MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_004347	ATG	2	6	551941	551946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372123
10002	NC_004347	GTC	2	6	551995	552000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372123
10003	NC_004347	CTGC	2	8	552048	552055	0 %	25 %	25 %	50 %	24372123
10004	NC_004347	AGAAAT	2	12	552060	552071	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	24372123
10005	NC_004347	TGG	2	6	552093	552098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372123
10006	NC_004347	C	6	6	552174	552179	0 %	0 %	0 %	100 %	24372123
10007	NC_004347	CACT	3	12	552230	552241	25 %	25 %	0 %	50 %	24372123
10008	NC_004347	TGTT	2	8	552248	552255	0 %	75 %	25 %	0 %	24372123
10009	NC_004347	CCT	2	6	552329	552334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24372123
10010	NC_004347	A	6	6	552371	552376	100 %	0 %	0 %	0 %	24372123
10011	NC_004347	ATG	2	6	552439	552444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372123
10012	NC_004347	GCT	2	6	552459	552464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372123
10013	NC_004347	ACTG	2	8	552604	552611	25 %	25 %	25 %	25 %	24372123
10014	NC_004347	TG	3	6	552705	552710	0 %	50 %	50 %	0 %	24372123
10015	NC_004347	CTT	2	6	552734	552739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_004347	TG	3	6	552946	552951	0 %	50 %	50 %	0 %	24372124
10017	NC_004347	AAT	2	6	552994	552999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372124
10018	NC_004347	TTA	2	6	553106	553111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372124
10019	NC_004347	T	6	6	553146	553151	0 %	100 %	0 %	0 %	24372124
10020	NC_004347	ATGTA	2	10	553152	553161	40 %	40 %	20 %	0 %	24372124
10021	NC_004347	GAT	2	6	553176	553181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372124
10022	NC_004347	TCT	2	6	553184	553189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372124
10023	NC_004347	ATC	2	6	553212	553217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372124
10024	NC_004347	TCA	2	6	553241	553246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372124
10025	NC_004347	TCG	2	6	553292	553297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372124
10026	NC_004347	AATC	2	8	553353	553360	50 %	25 %	0 %	25 %	24372124
10027	NC_004347	TGTGG	2	10	553366	553375	0 %	40 %	60 %	0 %	24372124
10028	NC_004347	CAA	2	6	553403	553408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372124
10029	NC_004347	CTT	2	6	553423	553428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_004347	GCG	2	6	553435	553440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_004347	CAC	2	6	553544	553549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10032	NC_004347	GA	3	6	553620	553625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_004347	AGG	2	6	553645	553650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_004347	T	6	6	553765	553770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_004347	A	6	6	553832	553837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_004347	AT	4	8	553845	553852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_004347	T	6	6	553854	553859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_004347	AT	3	6	553861	553866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_004347	TA	3	6	553878	553883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_004347	T	7	7	553922	553928	0 %	100 %	0 %	0 %	24372126
10041	NC_004347	TTA	2	6	553962	553967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372126
10042	NC_004347	TG	6	12	553990	554001	0 %	50 %	50 %	0 %	24372126
10043	NC_004347	GGC	2	6	554009	554014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372126
10044	NC_004347	A	6	6	554061	554066	100 %	0 %	0 %	0 %	24372126
10045	NC_004347	GTTG	2	8	554075	554082	0 %	50 %	50 %	0 %	24372126
10046	NC_004347	CAG	2	6	554142	554147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372126
10047	NC_004347	TGA	2	6	554165	554170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372126
10048	NC_004347	GAGC	2	8	554229	554236	25 %	0 %	50 %	25 %	24372126
10049	NC_004347	GTT	2	6	554245	554250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372126
10050	NC_004347	GCT	2	6	554291	554296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372127
10051	NC_004347	C	6	6	554316	554321	0 %	0 %	0 %	100 %	24372127
10052	NC_004347	T	7	7	554334	554340	0 %	100 %	0 %	0 %	24372127
10053	NC_004347	CA	3	6	554344	554349	50 %	0 %	0 %	50 %	24372127
10054	NC_004347	GCAG	2	8	554426	554433	25 %	0 %	50 %	25 %	24372127
10055	NC_004347	AAC	2	6	554469	554474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372127
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10057	NC_004347	TGC	2	6	554572	554577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372127
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10059	NC_004347	TGC	2	6	554718	554723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372127
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10069	NC_004347	AT	3	6	555151	555156	50 %	50 %	0 %	0 %	24372128
