MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_004337	TTA	2	6	491274	491279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_004337	GCA	2	6	491283	491288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_004337	TAT	2	6	491302	491307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_004337	CGCA	2	8	491346	491353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10005	NC_004337	A	6	6	491355	491360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_004337	TATGGA	2	12	491446	491457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_004337	AG	3	6	491482	491487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_004337	CG	3	6	491556	491561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10009	NC_004337	CGA	2	6	491589	491594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_004337	CGG	2	6	491770	491775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_004337	A	6	6	491862	491867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_004337	GC	3	6	491926	491931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10013	NC_004337	GAAT	2	8	491934	491941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_004337	AGGT	2	8	491974	491981	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_004337	TGTC	2	8	491992	491999	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10016	NC_004337	TTAA	2	8	492024	492031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_004337	CTGT	2	8	492032	492039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10018	NC_004337	T	7	7	492059	492065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_004337	GTT	2	6	492097	492102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_004337	TGT	2	6	492113	492118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_004337	ATT	2	6	492154	492159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_004337	ATT	2	6	492176	492181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_004337	AAG	2	6	492241	492246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_004337	GCTGAT	2	12	492249	492260	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10025	NC_004337	TCCAGT	2	12	492295	492306	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_004337	TGGCA	2	10	492318	492327	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10027	NC_004337	CAGA	2	8	492380	492387	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10028	NC_004337	CTG	2	6	492391	492396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_004337	ACT	2	6	492487	492492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_004337	ATC	2	6	492558	492563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_004337	ATA	2	6	492579	492584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_004337	TTCTGC	2	12	492591	492602	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_004337	TCG	2	6	492633	492638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_004337	CCAC	2	8	492653	492660	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10035	NC_004337	TG	3	6	492817	492822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_004337	ATAC	2	8	492833	492840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10037	NC_004337	ATG	2	6	492979	492984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_004337	GTAA	2	8	493020	493027	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_004337	CCAC	2	8	493034	493041	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10040	NC_004337	AAC	2	6	493210	493215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_004337	TCTT	2	8	493272	493279	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10042	NC_004337	GAT	2	6	493321	493326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_004337	CAG	2	6	493418	493423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_004337	CAT	2	6	493427	493432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111912
10045	NC_004337	T	6	6	493432	493437	0 %	100 %	0 %	0 %	24111912
10046	NC_004337	GCG	2	6	493501	493506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111912
10047	NC_004337	GGT	2	6	493555	493560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111912
10048	NC_004337	AGC	2	6	493845	493850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_004337	AAG	2	6	493893	493898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_004337	TGA	2	6	493927	493932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_004337	CGG	2	6	493996	494001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_004337	TTG	2	6	494043	494048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_004337	TAA	2	6	494203	494208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_004337	CAG	2	6	494238	494243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_004337	TCA	2	6	494253	494258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_004337	TAATG	2	10	494284	494293	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_004337	TGAA	2	8	494295	494302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_004337	ATT	2	6	494314	494319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_004337	CAG	2	6	494432	494437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_004337	ATT	2	6	494443	494448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_004337	CTG	2	6	494449	494454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_004337	GTC	2	6	494498	494503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_004337	AAT	2	6	494525	494530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_004337	AAC	2	6	494605	494610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_004337	ATT	2	6	494620	494625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_004337	GGA	2	6	494661	494666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_004337	TTTC	2	8	494668	494675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10068	NC_004337	AGC	2	6	494690	494695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_004337	AT	3	6	494727	494732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_004337	GTG	2	6	494773	494778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_004337	CAAA	2	8	494794	494801	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10072	NC_004337	GCGA	2	8	494961	494968	25 %	0 %	50 %	25 %	24111913
10073	NC_004337	TGC	2	6	495031	495036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111913
10074	NC_004337	CT	3	6	495098	495103	0 %	50 %	0 %	50 %	24111913
10075	NC_004337	CCG	2	6	495132	495137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111913
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10077	NC_004337	CCACT	2	10	495217	495226	20 %	20 %	0 %	60 %	24111913
10078	NC_004337	ACG	2	6	495231	495236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111913
10079	NC_004337	GCG	2	6	495253	495258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111913
10080	NC_004337	GCC	2	6	495304	495309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111913
10081	NC_004337	CAGTG	2	10	495323	495332	20 %	20 %	40 %	20 %	24111913
10082	NC_004337	CAG	2	6	495344	495349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111913
10083	NC_004337	TC	4	8	495373	495380	0 %	50 %	0 %	50 %	24111913
10084	NC_004337	CAG	2	6	495389	495394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111913
10085	NC_004337	CTTT	2	8	495428	495435	0 %	75 %	0 %	25 %	24111913
10086	NC_004337	CAG	2	6	495477	495482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111913
10087	NC_004337	AGC	2	6	495578	495583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111913
10088	NC_004337	CGA	2	6	495593	495598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111913
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10091	NC_004337	GCG	2	6	495673	495678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111913
10092	NC_004337	CCAT	2	8	495680	495687	25 %	25 %	0 %	50 %	24111913
10093	NC_004337	T	6	6	495802	495807	0 %	100 %	0 %	0 %	24111914
10094	NC_004337	CTT	2	6	495827	495832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111914
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10098	NC_004337	CGG	2	6	495935	495940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111914
10099	NC_004337	CAG	2	6	495944	495949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111914
10100	NC_004337	CTTC	2	8	495955	495962	0 %	50 %	0 %	50 %	24111914
10101	NC_004337	CTGG	2	8	495990	495997	0 %	25 %	50 %	25 %	24111914
10102	NC_004337	CTG	2	6	496053	496058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111914
10103	NC_004337	TG	3	6	496078	496083	0 %	50 %	50 %	0 %	24111914
10104	NC_004337	AAT	2	6	496119	496124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111914
10105	NC_004337	CAT	2	6	496269	496274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_004337	TGA	2	6	496299	496304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_004337	CTG	2	6	496446	496451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_004337	CTGG	2	8	496471	496478	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10109	NC_004337	GCT	2	6	496552	496557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_004337	CGA	2	6	496615	496620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_004337	TGC	2	6	496677	496682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_004337	TGAT	2	8	496701	496708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_004337	GGT	2	6	496834	496839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_004337	CGG	2	6	496843	496848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_004337	TGAT	2	8	496857	496864	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_004337	ATT	2	6	496954	496959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111915
10117	NC_004337	T	6	6	496980	496985	0 %	100 %	0 %	0 %	24111915
10118	NC_004337	GTT	2	6	497001	497006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111915
10119	NC_004337	CAT	2	6	497031	497036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111915
10120	NC_004337	TC	3	6	497064	497069	0 %	50 %	0 %	50 %	24111915
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10123	NC_004337	TGT	2	6	497159	497164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111915
10124	NC_004337	CTGC	2	8	497302	497309	0 %	25 %	25 %	50 %	24111915
10125	NC_004337	TGG	2	6	497372	497377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111915
10126	NC_004337	GTG	2	6	497488	497493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111915
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10128	NC_004337	GC	3	6	497564	497569	0 %	0 %	50 %	50 %	24111915
10129	NC_004337	GCGG	2	8	497590	497597	0 %	0 %	75 %	25 %	24111915
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10245	NC_004337	GGT	2	6	503000	503005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10246	NC_004337	AGCGT	2	10	503031	503040	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10247	NC_004337	TGA	2	6	503058	503063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10248	NC_004337	AAC	2	6	503072	503077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10250	NC_004337	GCC	2	6	503172	503177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10251	NC_004337	CAT	3	9	503233	503241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10253	NC_004337	GA	3	6	503323	503328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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