MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_004337	TAC	2	6	661582	661587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112045
13502	NC_004337	ATC	2	6	661614	661619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112045
13503	NC_004337	CG	3	6	661740	661745	0 %	0 %	50 %	50 %	24112045
13504	NC_004337	ACA	2	6	661775	661780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112045
13505	NC_004337	CAT	2	6	661782	661787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112045
13506	NC_004337	GTC	2	6	661923	661928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112045
13507	NC_004337	AT	3	6	661944	661949	50 %	50 %	0 %	0 %	24112045
13508	NC_004337	GCC	2	6	661953	661958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112045
13509	NC_004337	ATT	2	6	662005	662010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112045
13510	NC_004337	CTG	2	6	662056	662061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112045
13511	NC_004337	TGCG	2	8	662129	662136	0 %	25 %	50 %	25 %	24112045
13512	NC_004337	GC	3	6	662146	662151	0 %	0 %	50 %	50 %	24112045
13513	NC_004337	GCA	2	6	662162	662167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112045
13514	NC_004337	CAA	2	6	662169	662174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112045
13515	NC_004337	CGG	2	6	662183	662188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112045
13516	NC_004337	GAT	2	6	662217	662222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112045
13517	NC_004337	ACC	2	6	662266	662271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112045
13518	NC_004337	TGC	2	6	662337	662342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112045
13519	NC_004337	TGA	2	6	662348	662353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112045
13520	NC_004337	CTT	2	6	662380	662385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13521	NC_004337	CAC	2	6	662539	662544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13522	NC_004337	GGTGC	2	10	662599	662608	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13523	NC_004337	ACAA	2	8	662620	662627	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13524	NC_004337	AAC	2	6	662709	662714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13525	NC_004337	AGA	2	6	662753	662758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_004337	CGC	2	6	662844	662849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479704
13527	NC_004337	GCA	2	6	662854	662859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479704
13528	NC_004337	GTC	2	6	662899	662904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479704
13529	NC_004337	TTA	2	6	662934	662939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56479704
13530	NC_004337	GTG	2	6	662956	662961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479704
13531	NC_004337	TTG	2	6	662990	662995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479704
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13533	NC_004337	CTG	2	6	663073	663078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479704
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13538	NC_004337	GTC	2	6	663241	663246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479704
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13541	NC_004337	A	6	6	663296	663301	100 %	0 %	0 %	0 %	56479704
13542	NC_004337	CAT	2	6	663312	663317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479704
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13550	NC_004337	T	6	6	663832	663837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_004337	T	7	7	663876	663882	0 %	100 %	0 %	0 %	24112047
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13555	NC_004337	TCG	2	6	663984	663989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112047
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13557	NC_004337	GCT	2	6	664120	664125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112047
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13581	NC_004337	AAG	2	6	665250	665255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24112048
13582	NC_004337	ATGGT	2	10	665291	665300	20 %	40 %	40 %	0 %	24112049
13583	NC_004337	A	6	6	665337	665342	100 %	0 %	0 %	0 %	24112049
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13589	NC_004337	CGA	2	6	665744	665749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112049
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13592	NC_004337	CGAA	2	8	665812	665819	50 %	0 %	25 %	25 %	24112049
13593	NC_004337	ATG	2	6	665829	665834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112049
13594	NC_004337	GTG	2	6	665835	665840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112049
13595	NC_004337	GAT	2	6	665937	665942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112049
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13597	NC_004337	CA	3	6	666089	666094	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13598	NC_004337	CAA	2	6	666103	666108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479705
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13602	NC_004337	GGC	2	6	666300	666305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479705
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13604	NC_004337	TGC	2	6	666502	666507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479705
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13607	NC_004337	CG	3	6	666723	666728	0 %	0 %	50 %	50 %	56479705
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13616	NC_004337	GGT	2	6	667080	667085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_004337	TTTC	2	8	667105	667112	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13618	NC_004337	AATT	2	8	667209	667216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13619	NC_004337	CCAT	2	8	667244	667251	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13620	NC_004337	AAT	2	6	667268	667273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_004337	AGA	2	6	667435	667440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13993	NC_004337	TGGTA	2	10	685172	685181	20 %	40 %	40 %	0 %	24112066
13994	NC_004337	GGA	2	6	685230	685235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24112066
13995	NC_004337	TGT	2	6	685300	685305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112066
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