MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_004337	GGA	2	6	637439	637444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56479697
13002	NC_004337	AGGTTG	2	12	637524	637535	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	56479697
13003	NC_004337	CGC	2	6	637619	637624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479697
13004	NC_004337	TCG	2	6	637704	637709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479697
13005	NC_004337	CCA	2	6	637768	637773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479697
13006	NC_004337	CCA	2	6	637800	637805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479697
13007	NC_004337	ACC	2	6	637826	637831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479697
13008	NC_004337	CGG	2	6	637838	637843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479697
13009	NC_004337	T	6	6	637889	637894	0 %	100 %	0 %	0 %	56479697
13010	NC_004337	TTC	2	6	638075	638080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56479697
13011	NC_004337	GC	3	6	638129	638134	0 %	0 %	50 %	50 %	56479697
13012	NC_004337	ATA	2	6	638207	638212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56479697
13013	NC_004337	AATCA	2	10	638237	638246	60 %	20 %	0 %	20 %	56479697
13014	NC_004337	TGT	2	6	638250	638255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479697
13015	NC_004337	TCAA	2	8	638335	638342	50 %	25 %	0 %	25 %	56479698
13016	NC_004337	CCG	2	6	638345	638350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479698
13017	NC_004337	ATG	2	6	638368	638373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479698
13018	NC_004337	TGC	2	6	638384	638389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479698
13019	NC_004337	GGTGTT	2	12	638400	638411	0 %	50 %	50 %	0 %	56479698
13020	NC_004337	CAG	2	6	638472	638477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479698
13021	NC_004337	ACA	2	6	638573	638578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479698
13022	NC_004337	GCA	2	6	638579	638584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479698
13023	NC_004337	CGCT	2	8	638598	638605	0 %	25 %	25 %	50 %	56479698
13024	NC_004337	GCTTC	2	10	638678	638687	0 %	40 %	20 %	40 %	56479698
13025	NC_004337	AGC	2	6	638730	638735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479698
13026	NC_004337	GCG	2	6	638746	638751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479698
13027	NC_004337	TGGC	2	8	638809	638816	0 %	25 %	50 %	25 %	56479698
13028	NC_004337	TCA	3	9	638833	638841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479698
13029	NC_004337	CAGTG	2	10	638866	638875	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13030	NC_004337	TTG	2	6	638973	638978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_004337	ATA	2	6	639003	639008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_004337	A	7	7	639027	639033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_004337	CG	3	6	639059	639064	0 %	0 %	50 %	50 %	24112028
13034	NC_004337	AAT	2	6	639086	639091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24112028
13035	NC_004337	ATC	2	6	639176	639181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112028
13036	NC_004337	GA	3	6	639214	639219	50 %	0 %	50 %	0 %	24112028
13037	NC_004337	TTG	2	6	639255	639260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112028
13038	NC_004337	TGG	2	6	639369	639374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112028
13039	NC_004337	CGAT	2	8	639375	639382	25 %	25 %	25 %	25 %	24112028
13040	NC_004337	ATG	2	6	639414	639419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112028
13041	NC_004337	AGCA	2	8	639471	639478	50 %	0 %	25 %	25 %	24112028
13042	NC_004337	GCA	3	9	639476	639484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112028
13043	NC_004337	GAA	2	6	639506	639511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24112028
13044	NC_004337	TTG	2	6	639540	639545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112028
13045	NC_004337	CCCTG	2	10	639631	639640	0 %	20 %	20 %	60 %	24112028
13046	NC_004337	GGC	2	6	639650	639655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112028
13047	NC_004337	TGA	2	6	639685	639690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112028
13048	NC_004337	CG	3	6	639846	639851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13049	NC_004337	TAT	2	6	639882	639887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56479699
13050	NC_004337	GC	3	6	639889	639894	0 %	0 %	50 %	50 %	56479699
13051	NC_004337	ATCC	2	8	639896	639903	25 %	25 %	0 %	50 %	56479699
13052	NC_004337	GAC	2	6	640009	640014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479699
13053	NC_004337	CG	3	6	640033	640038	0 %	0 %	50 %	50 %	56479699
13054	NC_004337	TAA	2	6	640055	640060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56479699
13055	NC_004337	GCA	2	6	640202	640207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479699
13056	NC_004337	GGC	2	6	640211	640216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479699
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13058	NC_004337	AGA	2	6	640503	640508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479700
13059	NC_004337	CTG	3	9	640528	640536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479700
13060	NC_004337	CTT	2	6	640584	640589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56479700
13061	NC_004337	GATT	2	8	640605	640612	25 %	50 %	25 %	0 %	56479700
13062	NC_004337	CAT	2	6	640701	640706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479700
13063	NC_004337	CG	3	6	640712	640717	0 %	0 %	50 %	50 %	56479700
13064	NC_004337	GAC	2	6	640786	640791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479700
13065	NC_004337	CGA	2	6	640812	640817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479700
13066	NC_004337	CGA	2	6	640890	640895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479700
13067	NC_004337	TGATG	2	10	640909	640918	20 %	40 %	40 %	0 %	56479700
13068	NC_004337	AAT	2	6	640966	640971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_004337	TGT	2	6	640995	641000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_004337	TTA	2	6	641064	641069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_004337	CTT	2	6	641155	641160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13072	NC_004337	AAAG	2	8	641223	641230	75 %	0 %	25 %	0 %	24112031
13073	NC_004337	TTC	2	6	641273	641278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112031
13074	NC_004337	GAA	2	6	641341	641346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24112031
13075	NC_004337	GAC	2	6	641386	641391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112031
