MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
75001	NC_004347	GAT	2	6	4229599	4229604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75002	NC_004347	CTTA	2	8	4229842	4229849	25 %	50 %	0 %	25 %	24375564
75003	NC_004347	GGA	2	6	4229879	4229884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24375564
75004	NC_004347	ATG	2	6	4229912	4229917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24375564
75005	NC_004347	CCT	2	6	4229961	4229966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24375564
75006	NC_004347	CCAA	2	8	4229970	4229977	50 %	0 %	0 %	50 %	24375564
75007	NC_004347	CCAA	2	8	4230006	4230013	50 %	0 %	0 %	50 %	24375564
75008	NC_004347	GCGG	2	8	4230056	4230063	0 %	0 %	75 %	25 %	24375564
75009	NC_004347	GCA	2	6	4230165	4230170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375564
75010	NC_004347	TTA	2	6	4230182	4230187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24375564
75011	NC_004347	TAAGCT	2	12	4230222	4230233	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24375564
75012	NC_004347	GCA	2	6	4230329	4230334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375564
75013	NC_004347	ACA	2	6	4230349	4230354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24375564
75014	NC_004347	CCATT	2	10	4230381	4230390	20 %	40 %	0 %	40 %	24375564
75015	NC_004347	CTT	2	6	4230529	4230534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24375564
75016	NC_004347	A	6	6	4230543	4230548	100 %	0 %	0 %	0 %	24375564
75017	NC_004347	GAT	2	6	4230668	4230673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24375564
75018	NC_004347	ATG	2	6	4230698	4230703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24375564
75019	NC_004347	CGC	2	6	4230743	4230748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24375564
75020	NC_004347	CAA	2	6	4230770	4230775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24375564
75021	NC_004347	TGG	2	6	4230791	4230796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24375564
75022	NC_004347	ATG	2	6	4230869	4230874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24375564
75023	NC_004347	GGC	2	6	4230898	4230903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24375564
75024	NC_004347	ACA	2	6	4230988	4230993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24375564
75025	NC_004347	ATCAA	2	10	4231440	4231449	60 %	20 %	0 %	20 %	24375564
75026	NC_004347	CCA	2	6	4231477	4231482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24375564
75027	NC_004347	TGGCA	2	10	4231506	4231515	20 %	20 %	40 %	20 %	24375564
75028	NC_004347	TGA	2	6	4231540	4231545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24375564
75029	NC_004347	AACGA	2	10	4231559	4231568	60 %	0 %	20 %	20 %	24375564
75030	NC_004347	TACT	2	8	4231651	4231658	25 %	50 %	0 %	25 %	24375564
75031	NC_004347	GGT	2	6	4231673	4231678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24375564
75032	NC_004347	AGC	2	6	4231706	4231711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375564
75033	NC_004347	ATA	2	6	4231921	4231926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24375565
75034	NC_004347	AGA	2	6	4231946	4231951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24375565
75035	NC_004347	TTC	2	6	4232024	4232029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24375565
75036	NC_004347	AAT	2	6	4232083	4232088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24375565
75037	NC_004347	TCA	2	6	4232163	4232168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24375565
75038	NC_004347	CCCG	2	8	4232207	4232214	0 %	0 %	25 %	75 %	24375565
75039	NC_004347	GC	3	6	4232243	4232248	0 %	0 %	50 %	50 %	24375565
75040	NC_004347	AGGT	2	8	4232265	4232272	25 %	25 %	50 %	0 %	24375565
75041	NC_004347	CGAT	2	8	4232286	4232293	25 %	25 %	25 %	25 %	24375565
75042	NC_004347	GCT	2	6	4232365	4232370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24375565
75043	NC_004347	AAG	2	6	4232421	4232426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24375565
75044	NC_004347	GTG	2	6	4232523	4232528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24375565
75045	NC_004347	CGG	2	6	4232566	4232571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24375565
75046	NC_004347	GTAATC	2	12	4232627	4232638	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24375565
75047	NC_004347	GCTC	2	8	4232765	4232772	0 %	25 %	25 %	50 %	24375565
75048	NC_004347	TCG	2	6	4232844	4232849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24375565
75049	NC_004347	TAG	2	6	4232868	4232873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24375565
75050	NC_004347	ATC	2	6	4232957	4232962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24375565
75051	NC_004347	TGA	2	6	4233011	4233016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24375565
75052	NC_004347	TTA	2	6	4233066	4233071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24375565
