MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_004337	CAG	2	6	516813	516818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10502	NC_004337	AGG	2	6	516871	516876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_004337	CGC	2	6	516904	516909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111931
10504	NC_004337	CG	3	6	517016	517021	0 %	0 %	50 %	50 %	24111931
10505	NC_004337	GAT	2	6	517100	517105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111931
10506	NC_004337	CAA	2	6	517196	517201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111931
10507	NC_004337	TCA	2	6	517237	517242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111931
10508	NC_004337	CTGGTA	2	12	517267	517278	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	24111931
10509	NC_004337	TGC	2	6	517359	517364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111931
10510	NC_004337	CCGC	2	8	517496	517503	0 %	0 %	25 %	75 %	24111931
10511	NC_004337	CGC	2	6	517687	517692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111931
10512	NC_004337	CGG	2	6	517722	517727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111931
10513	NC_004337	GCG	2	6	517781	517786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111931
10514	NC_004337	GCA	2	6	517832	517837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111931
10515	NC_004337	A	7	7	517844	517850	100 %	0 %	0 %	0 %	24111931
10516	NC_004337	CGT	2	6	517853	517858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111931
10517	NC_004337	TGA	2	6	517912	517917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111931
10518	NC_004337	CCGGT	2	10	518007	518016	0 %	20 %	40 %	40 %	24111931
10519	NC_004337	CGC	2	6	518152	518157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111931
10520	NC_004337	TGT	2	6	518169	518174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111931
10521	NC_004337	GCG	2	6	518175	518180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111931
10522	NC_004337	TGC	2	6	518193	518198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111931
10523	NC_004337	GC	3	6	518265	518270	0 %	0 %	50 %	50 %	24111931
10524	NC_004337	TGG	2	6	518271	518276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111931
10525	NC_004337	GGT	2	6	518359	518364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111931
10526	NC_004337	CTG	2	6	518378	518383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111931
10527	NC_004337	GCG	2	6	518391	518396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111931
10528	NC_004337	ATG	2	6	518528	518533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111931
10529	NC_004337	CGTC	2	8	518546	518553	0 %	25 %	25 %	50 %	24111931
10530	NC_004337	ACC	2	6	518564	518569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111931
10531	NC_004337	AACC	2	8	518608	518615	50 %	0 %	0 %	50 %	24111931
10532	NC_004337	C	6	6	518637	518642	0 %	0 %	0 %	100 %	24111931
10533	NC_004337	CAC	2	6	518675	518680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111931
10534	NC_004337	ATC	2	6	518690	518695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111931
10535	NC_004337	TGT	2	6	518763	518768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111931
10536	NC_004337	A	6	6	518814	518819	100 %	0 %	0 %	0 %	24111931
10537	NC_004337	CGCT	2	8	518916	518923	0 %	25 %	25 %	50 %	24111931
10538	NC_004337	GCA	2	6	518926	518931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111931
10539	NC_004337	GCA	2	6	518984	518989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111931
10540	NC_004337	TTG	2	6	518991	518996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111931
10541	NC_004337	GTG	2	6	519057	519062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111931
10542	NC_004337	GC	3	6	519108	519113	0 %	0 %	50 %	50 %	24111931
10543	NC_004337	GCG	2	6	519143	519148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111931
10544	NC_004337	GCA	2	6	519201	519206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111931
10545	NC_004337	GAT	2	6	519259	519264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111931
10546	NC_004337	GCC	2	6	519274	519279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111931
10547	NC_004337	GAC	2	6	519336	519341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111931
10548	NC_004337	GCTG	2	8	519420	519427	0 %	25 %	50 %	25 %	24111931
10549	NC_004337	ATCG	2	8	519506	519513	25 %	25 %	25 %	25 %	24111931
10550	NC_004337	TG	3	6	519560	519565	0 %	50 %	50 %	0 %	24111931
10551	NC_004337	GGC	2	6	519574	519579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111931
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10553	NC_004337	TGG	2	6	519606	519611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111931
10554	NC_004337	GCC	2	6	519682	519687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111931
10555	NC_004337	CTG	2	6	519707	519712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111931
10556	NC_004337	CTGAA	2	10	519774	519783	40 %	20 %	20 %	20 %	24111931
10557	NC_004337	CGC	2	6	519832	519837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111931
10558	NC_004337	CGT	2	6	519846	519851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111931
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10560	NC_004337	TGTTT	2	10	520095	520104	0 %	80 %	20 %	0 %	24111931
10561	NC_004337	ATT	2	6	520172	520177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111931
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10564	NC_004337	GCG	2	6	520286	520291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111931
10565	NC_004337	GCC	2	6	520345	520350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111931
10566	NC_004337	GGC	2	6	520438	520443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111931
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10568	NC_004337	GTT	2	6	520468	520473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111931
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10570	NC_004337	CTG	2	6	520511	520516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111931
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10572	NC_004337	ACGC	2	8	520570	520577	25 %	0 %	25 %	50 %	24111931
10573	NC_004337	TC	3	6	520668	520673	0 %	50 %	0 %	50 %	24111931
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10578	NC_004337	TCCT	2	8	520833	520840	0 %	50 %	0 %	50 %	24111932
10579	NC_004337	GTG	2	6	520858	520863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111932
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10581	NC_004337	GTGAT	2	10	521107	521116	20 %	40 %	40 %	0 %	24111933
10582	NC_004337	GCTG	2	8	521173	521180	0 %	25 %	50 %	25 %	24111933
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10586	NC_004337	TGGC	2	8	521306	521313	0 %	25 %	50 %	25 %	24111933
10587	NC_004337	AATCTG	2	12	521388	521399	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24111933
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10589	NC_004337	AAT	2	6	521536	521541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_004337	T	6	6	521548	521553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10591	NC_004337	TTTG	2	8	521555	521562	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_004337	TGA	2	6	521574	521579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_004337	GGAA	2	8	521616	521623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_004337	TCA	2	6	521721	521726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10595	NC_004337	TAA	2	6	521786	521791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_004337	TAATC	2	10	521807	521816	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10597	NC_004337	A	7	7	521835	521841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_004337	TTA	2	6	521926	521931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10600	NC_004337	AAG	2	6	522042	522047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_004337	TCA	2	6	522084	522089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10602	NC_004337	TTG	2	6	522151	522156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_004337	A	6	6	522166	522171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_004337	TGA	2	6	522182	522187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10605	NC_004337	A	6	6	522201	522206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_004337	TGG	2	6	522310	522315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_004337	TAA	2	6	522341	522346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_004337	GAAAAA	2	12	522369	522380	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10609	NC_004337	ATT	2	6	522439	522444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_004337	A	6	6	522711	522716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_004337	ATT	2	6	522735	522740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_004337	CGG	2	6	522761	522766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10613	NC_004337	TGG	2	6	522769	522774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_004337	ATG	2	6	522828	522833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_004337	CAC	2	6	522887	522892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111934
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10618	NC_004337	GCAAT	2	10	523012	523021	40 %	20 %	20 %	20 %	24111934
10619	NC_004337	TGGC	2	8	523026	523033	0 %	25 %	50 %	25 %	24111934
10620	NC_004337	GCA	2	6	523060	523065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111934
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10622	NC_004337	TGA	2	6	523128	523133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111934
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10624	NC_004337	TCG	2	6	523158	523163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111934
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