13076	NC_004337	CAC	2	6	641458	641463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112031
13077	NC_004337	TGA	2	6	641508	641513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112031
13078	NC_004337	AGCC	2	8	641646	641653	25 %	0 %	25 %	50 %	24112031
13079	NC_004337	T	6	6	641684	641689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_004337	TTA	2	6	641737	641742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56479701
13081	NC_004337	CTG	2	6	641820	641825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479701
13082	NC_004337	CTG	2	6	641862	641867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479701
13083	NC_004337	TGT	2	6	641869	641874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479701
13084	NC_004337	TCTT	2	8	641878	641885	0 %	75 %	0 %	25 %	56479701
13085	NC_004337	T	6	6	641918	641923	0 %	100 %	0 %	0 %	56479701
13086	NC_004337	CAT	2	6	642027	642032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479701
13087	NC_004337	T	6	6	642048	642053	0 %	100 %	0 %	0 %	56479701
13088	NC_004337	GGCA	2	8	642064	642071	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13089	NC_004337	AGA	2	6	642095	642100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24112033
13090	NC_004337	TCACG	2	10	642128	642137	20 %	20 %	20 %	40 %	24112033
13091	NC_004337	CCG	2	6	642163	642168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112033
13092	NC_004337	GTA	2	6	642306	642311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112033
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13094	NC_004337	CCA	2	6	642471	642476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112033
13095	NC_004337	GGC	2	6	642485	642490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112033
13096	NC_004337	GGA	2	6	642495	642500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24112033
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13098	NC_004337	GCC	2	6	642592	642597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112033
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13101	NC_004337	GCG	2	6	643013	643018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112033
13102	NC_004337	TTA	2	6	643147	643152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112033
13103	NC_004337	TTCG	2	8	643170	643177	0 %	50 %	25 %	25 %	24112033
13104	NC_004337	GCA	2	6	643222	643227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112033
13105	NC_004337	CAG	2	6	643247	643252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112033
13106	NC_004337	GGTT	2	8	643301	643308	0 %	50 %	50 %	0 %	24112033
13107	NC_004337	CCG	2	6	643369	643374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112033
13108	NC_004337	TCG	2	6	643387	643392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112033
13109	NC_004337	GCCAGC	2	12	643459	643470	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	24112033
13110	NC_004337	TAC	2	6	643472	643477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112033
13111	NC_004337	TGC	2	6	643526	643531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_004337	A	8	8	643549	643556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_004337	A	6	6	643565	643570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_004337	CGCGA	2	10	643617	643626	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13115	NC_004337	TGA	2	6	643683	643688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_004337	AGA	2	6	643729	643734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_004337	TTTA	2	8	643775	643782	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_004337	ATTT	2	8	643803	643810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_004337	AATT	2	8	643832	643839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_004337	GAA	2	6	643843	643848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_004337	A	6	6	643855	643860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_004337	CGC	2	6	643861	643866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13123	NC_004337	GCG	2	6	643872	643877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_004337	GCG	2	6	643908	643913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_004337	AT	3	6	643952	643957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_004337	AAGCG	2	10	643981	643990	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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13243	NC_004337	T	6	6	649062	649067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13244	NC_004337	G	6	6	649074	649079	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13245	NC_004337	TGA	2	6	649131	649136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112037
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13373	NC_004337	ACGC	2	8	655976	655983	25 %	0 %	25 %	50 %	56479702
13374	NC_004337	GTCC	2	8	655985	655992	0 %	25 %	25 %	50 %	56479702
13375	NC_004337	TGC	2	6	656002	656007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479702
13376	NC_004337	CG	3	6	656145	656150	0 %	0 %	50 %	50 %	56479702
13377	NC_004337	CCA	2	6	656291	656296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479702
13378	NC_004337	GCC	2	6	656565	656570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479702
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13380	NC_004337	GTTG	2	8	656602	656609	0 %	50 %	50 %	0 %	56479702
13381	NC_004337	ATC	2	6	656624	656629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13385	NC_004337	CTG	2	6	656836	656841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112041
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13428	NC_004337	CT	3	6	658225	658230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13429	NC_004337	AAT	2	6	658278	658283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13493	NC_004337	ACC	2	6	661192	661197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112045
13494	NC_004337	CT	3	6	661226	661231	0 %	50 %	0 %	50 %	24112045
13495	NC_004337	CTG	2	6	661360	661365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112045
13496	NC_004337	ATG	2	6	661366	661371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112045
13497	NC_004337	CTG	2	6	661381	661386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112045
13498	NC_004337	TGG	3	9	661421	661429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112045
13499	NC_004337	CGT	2	6	661431	661436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112045
13500	NC_004337	CTT	2	6	661561	661566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112045

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