MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_004337	CGC	2	6	614195	614200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112012
12502	NC_004337	GTT	2	6	614224	614229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112012
12503	NC_004337	TCG	2	6	614306	614311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_004337	AAAC	2	8	614337	614344	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12505	NC_004337	ATC	2	6	614373	614378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_004337	ATAA	2	8	614423	614430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_004337	CGC	2	6	614473	614478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12508	NC_004337	ATT	2	6	614513	614518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_004337	CG	3	6	614541	614546	0 %	0 %	50 %	50 %	24112013
12510	NC_004337	CTG	2	6	614609	614614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112013
12511	NC_004337	GTT	2	6	614767	614772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112013
12512	NC_004337	ATCC	2	8	614810	614817	25 %	25 %	0 %	50 %	24112013
12513	NC_004337	CGT	2	6	614921	614926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112013
12514	NC_004337	GCG	2	6	614951	614956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112013
12515	NC_004337	TAT	2	6	614971	614976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112013
12516	NC_004337	GGC	2	6	615037	615042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112013
12517	NC_004337	A	6	6	615116	615121	100 %	0 %	0 %	0 %	24112013
12518	NC_004337	TGCG	2	8	615126	615133	0 %	25 %	50 %	25 %	24112013
12519	NC_004337	GCT	2	6	615163	615168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112013
12520	NC_004337	CTG	2	6	615173	615178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112013
12521	NC_004337	TAT	2	6	615250	615255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112013
12522	NC_004337	CTT	2	6	615340	615345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112013
12523	NC_004337	TGT	2	6	615351	615356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112013
12524	NC_004337	GT	3	6	615492	615497	0 %	50 %	50 %	0 %	24112013
12525	NC_004337	GTGG	2	8	615505	615512	0 %	25 %	75 %	0 %	24112013
12526	NC_004337	AAAG	2	8	615515	615522	75 %	0 %	25 %	0 %	24112013
12527	NC_004337	CTTGGC	2	12	615566	615577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112013
12528	NC_004337	TGA	2	6	615579	615584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112013
12529	NC_004337	TGC	2	6	615774	615779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112013
12530	NC_004337	GGCG	2	8	615805	615812	0 %	0 %	75 %	25 %	24112013
12531	NC_004337	ACT	2	6	615864	615869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112013
12532	NC_004337	AT	3	6	615880	615885	50 %	50 %	0 %	0 %	24112013
12533	NC_004337	GT	3	6	615922	615927	0 %	50 %	50 %	0 %	24112013
12534	NC_004337	TGA	2	6	615939	615944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112013
12535	NC_004337	CG	3	6	615977	615982	0 %	0 %	50 %	50 %	24112013
12536	NC_004337	ATA	2	6	615997	616002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24112013
12537	NC_004337	CGC	2	6	616109	616114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12538	NC_004337	CGC	2	6	616165	616170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112014
12539	NC_004337	CGA	2	6	616316	616321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112014
12540	NC_004337	GCA	2	6	616388	616393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112014
12541	NC_004337	GCC	2	6	616409	616414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112014
12542	NC_004337	GCCA	2	8	616419	616426	25 %	0 %	25 %	50 %	24112014
12543	NC_004337	TTA	2	6	616430	616435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112014
12544	NC_004337	ATCA	2	8	616450	616457	50 %	25 %	0 %	25 %	24112014
12545	NC_004337	TCGC	2	8	616474	616481	0 %	25 %	25 %	50 %	24112014
12546	NC_004337	CAA	2	6	616498	616503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112014
12547	NC_004337	ATC	2	6	616529	616534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112014
12548	NC_004337	CCAG	2	8	616552	616559	25 %	0 %	25 %	50 %	24112014
12549	NC_004337	AAT	2	6	616588	616593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24112014
12550	NC_004337	TCA	2	6	616710	616715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112014
12551	NC_004337	CAA	2	6	616798	616803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112014
12552	NC_004337	GGCGA	2	10	616818	616827	20 %	0 %	60 %	20 %	24112014
12553	NC_004337	CCCG	2	8	616831	616838	0 %	0 %	25 %	75 %	24112014
12554	NC_004337	GTT	2	6	616890	616895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112014
12555	NC_004337	CGC	2	6	616945	616950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112014
12556	NC_004337	TTC	2	6	616954	616959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112014
12557	NC_004337	ATGG	2	8	617009	617016	25 %	25 %	50 %	0 %	24112014
12558	NC_004337	CTA	2	6	617036	617041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112014
12559	NC_004337	TCA	2	6	617145	617150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112014