10070	NC_004347	TG	3	6	555205	555210	0 %	50 %	50 %	0 %	24372128
10071	NC_004347	AC	3	6	555240	555245	50 %	0 %	0 %	50 %	24372128
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10079	NC_004347	ATT	2	6	555712	555717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372128
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10081	NC_004347	GTTG	2	8	555760	555767	0 %	50 %	50 %	0 %	24372128
10082	NC_004347	TGT	2	6	555780	555785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372128
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10091	NC_004347	TTAT	2	8	556095	556102	25 %	75 %	0 %	0 %	24372129
10092	NC_004347	TGC	2	6	556247	556252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372129
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10094	NC_004347	GGTA	2	8	556296	556303	25 %	25 %	50 %	0 %	24372129
10095	NC_004347	GTTG	2	8	556355	556362	0 %	50 %	50 %	0 %	24372129
10096	NC_004347	GCT	2	6	556372	556377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372129
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10099	NC_004347	TTATCT	2	12	556441	556452	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	24372129
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10103	NC_004347	CAT	2	6	556656	556661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372129
10104	NC_004347	CTG	2	6	556678	556683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372129
10105	NC_004347	GGC	2	6	556734	556739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372129
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10109	NC_004347	TAG	2	6	556829	556834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372129
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10112	NC_004347	CCG	2	6	556928	556933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372130
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10115	NC_004347	GCTT	2	8	557142	557149	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10116	NC_004347	TCG	2	6	557165	557170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10117	NC_004347	AGTC	2	8	557235	557242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10118	NC_004347	ATC	2	6	557300	557305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10119	NC_004347	GC	3	6	557359	557364	0 %	0 %	50 %	50 %	24372132
10120	NC_004347	CAC	2	6	557527	557532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372132
10121	NC_004347	TGA	2	6	557598	557603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372132
10122	NC_004347	GGT	2	6	557650	557655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372132
10123	NC_004347	AGA	2	6	557674	557679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372132
10124	NC_004347	ATC	2	6	557709	557714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372132
10125	NC_004347	CCG	2	6	557748	557753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372132
10126	NC_004347	ACC	2	6	557762	557767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372132
10127	NC_004347	CCGTGC	2	12	557893	557904	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	24372132
10128	NC_004347	TCAC	2	8	558023	558030	25 %	25 %	0 %	50 %	24372132
10129	NC_004347	GC	3	6	558052	558057	0 %	0 %	50 %	50 %	24372132
10130	NC_004347	CTA	2	6	558083	558088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372132
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10132	NC_004347	TG	3	6	558235	558240	0 %	50 %	50 %	0 %	24372132
10133	NC_004347	AATG	2	8	558248	558255	50 %	25 %	25 %	0 %	24372132
10134	NC_004347	GCC	2	6	558335	558340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372133
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10163	NC_004347	ATCG	2	8	560157	560164	25 %	25 %	25 %	25 %	24372134
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10171	NC_004347	A	6	6	560596	560601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10219	NC_004347	GT	3	6	563604	563609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10220	NC_004347	TTA	2	6	563672	563677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10221	NC_004347	TGC	2	6	563690	563695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10223	NC_004347	GTC	2	6	563986	563991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372137
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10227	NC_004347	TCTA	2	8	564185	564192	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10228	NC_004347	A	6	6	564214	564219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10229	NC_004347	T	6	6	564220	564225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10230	NC_004347	TTC	2	6	564242	564247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10231	NC_004347	CTTT	2	8	564346	564353	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10232	NC_004347	AAC	2	6	564414	564419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10233	NC_004347	ACA	2	6	564431	564436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10234	NC_004347	T	7	7	564509	564515	0 %	100 %	0 %	0 %	24372138
