 %	25 %	24372391
14527	NC_004347	GCA	2	6	815386	815391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372391
14528	NC_004347	ATT	2	6	815466	815471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372391
14529	NC_004347	TCAG	2	8	815479	815486	25 %	25 %	25 %	25 %	24372391
14530	NC_004347	CT	3	6	815496	815501	0 %	50 %	0 %	50 %	24372391
14531	NC_004347	TTTA	2	8	815538	815545	25 %	75 %	0 %	0 %	24372391
14532	NC_004347	GGC	2	6	815570	815575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372391
14533	NC_004347	TAC	2	6	815592	815597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372391
14534	NC_004347	TGA	2	6	815615	815620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372391
14535	NC_004347	T	7	7	815688	815694	0 %	100 %	0 %	0 %	24372391
14536	NC_004347	GTTG	2	8	815716	815723	0 %	50 %	50 %	0 %	24372391
14537	NC_004347	TTA	2	6	815763	815768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372391
14538	NC_004347	ATT	2	6	815811	815816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372391
14539	NC_004347	T	6	6	815904	815909	0 %	100 %	0 %	0 %	24372391
14540	NC_004347	GCTTG	2	10	815940	815949	0 %	40 %	40 %	20 %	24372391
14541	NC_004347	CGA	2	6	815960	815965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372391
14542	NC_004347	GATT	2	8	815977	815984	25 %	50 %	25 %	0 %	24372391
14543	NC_004347	ATA	3	9	816063	816071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_004347	TTCA	2	8	816092	816099	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14545	NC_004347	TTC	2	6	816260	816265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14546	NC_004347	CAG	2	6	816374	816379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372393
14547	NC_004347	TAA	2	6	816559	816564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372393
14548	NC_004347	GT	3	6	816601	816606	0 %	50 %	50 %	0 %	24372393
14549	NC_004347	TAA	2	6	816627	816632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372393
14550	NC_004347	TCC	2	6	816759	816764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24372393
14551	NC_004347	CGC	2	6	816800	816805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372393
14552	NC_004347	GTT	2	6	816871	816876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372393
14553	NC_004347	GAT	2	6	816877	816882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372393
14554	NC_004347	TAA	2	6	816938	816943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372393
14555	NC_004347	CCA	2	6	817157	817162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561814
14556	NC_004347	GTGA	2	8	817186	817193	25 %	25 %	50 %	0 %	414561814
14557	NC_004347	ATC	2	6	817294	817299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561814
14558	NC_004347	CGC	2	6	817364	817369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561814
14559	NC_004347	ATA	2	6	817438	817443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561814
14560	NC_004347	T	6	6	817470	817475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_004347	AGC	2	6	817540	817545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14562	NC_004347	TCT	2	6	817707	817712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14563	NC_004347	AAT	4	12	817718	817729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372395
14564	NC_004347	TCG	2	6	817745	817750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372395
14565	NC_004347	T	6	6	817754	817759	0 %	100 %	0 %	0 %	24372395
14566	NC_004347	TGA	3	9	817826	817834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372395
14567	NC_004347	CTG	2	6	817927	817932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372395
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14570	NC_004347	GTGAG	2	10	818137	818146	20 %	20 %	60 %	0 %	24372395
14571	NC_004347	GCG	2	6	818217	818222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372395
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14573	NC_004347	GCT	2	6	818339	818344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372395
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14582	NC_004347	TGC	2	6	818939	818944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372395
14583	NC_004347	CTG	2	6	819027	819032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372395
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14586	NC_004347	TAC	2	6	819246	819251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372395
14587	NC_004347	CTGC	2	8	819258	819265	0 %	25 %	25 %	50 %	24372395
14588	NC_004347	GGC	2	6	819287	819292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372395
14589	NC_004347	GAA	2	6	819423	819428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372395
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14591	NC_004347	TTG	2	6	819533	819538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14592	NC_004347	T	7	7	819556	819562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14593	NC_004347	TTA	2	6	819620	819625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14594	NC_004347	GCA	2	6	819634	819639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14595	NC_004347	GGT	2	6	819641	819646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14596	NC_004347	T	8	8	819646	819653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_004347	CGG	2	6	819678	819683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14598	NC_004347	TCCG	2	8	819894	819901	0 %	25 %	25 %	50 %	24372396
14599	NC_004347	TCG	2	6	819909	819914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372396
14600	NC_004347	GTG	3	9	819924	819932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372396
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14602	NC_004347	ACAA	2	8	820032	820039	75 %	0 %	0 %	25 %	24372396
14603	NC_004347	TTG	2	6	820074	820079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372396
14604	NC_004347	ATTG	2	8	820105	820112	25 %	50 %	25 %	0 %	24372396
14605	NC_004347	TGA	2	6	820114	820119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372396
14606	NC_004347	TTGG	2	8	820282	820289	0 %	50 %	50 %	0 %	24372396
14607	NC_004347	GAA	2	6	820322	820327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372396
14608	NC_004347	A	6	6	820351	820356	100 %	0 %	0 %	0 %	24372396
14609	NC_004347	T	6	6	820435	820440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_004347	CGA	2	6	820480	820485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14611	NC_004347	ATC	2	6	820559	820564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14612	NC_004347	T	6	6	820623	820628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14613	NC_004347	TCTT	2	8	820638	820645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14614	NC_004347	ATG	2	6	820681	820686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_004347	CAT	2	6	820722	820727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14616	NC_004347	A	6	6	820757	820762	100 %	0 %	0 %	0 %	24372397
14617	NC_004347	CGT	2	6	820814	820819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372397
14618	NC_004347	GAAGCA	2	12	820871	820882	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	24372397
14619	NC_004347	GTTG	2	8	820924	820931	0 %	50 %	50 %	0 %	24372397
14620	NC_004347	CAA	2	6	820936	820941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372397
14621	NC_004347	CGT	2	6	820943	820948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372397
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14623	NC_004347	GAT	2	6	821012	821017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372397
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14992	NC_004347	GTT	2	6	841575	841580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14993	NC_004347	TTA	2	6	841629	841634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14994	NC_004347	TTG	2	6	841656	841661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14995	NC_004347	TGC	3	9	841666	841674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14997	NC_004347	AC	3	6	841768	841773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14998	NC_004347	TTGA	2	8	841831	841838	25 %	50 %	25 %	0 %	24372415
14999	NC_004347	TTGGC	2	10	841883	841892	0 %	40 %	40 %	20 %	24372415
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