MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_004337	ATC	2	6	1031923	1031928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112394
21002	NC_004337	CTTT	2	8	1031957	1031964	0 %	75 %	0 %	25 %	24112394
21003	NC_004337	ACCAT	2	10	1032110	1032119	40 %	20 %	0 %	40 %	24112394
21004	NC_004337	TTCAG	2	10	1032314	1032323	20 %	40 %	20 %	20 %	24112394
21005	NC_004337	GCA	2	6	1032354	1032359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112394
21006	NC_004337	ATA	2	6	1032519	1032524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21007	NC_004337	GATC	2	8	1032565	1032572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21008	NC_004337	TGC	2	6	1032586	1032591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21009	NC_004337	TGG	2	6	1032593	1032598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21010	NC_004337	GC	3	6	1032676	1032681	0 %	0 %	50 %	50 %	344915243
21011	NC_004337	CAG	2	6	1032866	1032871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915243
21012	NC_004337	GCA	2	6	1033007	1033012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915243
21013	NC_004337	TCG	2	6	1033135	1033140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479788
21014	NC_004337	CAG	2	6	1033145	1033150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479788
21015	NC_004337	GCG	2	6	1033177	1033182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479788
21016	NC_004337	TTCCG	2	10	1033223	1033232	0 %	40 %	20 %	40 %	56479788
21017	NC_004337	ATC	2	6	1033454	1033459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479788
21018	NC_004337	AATA	2	8	1033469	1033476	75 %	25 %	0 %	0 %	56479788
21019	NC_004337	GCA	2	6	1033492	1033497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479788
21020	NC_004337	CAC	2	6	1033574	1033579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479788
21021	NC_004337	CCGC	2	8	1033608	1033615	0 %	0 %	25 %	75 %	56479788
21022	NC_004337	ATG	2	6	1033632	1033637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479788
21023	NC_004337	GCT	2	6	1033660	1033665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479788
21024	NC_004337	CGC	2	6	1033715	1033720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479788
21025	NC_004337	GGT	2	6	1033901	1033906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479788
21026	NC_004337	CGATA	2	10	1033954	1033963	40 %	20 %	20 %	20 %	56479788
21027	NC_004337	TGC	2	6	1033980	1033985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479788
21028	NC_004337	GC	3	6	1034022	1034027	0 %	0 %	50 %	50 %	56479788
21029	NC_004337	ATCA	2	8	1034033	1034040	50 %	25 %	0 %	25 %	56479788
21030	NC_004337	GATA	2	8	1034056	1034063	50 %	25 %	25 %	0 %	56479788
21031	NC_004337	AATGT	2	10	1034235	1034244	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21032	NC_004337	CCA	2	6	1034331	1034336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112397
21033	NC_004337	ACC	2	6	1034361	1034366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112397
21034	NC_004337	GCGGTT	2	12	1034369	1034380	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	24112397
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21037	NC_004337	GCC	2	6	1034475	1034480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112397
21038	NC_004337	CGC	2	6	1034497	1034502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112397
21039	NC_004337	TCA	2	6	1034572	1034577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112397
21040	NC_004337	CGG	2	6	1034594	1034599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112397
21041	NC_004337	AAT	2	6	1034635	1034640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24112397
21042	NC_004337	CAT	2	6	1034651	1034656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112397
21043	NC_004337	GCT	2	6	1034671	1034676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112397
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21047	NC_004337	GTT	2	6	1034933	1034938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112397
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21052	NC_004337	TCT	2	6	1035129	1035134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112397
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21054	NC_004337	GGCT	2	8	1035202	1035209	0 %	25 %	50 %	25 %	24112397
21055	NC_004337	TCT	2	6	1035265	1035270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112397
21056	NC_004337	GTG	2	6	1035444	1035449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112397
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21060	NC_004337	CGT	2	6	1035682	1035687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112397
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21068	NC_004337	CAA	2	6	1036229	1036234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112397
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21072	NC_004337	TCAG	2	8	1036357	1036364	25 %	25 %	25 %	25 %	24112397
21073	NC_004337	GCTG	2	8	1036452	1036459	0 %	25 %	50 %	25 %	24112398
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21083	NC_004337	CGC	2	6	1036894	1036899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112398
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21092	NC_004337	AT	3	6	1037539	1037544	50 %	50 %	0 %	0 %	24112399
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21095	NC_004337	TTAA	2	8	1037762	1037769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21097	NC_004337	TAT	2	6	1037814	1037819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21098	NC_004337	GTG	2	6	1037867	1037872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479789
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21100	NC_004337	ACT	2	6	1037918	1037923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479789
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21102	NC_004337	AGT	2	6	1038049	1038054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479789
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21106	NC_004337	CGT	2	6	1038109	1038114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479789
21107	NC_004337	TACG	2	8	1038186	1038193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21108	NC_004337	TA	3	6	1038265	1038270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21109	NC_004337	GC	3	6	1038286	1038291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21110	NC_004337	ATTA	2	8	1038402	1038409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21111	NC_004337	TTG	2	6	1038410	1038415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21112	NC_004337	AGC	2	6	1038586	1038591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21113	NC_004337	AG	3	6	1038601	1038606	50 %	0 %	50 %	0 %	24112401
21114	NC_004337	CTT	2	6	1038723	1038728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112401
21115	NC_004337	ACAA	2	8	1038807	1038814	75 %	0 %	0 %	25 %	24112401
21116	NC_004337	TAA	2	6	1038853	1038858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21117	NC_004337	CCG	2	6	1038882	1038887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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21119	NC_004337	AGAC	2	8	1038951	1038958	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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21483	NC_004337	CGC	2	6	1056330	1056335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21484	NC_004337	ATG	2	6	1056352	1056357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21485	NC_004337	AGA	2	6	1056417	1056422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21486	NC_004337	A	6	6	1056448	1056453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21487	NC_004337	T	7	7	1056514	1056520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21488	NC_004337	TCA	2	6	1056539	1056544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21489	NC_004337	CCG	2	6	1056545	1056550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21490	NC_004337	CGG	2	6	1056557	1056562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21491	NC_004337	TGA	2	6	1056581	1056586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112418
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