MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_004337	CGCTA	2	10	761041	761050	20 %	20 %	20 %	40 %	24112150
15502	NC_004337	CGA	2	6	761082	761087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112150
15503	NC_004337	GGT	2	6	761110	761115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112150
15504	NC_004337	GCT	2	6	761151	761156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112150
15505	NC_004337	GTT	2	6	761160	761165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112150
15506	NC_004337	TGT	2	6	761204	761209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112150
15507	NC_004337	ATC	2	6	761329	761334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112150
15508	NC_004337	TCCA	2	8	761372	761379	25 %	25 %	0 %	50 %	24112150
15509	NC_004337	GAA	2	6	761385	761390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24112150
15510	NC_004337	CGC	2	6	761420	761425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112151
15511	NC_004337	TGG	2	6	761440	761445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112151
15512	NC_004337	CGTG	2	8	761468	761475	0 %	25 %	50 %	25 %	24112151
15513	NC_004337	GCGG	2	8	761480	761487	0 %	0 %	75 %	25 %	24112151
15514	NC_004337	GAT	2	6	761522	761527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112151
15515	NC_004337	CCA	2	6	761540	761545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112151
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15517	NC_004337	GCC	2	6	761704	761709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112151
15518	NC_004337	GGC	2	6	761759	761764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112151
15519	NC_004337	GCG	2	6	761839	761844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112151
15520	NC_004337	GAT	2	6	761874	761879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112151
15521	NC_004337	T	7	7	761888	761894	0 %	100 %	0 %	0 %	56479728
15522	NC_004337	TGG	2	6	761912	761917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479728
15523	NC_004337	GCGCTG	2	12	762001	762012	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56479728
15524	NC_004337	GCTG	2	8	762027	762034	0 %	25 %	50 %	25 %	56479728
15525	NC_004337	CTGA	2	8	762070	762077	25 %	25 %	25 %	25 %	56479728
15526	NC_004337	CGA	2	6	762081	762086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479728
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15530	NC_004337	TGGC	2	8	762182	762189	0 %	25 %	50 %	25 %	24112153
15531	NC_004337	TTG	2	6	762318	762323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112153
15532	NC_004337	GCA	2	6	762432	762437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112153
15533	NC_004337	TAT	2	6	762460	762465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112153
15534	NC_004337	GGC	2	6	762556	762561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112153
15535	NC_004337	T	6	6	762575	762580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15536	NC_004337	TCA	2	6	762659	762664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15537	NC_004337	GGCT	2	8	762752	762759	0 %	25 %	50 %	25 %	56479729
15538	NC_004337	TTG	2	6	762804	762809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479729
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15540	NC_004337	TGT	2	6	762862	762867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479729
15541	NC_004337	ATC	2	6	762897	762902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479729
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15544	NC_004337	GCT	2	6	763035	763040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479729
15545	NC_004337	TCG	2	6	763057	763062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479729
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15549	NC_004337	T	7	7	763454	763460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_004337	GAGC	2	8	763510	763517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15551	NC_004337	T	6	6	763596	763601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15552	NC_004337	TGG	2	6	763711	763716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479730
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15555	NC_004337	TTA	3	9	763803	763811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56479730
15556	NC_004337	TGTA	2	8	763815	763822	25 %	50 %	25 %	0 %	56479730
15557	NC_004337	TAAG	2	8	763828	763835	50 %	25 %	25 %	0 %	56479730
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15562	NC_004337	TGG	2	6	763894	763899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479730
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15589	NC_004337	TCT	2	6	765286	765291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112156
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15594	NC_004337	AGCC	2	8	765428	765435	25 %	0 %	25 %	50 %	24112157
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15614	NC_004337	CAC	2	6	766213	766218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112157
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15991	NC_004337	TGA	2	6	785101	785106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112173
15992	NC_004337	CGA	2	6	785185	785190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112173
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15995	NC_004337	ACTG	2	8	785276	785283	25 %	25 %	25 %	25 %	24112173
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15997	NC_004337	GTA	2	6	785380	785385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15999	NC_004337	CGG	2	6	785492	785497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16000	NC_004337	GATGC	2	10	785656	785665	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

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