MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_004347	GAT	2	6	581387	581392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372154
10502	NC_004347	CGGATA	2	12	581559	581570	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	24372154
10503	NC_004347	AAT	2	6	581630	581635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372154
10504	NC_004347	TGT	3	9	581656	581664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372154
10505	NC_004347	CGTG	2	8	581722	581729	0 %	25 %	50 %	25 %	24372154
10506	NC_004347	AAC	2	6	581823	581828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372154
10507	NC_004347	ATA	2	6	581856	581861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372154
10508	NC_004347	GT	3	6	581987	581992	0 %	50 %	50 %	0 %	24372154
10509	NC_004347	TGA	2	6	582123	582128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372154
10510	NC_004347	TCGATG	2	12	582174	582185	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	24372154
10511	NC_004347	ATT	2	6	582191	582196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372154
10512	NC_004347	GGGAA	2	10	582318	582327	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_004347	AGT	2	6	582391	582396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_004347	ACGA	2	8	582416	582423	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10515	NC_004347	GAG	2	6	582435	582440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_004347	CAA	2	6	582502	582507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10517	NC_004347	ATC	2	6	582759	582764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_004347	GAT	2	6	582809	582814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_004347	CAG	2	6	582839	582844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10520	NC_004347	A	6	6	582923	582928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_004347	CAGA	2	8	583028	583035	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10522	NC_004347	ATAA	2	8	583038	583045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_004347	AGT	2	6	583215	583220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_004347	AGGCTA	2	12	583236	583247	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10525	NC_004347	TGG	2	6	583318	583323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_004347	TTG	2	6	583346	583351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_004347	ATT	2	6	583484	583489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_004347	TCA	2	6	583533	583538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10529	NC_004347	AGT	2	6	583585	583590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_004347	TTA	2	6	583683	583688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_004347	GC	3	6	583760	583765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10532	NC_004347	TCT	2	6	583770	583775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10533	NC_004347	CGT	2	6	583793	583798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10534	NC_004347	CAG	2	6	583886	583891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10535	NC_004347	AGT	2	6	583908	583913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_004347	GCG	2	6	583925	583930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10537	NC_004347	AGGT	2	8	583956	583963	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_004347	TAA	2	6	584007	584012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_004347	TG	3	6	584032	584037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_004347	CCA	2	6	584172	584177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372155
10541	NC_004347	CAA	2	6	584203	584208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372155
10542	NC_004347	ATT	2	6	584277	584282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372155
10543	NC_004347	ATT	2	6	584292	584297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372155
10544	NC_004347	T	6	6	584358	584363	0 %	100 %	0 %	0 %	24372155
10545	NC_004347	TGA	2	6	584372	584377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372155
10546	NC_004347	GAT	2	6	584452	584457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372155
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10548	NC_004347	ACT	2	6	584640	584645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561787
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10550	NC_004347	GAG	2	6	584846	584851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_004347	GAC	2	6	584951	584956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10552	NC_004347	TGAG	2	8	584957	584964	25 %	25 %	50 %	0 %	414561788
10553	NC_004347	GTATTG	2	12	585011	585022	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414561788
10554	NC_004347	TGC	2	6	585031	585036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561788
10555	NC_004347	TGA	2	6	585061	585066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561788
10556	NC_004347	CT	3	6	585087	585092	0 %	50 %	0 %	50 %	414561788
10557	NC_004347	TAA	2	6	585112	585117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561788
10558	NC_004347	AGTT	2	8	585307	585314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_004347	AAC	2	6	585343	585348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561789
10560	NC_004347	TGG	2	6	585359	585364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561789
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10562	NC_004347	CGA	2	6	585425	585430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561789
10563	NC_004347	TAT	2	6	585451	585456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561789
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10570	NC_004347	TGG	2	6	585921	585926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561789
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10573	NC_004347	GAA	2	6	586003	586008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561789
10574	NC_004347	TGA	2	6	586011	586016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561789
10575	NC_004347	GCA	2	6	586060	586065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561789
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10579	NC_004347	GAC	2	6	586447	586452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561789
10580	NC_004347	TGT	2	6	586513	586518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_004347	GCC	2	6	586526	586531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372158
10582	NC_004347	TGC	2	6	586603	586608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372158
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10586	NC_004347	CGCTAA	2	12	586786	586797	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	24372158
10587	NC_004347	T	6	6	586823	586828	0 %	100 %	0 %	0 %	24372158
10588	NC_004347	GCC	2	6	586829	586834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372158
10589	NC_004347	CA	3	6	586908	586913	50 %	0 %	0 %	50 %	24372158
10590	NC_004347	AGC	2	6	587038	587043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372158
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10592	NC_004347	CAAGC	2	10	587063	587072	40 %	0 %	20 %	40 %	24372158
10593	NC_004347	A	6	6	587084	587089	100 %	0 %	0 %	0 %	24372158
10594	NC_004347	CACC	2	8	587178	587185	25 %	0 %	0 %	75 %	24372158
10595	NC_004347	GTG	2	6	587243	587248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372158
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10598	NC_004347	CGT	2	6	587305	587310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372158
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10606	NC_004347	GCT	2	6	587701	587706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372159
10607	NC_004347	TTG	2	6	587739	587744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372159
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10610	NC_004347	AGTTG	2	10	587933	587942	20 %	40 %	40 %	0 %	24372159
10611	NC_004347	CTTG	2	8	588053	588060	0 %	50 %	25 %	25 %	24372159
10612	NC_004347	TAT	2	6	588067	588072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372159
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10615	NC_004347	AT	3	6	588309	588314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_004347	TGT	2	6	588393	588398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372160
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10618	NC_004347	TGG	2	6	588430	588435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372160
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10995	NC_004347	CAAT	2	8	610944	610951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10996	NC_004347	CTTTT	2	10	610962	610971	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10997	NC_004347	CGA	2	6	611050	611055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372178
10998	NC_004347	TGA	2	6	611117	611122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372178
10999	NC_004347	CTG	2	6	611193	611198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372178
11000	NC_004347	ATCGAG	2	12	611232	611243	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	24372178

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