MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_004337	ATA	2	6	785700	785705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_004337	ATTT	2	8	785768	785775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_004337	T	6	6	785797	785802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_004337	TGG	2	6	785851	785856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_004337	CG	3	6	785939	785944	0 %	0 %	50 %	50 %	24112174
16006	NC_004337	TCC	2	6	785962	785967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24112174
16007	NC_004337	CGG	2	6	786008	786013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112174
16008	NC_004337	GA	4	8	786066	786073	50 %	0 %	50 %	0 %	24112174
16009	NC_004337	AGT	2	6	786097	786102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112174
16010	NC_004337	A	6	6	786190	786195	100 %	0 %	0 %	0 %	24112174
16011	NC_004337	T	6	6	786214	786219	0 %	100 %	0 %	0 %	24112174
16012	NC_004337	AT	3	6	786225	786230	50 %	50 %	0 %	0 %	24112174
16013	NC_004337	ATG	2	6	786277	786282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_004337	CGC	2	6	786371	786376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112175
16015	NC_004337	TCA	2	6	786433	786438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112175
16016	NC_004337	CCA	2	6	786626	786631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112175
16017	NC_004337	CCGGG	2	10	786635	786644	0 %	0 %	60 %	40 %	24112175
16018	NC_004337	TCA	2	6	786655	786660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112175
16019	NC_004337	AAGC	2	8	786681	786688	50 %	0 %	25 %	25 %	24112175
16020	NC_004337	TGGC	2	8	786772	786779	0 %	25 %	50 %	25 %	24112175
16021	NC_004337	CAG	2	6	786799	786804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112175
16022	NC_004337	AG	3	6	786883	786888	50 %	0 %	50 %	0 %	24112175
16023	NC_004337	CAT	2	6	786907	786912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112175
16024	NC_004337	ACG	2	6	786930	786935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112175
16025	NC_004337	CCG	2	6	786966	786971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112175
16026	NC_004337	GCG	2	6	786974	786979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112175
16027	NC_004337	TGG	2	6	787042	787047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112175
16028	NC_004337	GAT	2	6	787099	787104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112175
16029	NC_004337	AG	3	6	787108	787113	50 %	0 %	50 %	0 %	24112175
16030	NC_004337	GTG	2	6	787161	787166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112175
16031	NC_004337	CCG	2	6	787175	787180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112175
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16033	NC_004337	A	7	7	787222	787228	100 %	0 %	0 %	0 %	24112175
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16039	NC_004337	GC	3	6	787398	787403	0 %	0 %	50 %	50 %	24112176
16040	NC_004337	CGCC	2	8	787407	787414	0 %	0 %	25 %	75 %	24112176
16041	NC_004337	T	6	6	787426	787431	0 %	100 %	0 %	0 %	24112176
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16048	NC_004337	ATA	2	6	787856	787861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24112176
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16052	NC_004337	GCGG	2	8	788043	788050	0 %	0 %	75 %	25 %	24112176
16053	NC_004337	AGCC	2	8	788065	788072	25 %	0 %	25 %	50 %	24112176
16054	NC_004337	CCG	2	6	788109	788114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112176
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16057	NC_004337	AGCC	2	8	788276	788283	25 %	0 %	25 %	50 %	24112176
16058	NC_004337	GCCA	2	8	788348	788355	25 %	0 %	25 %	50 %	24112176
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16063	NC_004337	GAAAA	2	10	788459	788468	80 %	0 %	20 %	0 %	24112176
16064	NC_004337	GCCA	2	8	788492	788499	25 %	0 %	25 %	50 %	24112176
16065	NC_004337	A	6	6	788537	788542	100 %	0 %	0 %	0 %	24112176
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16101	NC_004337	GCT	2	6	790096	790101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112177
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16109	NC_004337	ACCGGA	2	12	790409	790420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112177
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16251	NC_004337	GCCT	2	8	797712	797719	0 %	25 %	25 %	50 %	24112185
16252	NC_004337	T	6	6	797719	797724	0 %	100 %	0 %	0 %	24112185
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16284	NC_004337	A	6	6	798839	798844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16356	NC_004337	TGATG	2	10	803211	803220	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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16358	NC_004337	AG	3	6	803266	803271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16359	NC_004337	GC	3	6	803323	803328	0 %	0 %	50 %	50 %	24112189
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16367	NC_004337	CGT	2	6	804037	804042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112189
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16369	NC_004337	TGA	2	6	804184	804189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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