75053	NC_004347	TGT	2	6	4233120	4233125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24375565
75054	NC_004347	AACA	2	8	4233276	4233283	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75055	NC_004347	CCCAT	2	10	4233284	4233293	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
75056	NC_004347	ATT	2	6	4233298	4233303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75057	NC_004347	TTA	3	9	4233362	4233370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75058	NC_004347	TTG	2	6	4233407	4233412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24375566
75059	NC_004347	ACG	2	6	4233449	4233454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375566
75060	NC_004347	CGC	2	6	4233622	4233627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24375566
75061	NC_004347	AT	3	6	4233636	4233641	50 %	50 %	0 %	0 %	24375566
75062	NC_004347	TCGC	2	8	4233685	4233692	0 %	25 %	25 %	50 %	24375566
75063	NC_004347	GTG	2	6	4233694	4233699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24375566
75064	NC_004347	CAC	2	6	4233942	4233947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75065	NC_004347	CCAATG	2	12	4234266	4234277	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	24375567
75066	NC_004347	ATT	2	6	4234292	4234297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24375567
75067	NC_004347	TGC	2	6	4234357	4234362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24375567
75068	NC_004347	CGGGT	2	10	4234405	4234414	0 %	20 %	60 %	20 %	24375567
75069	NC_004347	CTTG	2	8	4234510	4234517	0 %	50 %	25 %	25 %	24375567
75070	NC_004347	AGC	2	6	4234706	4234711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375567
75071	NC_004347	GCA	2	6	4234806	4234811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375567
75072	NC_004347	CGG	2	6	4234852	4234857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24375567
75073	NC_004347	TCA	2	6	4234928	4234933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24375567
75074	NC_004347	GGT	2	6	4235195	4235200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24375567
75075	NC_004347	ATC	2	6	4235215	4235220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24375567
75076	NC_004347	CGCAG	2	10	4235260	4235269	20 %	0 %	40 %	40 %	24375567
75077	NC_004347	TTTAG	2	10	4235282	4235291	20 %	60 %	20 %	0 %	24375567
75078	NC_004347	GTT	2	6	4235297	4235302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24375567
75079	NC_004347	GGC	2	6	4235303	4235308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24375567
75080	NC_004347	AG	3	6	4235338	4235343	50 %	0 %	50 %	0 %	24375567
75081	NC_004347	GTT	2	6	4235411	4235416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24375567
75082	NC_004347	CCAG	2	8	4235454	4235461	25 %	0 %	25 %	50 %	24375567
75083	NC_004347	CGA	3	9	4235517	4235525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375567
75084	NC_004347	ATG	2	6	4235550	4235555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24375567
75085	NC_004347	CGA	2	6	4235565	4235570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375567
75086	NC_004347	CGA	2	6	4235611	4235616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375567
75087	NC_004347	CAC	2	6	4235632	4235637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24375567
75088	NC_004347	GGGC	2	8	4235641	4235648	0 %	0 %	75 %	25 %	24375567
75089	NC_004347	ATC	2	6	4235724	4235729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24375567
75090	NC_004347	CAA	2	6	4235785	4235790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24375567
75091	NC_004347	AACT	2	8	4235851	4235858	50 %	25 %	0 %	25 %	24375567
75092	NC_004347	TGA	2	6	4235929	4235934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24375567
75093	NC_004347	CAAA	2	8	4236226	4236233	75 %	0 %	0 %	25 %	24375567
75094	NC_004347	CT	3	6	4236311	4236316	0 %	50 %	0 %	50 %	24375567
75095	NC_004347	CACTC	2	10	4236334	4236343	20 %	20 %	0 %	60 %	24375567
75096	NC_004347	AAT	2	6	4236365	4236370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24375567
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75098	NC_004347	ACC	2	6	4236407	4236412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24375567
75099	NC_004347	CAA	2	6	4236444	4236449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24375567
75100	NC_004347	CA	3	6	4236637	4236642	50 %	0 %	0 %	50 %	24375568
75101	NC_004347	GATT	2	8	4236678	4236685	25 %	50 %	25 %	0 %	24375568
75102	NC_004347	CCG	2	6	4236796	4236801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24375568
75103	NC_004347	CCA	2	6	4236817	4236822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24375568
75104	NC_004347	GC	3	6	4236917	4236922	0 %	0 %	50 %	50 %	24375568
75105	NC_004347	TTG	2	6	4236964	4236969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24375568
75106	NC_004347	CAA	2	6	4237127	4237132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24375568
