MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_004337	ATA	2	6	737492	737497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24112131
15002	NC_004337	GTA	2	6	737513	737518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112131
15003	NC_004337	TGG	2	6	737539	737544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112131
15004	NC_004337	A	6	6	737618	737623	100 %	0 %	0 %	0 %	24112131
15005	NC_004337	GC	3	6	737628	737633	0 %	0 %	50 %	50 %	24112131
15006	NC_004337	A	6	6	737635	737640	100 %	0 %	0 %	0 %	24112131
15007	NC_004337	CA	3	6	737661	737666	50 %	0 %	0 %	50 %	24112131
15008	NC_004337	CAG	2	6	737680	737685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112131
15009	NC_004337	A	6	6	737707	737712	100 %	0 %	0 %	0 %	24112131
15010	NC_004337	GCAG	2	8	737742	737749	25 %	0 %	50 %	25 %	24112131
15011	NC_004337	ATGA	2	8	737809	737816	50 %	25 %	25 %	0 %	24112131
15012	NC_004337	GCG	2	6	737893	737898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112131
15013	NC_004337	ATG	2	6	737960	737965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112131
15014	NC_004337	TGC	2	6	737981	737986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112131
15015	NC_004337	CAG	3	9	737995	738003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112131
15016	NC_004337	TGC	3	9	738024	738032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112131
15017	NC_004337	CAG	2	6	738041	738046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112131
15018	NC_004337	GCA	2	6	738096	738101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112131
15019	NC_004337	GCT	2	6	738189	738194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112131
15020	NC_004337	CAG	2	6	738205	738210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112131
15021	NC_004337	ACAG	2	8	738222	738229	50 %	0 %	25 %	25 %	24112131
15022	NC_004337	A	8	8	738246	738253	100 %	0 %	0 %	0 %	24112131
15023	NC_004337	CCAG	2	8	738266	738273	25 %	0 %	25 %	50 %	24112131
15024	NC_004337	AGC	2	6	738302	738307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112131
15025	NC_004337	AGC	2	6	738344	738349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112131
15026	NC_004337	GGA	2	6	738447	738452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24112131
15027	NC_004337	GAG	2	6	738466	738471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24112131
15028	NC_004337	TGAA	2	8	738500	738507	50 %	25 %	25 %	0 %	24112131
15029	NC_004337	CGG	2	6	738587	738592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112131
15030	NC_004337	GCG	2	6	738604	738609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112131
15031	NC_004337	CAG	2	6	738642	738647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112131
15032	NC_004337	ACC	2	6	738676	738681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112131
15033	NC_004337	TGT	2	6	738716	738721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112131
15034	NC_004337	ATG	2	6	738754	738759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112131
15035	NC_004337	CTG	2	6	738827	738832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112131
15036	NC_004337	GGT	2	6	738855	738860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112131
15037	NC_004337	T	6	6	738874	738879	0 %	100 %	0 %	0 %	24112131
15038	NC_004337	TGG	2	6	738981	738986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112131
15039	NC_004337	ACA	2	6	739016	739021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112131
15040	NC_004337	ACG	2	6	739034	739039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112131
15041	NC_004337	GGT	2	6	739074	739079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112131
15042	NC_004337	A	6	6	739093	739098	100 %	0 %	0 %	0 %	24112131
15043	NC_004337	CAG	2	6	739120	739125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112131
15044	NC_004337	TGG	2	6	739134	739139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112131
15045	NC_004337	GTG	2	6	739221	739226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112132
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15048	NC_004337	GGT	2	6	739412	739417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112132
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15050	NC_004337	TGAA	2	8	739518	739525	50 %	25 %	25 %	0 %	24112133
15051	NC_004337	GGT	2	6	739586	739591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112133
15052	NC_004337	T	6	6	739600	739605	0 %	100 %	0 %	0 %	24112133
15053	NC_004337	GGC	2	6	739650	739655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112133
15054	NC_004337	TGAAC	2	10	739690	739699	40 %	20 %	20 %	20 %	24112133
15055	NC_004337	TGC	2	6	739711	739716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112133
15056	NC_004337	CGG	2	6	739789	739794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112133
15057	NC_004337	GGT	2	6	739798	739803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112133
15058	NC_004337	AGG	2	6	739878	739883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24112133