10235	NC_004347	GTTC	2	8	564525	564532	0 %	50 %	25 %	25 %	24372138
10236	NC_004347	TGC	2	6	564551	564556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372138
10237	NC_004347	TTC	2	6	564586	564591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372138
10238	NC_004347	GAA	2	6	564615	564620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372138
10239	NC_004347	AAC	2	6	564627	564632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372138
10240	NC_004347	GTG	2	6	564694	564699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372138
10241	NC_004347	TCT	2	6	564717	564722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372138
10242	NC_004347	ATT	2	6	564778	564783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372138
10243	NC_004347	GCA	2	6	564848	564853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372138
10244	NC_004347	AGG	2	6	564862	564867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24372138
10245	NC_004347	AG	3	6	564903	564908	50 %	0 %	50 %	0 %	24372138
10246	NC_004347	TCA	2	6	564919	564924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372138
10247	NC_004347	TCG	2	6	564992	564997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372138
10248	NC_004347	GTT	2	6	565164	565169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372138
10249	NC_004347	GAAT	2	8	565183	565190	50 %	25 %	25 %	0 %	24372138
10250	NC_004347	ATG	2	6	565246	565251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372138
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10255	NC_004347	GC	3	6	565570	565575	0 %	0 %	50 %	50 %	24372138
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10278	NC_004347	GCT	2	6	566713	566718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561782
10279	NC_004347	GC	4	8	566731	566738	0 %	0 %	50 %	50 %	414561782
10280	NC_004347	CTTG	2	8	566803	566810	0 %	50 %	25 %	25 %	414561782
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10282	NC_004347	TGA	2	6	566914	566919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561782
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10285	NC_004347	GT	3	6	567051	567056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10286	NC_004347	TAC	2	6	567066	567071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561783
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10290	NC_004347	AGCT	2	8	567471	567478	25 %	25 %	25 %	25 %	414561783
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10330	NC_004347	GCC	2	6	570484	570489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372141
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10333	NC_004347	TTAT	2	8	570596	570603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10334	NC_004347	CAT	2	6	570642	570647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10339	NC_004347	A	8	8	570817	570824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10347	NC_004347	ATC	2	6	571237	571242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10350	NC_004347	TCA	2	6	571632	571637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561784
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10353	NC_004347	GCA	2	6	571968	571973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561784
10354	NC_004347	CTT	2	6	571993	571998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561784
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10357	NC_004347	CAAT	2	8	572148	572155	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10358	NC_004347	AAT	2	6	572183	572188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561785
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10361	NC_004347	AAT	2	6	572322	572327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561785
10362	NC_004347	AC	3	6	572435	572440	50 %	0 %	0 %	50 %	414561785
10363	NC_004347	AGG	2	6	572459	572464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414561785
10364	NC_004347	GTT	2	6	572553	572558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10365	NC_004347	TAT	2	6	572617	572622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10366	NC_004347	TGA	2	6	572667	572672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372145
10367	NC_004347	ACTG	2	8	572764	572771	25 %	25 %	25 %	25 %	24372145
10368	NC_004347	TG	3	6	572836	572841	0 %	50 %	50 %	0 %	24372145
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10494	NC_004347	GCG	2	6	580919	580924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372154
10495	NC_004347	GTT	2	6	581052	581057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372154
10496	NC_004347	AAC	2	6	581087	581092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372154
10497	NC_004347	CCG	2	6	581124	581129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372154
10498	NC_004347	CGTA	2	8	581182	581189	25 %	25 %	25 %	25 %	24372154
10499	NC_004347	CGA	2	6	581239	581244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372154
10500	NC_004347	TCG	2	6	581372	581377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372154

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