MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_004347	TCA	2	6	611264	611269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372178
11002	NC_004347	GAC	2	6	611352	611357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372178
11003	NC_004347	CATG	2	8	611450	611457	25 %	25 %	25 %	25 %	24372178
11004	NC_004347	TGT	2	6	611485	611490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372178
11005	NC_004347	TGT	2	6	611578	611583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372178
11006	NC_004347	TGC	2	6	611584	611589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372178
11007	NC_004347	ATG	2	6	611598	611603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372178
11008	NC_004347	ACTC	2	8	611639	611646	25 %	25 %	0 %	50 %	24372178
11009	NC_004347	ATC	2	6	611835	611840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372178
11010	NC_004347	GCT	2	6	611861	611866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372178
11011	NC_004347	TGC	2	6	611971	611976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_004347	TGA	2	6	612025	612030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372179
11013	NC_004347	ATT	2	6	612041	612046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372179
11014	NC_004347	TGC	2	6	612063	612068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372179
11015	NC_004347	TGG	2	6	612099	612104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372179
11016	NC_004347	CAT	2	6	612142	612147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372179
11017	NC_004347	GGC	2	6	612150	612155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372179
11018	NC_004347	TAT	2	6	612196	612201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372179
11019	NC_004347	GGCAA	2	10	612253	612262	40 %	0 %	40 %	20 %	24372179
11020	NC_004347	TCG	2	6	612264	612269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372179
11021	NC_004347	TTTATT	2	12	612311	612322	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	24372179
11022	NC_004347	GCT	2	6	612478	612483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372180
11023	NC_004347	ATC	2	6	612497	612502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372180
11024	NC_004347	CAT	2	6	612550	612555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372180
11025	NC_004347	CTA	2	6	612556	612561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372180
11026	NC_004347	TAA	2	6	612571	612576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372180
11027	NC_004347	GCTC	2	8	612610	612617	0 %	25 %	25 %	50 %	24372180
11028	NC_004347	AGG	2	6	612715	612720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24372180
11029	NC_004347	CAA	2	6	612838	612843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372180
11030	NC_004347	ATT	2	6	612924	612929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372180
11031	NC_004347	GGC	2	6	613046	613051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372180
11032	NC_004347	TAGC	2	8	613348	613355	25 %	25 %	25 %	25 %	24372181
11033	NC_004347	TTAA	2	8	613473	613480	50 %	50 %	0 %	0 %	24372181
11034	NC_004347	TAA	2	6	613489	613494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372181
11035	NC_004347	GTG	2	6	613542	613547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372181
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11037	NC_004347	CAAT	2	8	613750	613757	50 %	25 %	0 %	25 %	24372181
11038	NC_004347	ACC	2	6	613770	613775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372181
11039	NC_004347	ATC	2	6	613839	613844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372181
11040	NC_004347	TGG	2	6	613867	613872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372181
11041	NC_004347	ATC	2	6	613875	613880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372181
11042	NC_004347	GAT	2	6	613895	613900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372181
11043	NC_004347	GCT	3	9	613936	613944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372181
11044	NC_004347	TGG	2	6	613966	613971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372181
11045	NC_004347	AAGG	2	8	613991	613998	50 %	0 %	50 %	0 %	24372181
11046	NC_004347	A	6	6	614046	614051	100 %	0 %	0 %	0 %	24372181
11047	NC_004347	CAG	2	6	614057	614062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372181
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11049	NC_004347	TTTCGC	2	12	614198	614209	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	24372181
11050	NC_004347	CGG	2	6	614226	614231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372181
11051	NC_004347	TCAA	2	8	614235	614242	50 %	25 %	0 %	25 %	24372181
11052	NC_004347	TTAA	2	8	614253	614260	50 %	50 %	0 %	0 %	24372181
11053	NC_004347	A	6	6	614274	614279	100 %	0 %	0 %	0 %	24372181
11054	NC_004347	CAATA	2	10	614288	614297	60 %	20 %	0 %	20 %	24372181
11055	NC_004347	GCA	2	6	614311	614316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372181
11056	NC_004347	AGT	2	6	614335	614340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372181
11057	NC_004347	T	6	6	614401	614406	0 %	100 %	0 %	0 %	24372181
11058	NC_004347	T	6	6	614432	614437	0 %	100 %	0 %	0 %	24372181
11059	NC_004347	GACAAA	2	12	614594	614605	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	24372181
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11061	NC_004347	GCC	2	6	614793	614798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372181
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11063	NC_004347	CCA	2	6	614975	614980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372181
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11065	NC_004347	T	6	6	615135	615140	0 %	100 %	0 %	0 %	24372181
11066	NC_004347	TGT	2	6	615150	615155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372181
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11069	NC_004347	TGT	2	6	615243	615248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372181
11070	NC_004347	ATCT	2	8	615337	615344	25 %	50 %	0 %	25 %	24372181
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11080	NC_004347	GCT	2	6	615782	615787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372181
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11088	NC_004347	CTG	2	6	616133	616138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372181
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11092	NC_004347	GTT	2	6	616229	616234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372181
11093	NC_004347	GA	3	6	616277	616282	50 %	0 %	50 %	0 %	24372181
11094	NC_004347	A	6	6	616290	616295	100 %	0 %	0 %	0 %	24372181
11095	NC_004347	T	6	6	616403	616408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_004347	TGG	2	6	616421	616426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_004347	CGA	2	6	616455	616460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11099	NC_004347	G	6	6	616608	616613	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_004347	CGG	2	6	616614	616619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_004347	ACC	2	6	616625	616630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11102	NC_004347	GT	3	6	616670	616675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_004347	CCG	2	6	616707	616712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11104	NC_004347	GCA	2	6	616773	616778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11106	NC_004347	ATA	2	6	616902	616907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_004347	TAA	2	6	616934	616939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_004347	A	6	6	616973	616978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_004347	GAG	2	6	617001	617006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_004347	T	6	6	617081	617086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_004347	CAG	2	6	617123	617128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_004347	CA	3	6	617150	617155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11113	NC_004347	CCA	2	6	617214	617219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11114	NC_004347	CAG	2	6	617301	617306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561791
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11117	NC_004347	GGC	2	6	617519	617524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561791
11118	NC_004347	CTA	2	6	617559	617564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561791
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11120	NC_004347	CGA	2	6	617619	617624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561791
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11237	NC_004347	CAG	2	6	624958	624963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11239	NC_004347	TAT	2	6	625474	625479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372191
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11241	NC_004347	GGC	2	6	625507	625512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372191
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11245	NC_004347	AGTT	2	8	625698	625705	25 %	50 %	25 %	0 %	24372191
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11491	NC_004347	CAT	2	6	639215	639220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372205
11492	NC_004347	ACT	2	6	639290	639295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372205
11493	NC_004347	ATG	3	9	639616	639624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372205
11494	NC_004347	TAT	2	6	639681	639686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372205
11495	NC_004347	CT	3	6	639687	639692	0 %	50 %	0 %	50 %	24372205
11496	NC_004347	GAA	2	6	639693	639698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372205
11497	NC_004347	GTGA	2	8	639771	639778	25 %	25 %	50 %	0 %	24372205
11498	NC_004347	TAC	2	6	639810	639815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372205
11499	NC_004347	GAAC	2	8	639878	639885	50 %	0 %	25 %	25 %	24372205
11500	NC_004347	TGC	2	6	639943	639948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372205

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