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15060	NC_004337	GGGCA	2	10	740047	740056	20 %	0 %	60 %	20 %	24112133
15061	NC_004337	CAA	2	6	740079	740084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112133
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15063	NC_004337	CAA	2	6	740137	740142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112133
15064	NC_004337	CGG	2	6	740155	740160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112133
15065	NC_004337	TTTCC	2	10	740161	740170	0 %	60 %	0 %	40 %	24112133
15066	NC_004337	ACAG	2	8	740201	740208	50 %	0 %	25 %	25 %	24112134
15067	NC_004337	GTG	2	6	740265	740270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112134
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15069	NC_004337	GGA	2	6	740324	740329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24112134
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15072	NC_004337	TGAG	2	8	740425	740432	25 %	25 %	50 %	0 %	24112134
15073	NC_004337	CGG	2	6	740439	740444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112134
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15080	NC_004337	TGC	2	6	740719	740724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112134
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15087	NC_004337	GCC	2	6	740916	740921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112134
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15089	NC_004337	TGG	2	6	741117	741122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112135
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15091	NC_004337	CTG	2	6	741218	741223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112135
15092	NC_004337	TC	3	6	741227	741232	0 %	50 %	0 %	50 %	24112135
15093	NC_004337	GGT	2	6	741409	741414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112135
15094	NC_004337	TGG	2	6	741448	741453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112135
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15096	NC_004337	GCA	2	6	741549	741554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112136
15097	NC_004337	CG	3	6	741570	741575	0 %	0 %	50 %	50 %	24112136
15098	NC_004337	TGAT	2	8	741615	741622	25 %	50 %	25 %	0 %	24112136
15099	NC_004337	TGGA	2	8	741654	741661	25 %	25 %	50 %	0 %	24112136
15100	NC_004337	TGC	2	6	741672	741677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112136
15101	NC_004337	GGT	2	6	741733	741738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112136
15102	NC_004337	GAGCAG	2	12	741752	741763	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	24112136
15103	NC_004337	CCG	2	6	741767	741772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112136
15104	NC_004337	TGG	2	6	741900	741905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112136
15105	NC_004337	ACC	2	6	741908	741913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112136
15106	NC_004337	CTG	2	6	741947	741952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112136
15107	NC_004337	GGT	3	9	742036	742044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112136
15108	NC_004337	GCC	2	6	742054	742059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112136
15109	NC_004337	CAC	2	6	742102	742107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112136
15110	NC_004337	GTC	2	6	742135	742140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112136
15111	NC_004337	ATC	2	6	742151	742156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112136
15112	NC_004337	CAG	2	6	742226	742231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112136
15113	NC_004337	ATC	2	6	742245	742250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112136
15114	NC_004337	CAA	2	6	742345	742350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112136
15115	NC_004337	CTCA	2	8	742376	742383	25 %	25 %	0 %	50 %	24112136
15116	NC_004337	CAGT	2	8	742466	742473	25 %	25 %	25 %	25 %	24112136
15117	NC_004337	CGGA	2	8	742476	742483	25 %	0 %	50 %	25 %	24112136
15118	NC_004337	GGC	2	6	742487	742492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112136
15119	NC_004337	CA	3	6	742528	742533	50 %	0 %	0 %	50 %	24112136
15120	NC_004337	GACC	2	8	742622	742629	25 %	0 %	25 %	50 %	24112136
15121	NC_004337	GAT	2	6	742676	742681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112136
15122	NC_004337	GC	3	6	742683	742688	0 %	0 %	50 %	50 %	24112136
15123	NC_004337	GGA	2	6	742789	742794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24112136
15124	NC_004337	GATG	2	8	742834	742841	25 %	25 %	50 %	0 %	24112136
15125	NC_004337	CTG	2	6	742904	742909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112136
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15146	NC_004337	CTGA	2	8	744068	744075	25 %	25 %	25 %	25 %	24112136
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15202	NC_004337	ACA	2	6	746703	746708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15241	NC_004337	AG	3	6	749388	749393	50 %	0 %	50 %	0 %	24112140
15242	NC_004337	GA	3	6	749447	749452	50 %	0 %	50 %	0 %	24112140
15243	NC_004337	GGCT	2	8	749480	749487	0 %	25 %	50 %	25 %	24112140
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