12560	NC_004337	CGG	2	6	617158	617163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112014
12561	NC_004337	TCA	2	6	617177	617182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112014
12562	NC_004337	CA	3	6	617190	617195	50 %	0 %	0 %	50 %	24112014
12563	NC_004337	CGCT	2	8	617233	617240	0 %	25 %	25 %	50 %	24112014
12564	NC_004337	A	6	6	617265	617270	100 %	0 %	0 %	0 %	24112014
12565	NC_004337	GTG	2	6	617451	617456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112014
12566	NC_004337	GGC	2	6	617500	617505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112014
12567	NC_004337	GCG	2	6	617678	617683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112015
12568	NC_004337	AAG	2	6	617685	617690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24112015
12569	NC_004337	CAGC	2	8	617726	617733	25 %	0 %	25 %	50 %	24112015
12570	NC_004337	CG	3	6	617804	617809	0 %	0 %	50 %	50 %	24112015
12571	NC_004337	ATC	2	6	617865	617870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112015
12572	NC_004337	TGA	2	6	617884	617889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112015
12573	NC_004337	CG	3	6	617984	617989	0 %	0 %	50 %	50 %	24112015
12574	NC_004337	TCA	2	6	618052	618057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112015
12575	NC_004337	ATG	2	6	618120	618125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_004337	GC	3	6	618165	618170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12577	NC_004337	GCAA	2	8	618176	618183	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12578	NC_004337	CCA	2	6	618283	618288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112016
12579	NC_004337	TAT	2	6	618314	618319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112016
12580	NC_004337	G	6	6	618409	618414	0 %	0 %	100 %	0 %	24112016
12581	NC_004337	CAT	2	6	618421	618426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112016
12582	NC_004337	GGGAT	2	10	618456	618465	20 %	20 %	60 %	0 %	24112016
12583	NC_004337	A	6	6	618496	618501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12584	NC_004337	TTA	2	6	618542	618547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_004337	TCA	2	6	618558	618563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12586	NC_004337	ATG	2	6	618670	618675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_004337	ATG	2	6	618709	618714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_004337	CATT	2	8	618750	618757	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12589	NC_004337	ATCTA	2	10	618791	618800	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12590	NC_004337	TAA	2	6	618902	618907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_004337	ATT	2	6	618924	618929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_004337	AT	3	6	618948	618953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_004337	CCA	2	6	618965	618970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12594	NC_004337	TGA	2	6	618974	618979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_004337	ATC	2	6	619069	619074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12596	NC_004337	ACT	2	6	619240	619245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12597	NC_004337	TAA	2	6	619249	619254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_004337	CCG	2	6	619481	619486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12599	NC_004337	GC	3	6	619573	619578	0 %	0 %	50 %	50 %	24112019
12600	NC_004337	TCCG	2	8	619788	619795	0 %	25 %	25 %	50 %	24112019
12601	NC_004337	GTC	2	6	619839	619844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112019
12602	NC_004337	CCA	2	6	619849	619854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112019
12603	NC_004337	CAT	2	6	619867	619872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112019
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12605	NC_004337	CAC	2	6	619945	619950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112019
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12607	NC_004337	CG	3	6	620009	620014	0 %	0 %	50 %	50 %	24112019
12608	NC_004337	CAG	2	6	620021	620026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112019
12609	NC_004337	CGC	2	6	620033	620038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112019
12610	NC_004337	GCC	2	6	620156	620161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112019
12611	NC_004337	GGTC	2	8	620167	620174	0 %	25 %	50 %	25 %	24112019
12612	NC_004337	TTC	2	6	620192	620197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112019
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12614	NC_004337	GTCC	2	8	620293	620300	0 %	25 %	25 %	50 %	24112019
12615	NC_004337	CTGCG	2	10	620313	620322	0 %	20 %	40 %	40 %	24112019
12616	NC_004337	GTG	2	6	620363	620368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112019
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12622	NC_004337	ACG	2	6	620552	620557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112019
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12624	NC_004337	CCG	2	6	620606	620611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112019
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