MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_004347	CAG	2	6	441714	441719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372020
8003	NC_004347	GCG	2	6	441749	441754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372020
8004	NC_004347	GCT	2	6	441770	441775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372020
8005	NC_004347	CTG	2	6	441950	441955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372020
8006	NC_004347	CGA	2	6	442005	442010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372020
8007	NC_004347	ACT	2	6	442016	442021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372020
8008	NC_004347	GCTCCT	2	12	442076	442087	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	24372020
8009	NC_004347	AAG	2	6	442095	442100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372020
8010	NC_004347	TGC	3	9	442117	442125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372020
8011	NC_004347	GGTGC	2	10	442181	442190	0 %	20 %	60 %	20 %	24372020
8012	NC_004347	CTCA	2	8	442238	442245	25 %	25 %	0 %	50 %	24372020
8013	NC_004347	CAT	2	6	442273	442278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372020
8014	NC_004347	GAAG	2	8	442279	442286	50 %	0 %	50 %	0 %	24372020
8015	NC_004347	GAA	2	6	442421	442426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372020
8016	NC_004347	AGA	2	6	442446	442451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372020
8017	NC_004347	ACG	2	6	442554	442559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372020
8018	NC_004347	CGG	2	6	442560	442565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372020
8019	NC_004347	GAA	3	9	442567	442575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372020
8020	NC_004347	ATG	2	6	442607	442612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372020
8021	NC_004347	AGC	2	6	442664	442669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372020
8022	NC_004347	AGA	2	6	442689	442694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372020
8023	NC_004347	GCT	2	6	442857	442862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372020
8024	NC_004347	TGG	2	6	442888	442893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372020
8025	NC_004347	GT	3	6	442941	442946	0 %	50 %	50 %	0 %	24372020
8026	NC_004347	GGC	2	6	443050	443055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372020
8027	NC_004347	GCT	2	6	443123	443128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_004347	CTC	2	6	443227	443232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8029	NC_004347	CTG	2	6	443309	443314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372021
8030	NC_004347	GCG	2	6	443335	443340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372021
8031	NC_004347	GGT	2	6	443386	443391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372021
8032	NC_004347	GT	4	8	443390	443397	0 %	50 %	50 %	0 %	24372021
8033	NC_004347	GAA	2	6	443452	443457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372021
8034	NC_004347	TGC	2	6	443469	443474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372021
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8042	NC_004347	AAG	2	6	443780	443785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372021
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8053	NC_004347	T	6	6	444726	444731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_004347	AATGTG	2	12	444757	444768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_004347	AAGT	2	8	444815	444822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_004347	A	7	7	444832	444838	100 %	0 %	0 %	0 %	24372022
8057	NC_004347	TAA	2	6	444839	444844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372022
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8059	NC_004347	GGC	2	6	444996	445001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372022
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8083	NC_004347	ATGA	2	8	446686	446693	50 %	25 %	25 %	0 %	24372022
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8093	NC_004347	CT	3	6	447130	447135	0 %	50 %	0 %	50 %	24372022
8094	NC_004347	ATT	2	6	447172	447177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372022
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8102	NC_004347	GCACA	2	10	447715	447724	40 %	0 %	20 %	40 %	24372022
8103	NC_004347	CAGT	2	8	447907	447914	25 %	25 %	25 %	25 %	24372022
8104	NC_004347	CATT	2	8	447927	447934	25 %	50 %	0 %	25 %	24372022
8105	NC_004347	AGCGTA	2	12	447962	447973	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	24372022
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8109	NC_004347	AGC	2	6	448301	448306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372022
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8496	NC_004347	CAG	2	6	470221	470226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372037
8497	NC_004347	ACC	2	6	470227	470232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372037
8498	NC_004347	CCA	2	6	470313	470318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372037
8499	NC_004347	GAT	2	6	470350	470355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372037
8500	NC_004347	GCC	2	6	470428	470433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372037

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