MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_004347	TTTG	2	8	727513	727520	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_004347	TGC	2	6	727533	727538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_004347	TA	3	6	727563	727568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_004347	CTT	2	6	727569	727574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_004347	CATT	2	8	727637	727644	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13006	NC_004347	CTT	2	6	727722	727727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_004347	GTT	2	6	727734	727739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_004347	T	6	6	727751	727756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_004347	TA	3	6	727836	727841	50 %	50 %	0 %	0 %	414561802
13010	NC_004347	T	7	7	727861	727867	0 %	100 %	0 %	0 %	414561802
13011	NC_004347	A	6	6	727873	727878	100 %	0 %	0 %	0 %	414561802
13012	NC_004347	T	6	6	727908	727913	0 %	100 %	0 %	0 %	414561802
13013	NC_004347	ATTT	2	8	727991	727998	25 %	75 %	0 %	0 %	414561802
13014	NC_004347	AT	3	6	728093	728098	50 %	50 %	0 %	0 %	414561802
13015	NC_004347	ATTTT	2	10	728116	728125	20 %	80 %	0 %	0 %	414561802
13016	NC_004347	TA	3	6	728144	728149	50 %	50 %	0 %	0 %	414561802
13017	NC_004347	TGTA	2	8	728171	728178	25 %	50 %	25 %	0 %	414561802
13018	NC_004347	ATT	2	6	728181	728186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561802
13019	NC_004347	CTT	2	6	728209	728214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561802
13020	NC_004347	TGT	3	9	728248	728256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561802
13021	NC_004347	ATCCCC	2	12	728274	728285	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	414561802
13022	NC_004347	TGT	2	6	728454	728459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561802
13023	NC_004347	AG	3	6	728485	728490	50 %	0 %	50 %	0 %	414561802
13024	NC_004347	TCC	2	6	728511	728516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414561802
13025	NC_004347	AAC	2	6	728530	728535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561802
13026	NC_004347	GTG	2	6	728567	728572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561802
13027	NC_004347	ATTT	2	8	728579	728586	25 %	75 %	0 %	0 %	414561802
13028	NC_004347	T	6	6	728584	728589	0 %	100 %	0 %	0 %	414561802
13029	NC_004347	ATA	2	6	728615	728620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561802
13030	NC_004347	T	7	7	728736	728742	0 %	100 %	0 %	0 %	414561802
13031	NC_004347	TCA	3	9	728761	728769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561802
13032	NC_004347	T	7	7	728783	728789	0 %	100 %	0 %	0 %	414561802
13033	NC_004347	GTA	2	6	728824	728829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561802
13034	NC_004347	TGC	2	6	728831	728836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561802
13035	NC_004347	TCT	2	6	728856	728861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561802
13036	NC_004347	TGTAG	2	10	728875	728884	20 %	40 %	40 %	0 %	414561802
13037	NC_004347	TAT	2	6	728937	728942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561802
13038	NC_004347	ATTT	2	8	728945	728952	25 %	75 %	0 %	0 %	414561802
13039	NC_004347	ATT	2	6	728953	728958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561802
13040	NC_004347	ATT	2	6	728980	728985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561802
13041	NC_004347	TTC	2	6	728997	729002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561802
13042	NC_004347	TC	3	6	729018	729023	0 %	50 %	0 %	50 %	414561802
13043	NC_004347	TAT	2	6	729026	729031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561802
13044	NC_004347	TCT	2	6	729052	729057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561802
13045	NC_004347	A	7	7	729071	729077	100 %	0 %	0 %	0 %	414561802
13046	NC_004347	CCA	2	6	729123	729128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561802
13047	NC_004347	AAAT	2	8	729170	729177	75 %	25 %	0 %	0 %	414561802
13048	NC_004347	TA	3	6	729184	729189	50 %	50 %	0 %	0 %	414561802
13049	NC_004347	GTTT	2	8	729231	729238	0 %	75 %	25 %	0 %	414561802
13050	NC_004347	AGT	2	6	729244	729249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561802
13051	NC_004347	AC	3	6	729251	729256	50 %	0 %	0 %	50 %	414561802
13052	NC_004347	T	8	8	729311	729318	0 %	100 %	0 %	0 %	414561802
13053	NC_004347	TTC	2	6	729341	729346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561802
13054	NC_004347	ATT	2	6	729366	729371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561802
13055	NC_004347	GTT	2	6	729374	729379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561802
13056	NC_004347	T	7	7	729384	729390	0 %	100 %	0 %	0 %	414561802
13057	NC_004347	ATTA	2	8	729404	729411	50 %	50 %	0 %	0 %	414561802
13058	NC_004347	GAA	2	6	729470	729475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561802
13059	NC_004347	T	6	6	729481	729486	0 %	100 %	0 %	0 %	414561802
13060	NC_004347	CAT	2	6	729487	729492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561802
13061	NC_004347	CTT	2	6	729503	729508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561802
13062	NC_004347	ATTA	2	8	729518	729525	50 %	50 %	0 %	0 %	414561802
13063	NC_004347	T	6	6	729585	729590	0 %	100 %	0 %	0 %	414561802
13064	NC_004347	GTT	2	6	729692	729697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561802
13065	NC_004347	TC	3	6	729719	729724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13066	NC_004347	TA	3	6	729739	729744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_004347	ATTA	2	8	729745	729752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_004347	A	6	6	729759	729764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_004347	T	6	6	729842	729847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_004347	TAT	2	6	729851	729856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_004347	AGT	2	6	729910	729915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561803
13072	NC_004347	ATT	2	6	729933	729938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561803
13073	NC_004347	AAG	2	6	729953	729958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561803
13074	NC_004347	GGCTA	2	10	729989	729998	20 %	20 %	40 %	20 %	414561803
13075	NC_004347	TAAG	2	8	730006	730013	50 %	25 %	25 %	0 %	414561803
13076	NC_004347	ATTC	2	8	730055	730062	25 %	50 %	0 %	25 %	414561803