75107	NC_004347	TTC	2	6	4237169	4237174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24375568
75108	NC_004347	AAG	2	6	4237203	4237208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24375568
75109	NC_004347	GCG	2	6	4237240	4237245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24375568
75110	NC_004347	ACGC	2	8	4237274	4237281	25 %	0 %	25 %	50 %	24375568
75111	NC_004347	ATC	2	6	4237512	4237517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24375568
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75113	NC_004347	T	7	7	4237581	4237587	0 %	100 %	0 %	0 %	24375568
75114	NC_004347	AAG	2	6	4237684	4237689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24375568
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75116	NC_004347	GCTTT	2	10	4237796	4237805	0 %	60 %	20 %	20 %	24375568
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75355	NC_004347	GCT	2	6	4251837	4251842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24375580
75356	NC_004347	AGT	2	6	4251845	4251850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24375580
75357	NC_004347	AT	3	6	4251852	4251857	50 %	50 %	0 %	0 %	24375580
75358	NC_004347	GTT	2	6	4251899	4251904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24375580
75359	NC_004347	TGG	2	6	4251975	4251980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24375580
75360	NC_004347	TCA	2	6	4252070	4252075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24375580
75361	NC_004347	CACC	2	8	4252119	4252126	25 %	0 %	0 %	75 %	24375580
75362	NC_004347	AACT	2	8	4252162	4252169	50 %	25 %	0 %	25 %	24375580
75363	NC_004347	T	6	6	4252276	4252281	0 %	100 %	0 %	0 %	24375580
75364	NC_004347	CAT	2	6	4252305	4252310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24375580
75365	NC_004347	CAC	2	6	4252311	4252316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414562228
75366	NC_004347	CAG	2	6	4252430	4252435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562228
75367	NC_004347	TCA	2	6	4252456	4252461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562228
75368	NC_004347	CAT	2	6	4252463	4252468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562228
75369	NC_004347	CGC	2	6	4252562	4252567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414562228
75370	NC_004347	CT	3	6	4252585	4252590	0 %	50 %	0 %	50 %	414562228
75371	NC_004347	ATG	3	9	4252738	4252746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562228
75372	NC_004347	CG	3	6	4252774	4252779	0 %	0 %	50 %	50 %	414562228
75373	NC_004347	TTC	2	6	4252818	4252823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562228
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75384	NC_004347	GAC	2	6	4253309	4253314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562228
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75386	NC_004347	CAC	2	6	4253445	4253450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414562228
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75388	NC_004347	GGC	2	6	4253601	4253606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414562228
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75390	NC_004347	GCG	2	6	4253673	4253678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414562228
75391	NC_004347	CTT	2	6	4253690	4253695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562228
75392	NC_004347	GCA	2	6	4253696	4253701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562228
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75394	NC_004347	AAATT	2	10	4253828	4253837	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75395	NC_004347	AGA	2	6	4253875	4253880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75396	NC_004347	ACA	2	6	4253999	4254004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24375582
75397	NC_004347	TCGAC	2	10	4254024	4254033	20 %	20 %	20 %	40 %	24375582
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75400	NC_004347	CA	3	6	4254127	4254132	50 %	0 %	0 %	50 %	24375582
75401	NC_004347	TCA	2	6	4254198	4254203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24375582
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75407	NC_004347	CGGCG	2	10	4254494	4254503	0 %	0 %	60 %	40 %	24375582
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75410	NC_004347	CCAT	2	8	4254640	4254647	25 %	25 %	0 %	50 %	24375583
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75434	NC_004347	CGTT	2	8	4255788	4255795	0 %	50 %	25 %	25 %	24375584
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75437	NC_004347	GCC	2	6	4256109	4256114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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75466	NC_004347	T	9	9	4257291	4257299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75467	NC_004347	TGA	2	6	4257346	4257351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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