13077	NC_004347	GTTCCT	2	12	730203	730214	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	414561803
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13079	NC_004347	TAA	2	6	730382	730387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_004347	AAT	2	6	730392	730397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_004347	TGGT	2	8	730413	730420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_004347	CCTTG	2	10	730490	730499	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13083	NC_004347	TTA	2	6	730608	730613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_004347	ATG	2	6	730641	730646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_004347	CATT	2	8	730774	730781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13086	NC_004347	ACA	2	6	730802	730807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13087	NC_004347	AGG	2	6	730993	730998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_004347	TCC	2	6	731012	731017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13089	NC_004347	A	6	6	731251	731256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_004347	TGCT	2	8	731293	731300	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13091	NC_004347	GTC	2	6	731406	731411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_004347	TGA	2	6	731413	731418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_004347	TGC	2	6	731446	731451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372305
13094	NC_004347	CGG	2	6	731491	731496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372305
13095	NC_004347	ATT	2	6	731522	731527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372305
13096	NC_004347	AGC	2	6	731620	731625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372305
13097	NC_004347	TGAG	2	8	731686	731693	25 %	25 %	50 %	0 %	24372305
13098	NC_004347	GCA	2	6	731702	731707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372305
13099	NC_004347	ATAA	2	8	731737	731744	75 %	25 %	0 %	0 %	24372305
13100	NC_004347	TCG	2	6	731757	731762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372306
13101	NC_004347	CTG	2	6	731840	731845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372306
13102	NC_004347	TCA	2	6	732074	732079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372306
13103	NC_004347	TGA	2	6	732099	732104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372306
13104	NC_004347	ATTG	2	8	732141	732148	25 %	50 %	25 %	0 %	24372306
13105	NC_004347	GGC	2	6	732154	732159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372306
13106	NC_004347	CG	3	6	732166	732171	0 %	0 %	50 %	50 %	24372306
13107	NC_004347	GT	3	6	732239	732244	0 %	50 %	50 %	0 %	24372306
13108	NC_004347	CCA	2	6	732300	732305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372306
13109	NC_004347	GGC	2	6	732366	732371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372306
13110	NC_004347	CGTAT	2	10	732445	732454	20 %	40 %	20 %	20 %	24372306
13111	NC_004347	TGG	2	6	732456	732461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372306
13112	NC_004347	CCGG	2	8	732462	732469	0 %	0 %	50 %	50 %	24372306
13113	NC_004347	TAA	2	6	732510	732515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372306
13114	NC_004347	ACG	2	6	732521	732526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372306
13115	NC_004347	ATT	2	6	732610	732615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372306
13116	NC_004347	GAA	2	6	732616	732621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372306
13117	NC_004347	GGGC	2	8	732707	732714	0 %	0 %	75 %	25 %	24372306
13118	NC_004347	GTG	2	6	732724	732729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372306
13119	NC_004347	GCA	2	6	732807	732812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372306
13120	NC_004347	AGCC	2	8	732889	732896	25 %	0 %	25 %	50 %	24372306
13121	NC_004347	AT	3	6	732927	732932	50 %	50 %	0 %	0 %	24372306
13122	NC_004347	GTG	2	6	732964	732969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372306
13123	NC_004347	TGA	2	6	732970	732975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372306
13124	NC_004347	TG	3	6	733000	733005	0 %	50 %	50 %	0 %	24372307
13125	NC_004347	GCT	2	6	733007	733012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372307
13126	NC_004347	CGT	2	6	733024	733029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372307
13127	NC_004347	CGC	2	6	733031	733036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372307
13128	NC_004347	CAATG	2	10	733101	733110	40 %	20 %	20 %	20 %	24372307
13129	NC_004347	GAAA	2	8	733163	733170	75 %	0 %	25 %	0 %	24372307
13130	NC_004347	GAT	2	6	733181	733186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372307
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13133	NC_004347	GAT	2	6	733486	733491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372308
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13136	NC_004347	CAT	2	6	733734	733739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13139	NC_004347	AAC	2	6	733915	733920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372309
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13143	NC_004347	GCA	2	6	734141	734146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372309
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13145	NC_004347	TTGA	2	8	734315	734322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13146	NC_004347	AG	3	6	734334	734339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13147	NC_004347	ATC	2	6	734453	734458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372310
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13242	NC_004347	GC	3	6	740611	740616	0 %	0 %	50 %	50 %	24372316
13243	NC_004347	GC	3	6	740634	740639	0 %	0 %	50 %	50 %	24372316
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13245	NC_004347	TCG	2	6	740755	740760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13247	NC_004347	CATTC	2	10	740815	740824	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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13497	NC_004347	A	6	6	754042	754047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13498	NC_004347	TGTT	2	8	754056	754063	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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