MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_004337	GAT	2	6	442072	442077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111863
9002	NC_004337	GGT	2	6	442082	442087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111863
9003	NC_004337	GGC	2	6	442111	442116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111863
9004	NC_004337	A	6	6	442124	442129	100 %	0 %	0 %	0 %	24111863
9005	NC_004337	CAA	2	6	442169	442174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111863
9006	NC_004337	GAA	3	9	442291	442299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111863
9007	NC_004337	AGCG	2	8	442322	442329	25 %	0 %	50 %	25 %	24111863
9008	NC_004337	GTC	2	6	442440	442445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111863
9009	NC_004337	TGA	2	6	442542	442547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111863
9010	NC_004337	TGG	2	6	442629	442634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111863
9011	NC_004337	TGAT	2	8	442662	442669	25 %	50 %	25 %	0 %	24111863
9012	NC_004337	CCG	2	6	442677	442682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111863
9013	NC_004337	CGG	2	6	442837	442842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111863
9014	NC_004337	CGC	2	6	442935	442940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111863
9015	NC_004337	AGGTG	2	10	442966	442975	20 %	20 %	60 %	0 %	24111863
9016	NC_004337	CGG	2	6	443031	443036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111864
9017	NC_004337	GCC	2	6	443082	443087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111864
9018	NC_004337	GCC	2	6	443111	443116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111864
9019	NC_004337	T	6	6	443174	443179	0 %	100 %	0 %	0 %	24111864
9020	NC_004337	C	6	6	443198	443203	0 %	0 %	0 %	100 %	24111864
9021	NC_004337	ATCGG	2	10	443235	443244	20 %	20 %	40 %	20 %	24111864
9022	NC_004337	T	6	6	443282	443287	0 %	100 %	0 %	0 %	24111864
9023	NC_004337	CCA	2	6	443353	443358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111864
9024	NC_004337	T	6	6	443396	443401	0 %	100 %	0 %	0 %	24111864
9025	NC_004337	GAC	2	6	443402	443407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111864
9026	NC_004337	T	7	7	443472	443478	0 %	100 %	0 %	0 %	24111864
9027	NC_004337	A	7	7	443525	443531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_004337	AAGC	2	8	443534	443541	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9029	NC_004337	A	8	8	443561	443568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_004337	ATA	3	9	443648	443656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_004337	A	7	7	443656	443662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_004337	T	7	7	443702	443708	0 %	100 %	0 %	0 %	24111865
9033	NC_004337	ACCG	2	8	443755	443762	25 %	0 %	25 %	50 %	24111865
9034	NC_004337	CGG	2	6	443779	443784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111865
9035	NC_004337	GACT	2	8	443846	443853	25 %	25 %	25 %	25 %	24111865
9036	NC_004337	ATT	2	6	443878	443883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111865
9037	NC_004337	GCG	2	6	443886	443891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111865
9038	NC_004337	CCA	2	6	443902	443907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111865
9039	NC_004337	TCA	2	6	443910	443915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111865
9040	NC_004337	GCA	2	6	443922	443927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111865
9041	NC_004337	CAG	2	6	443965	443970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111865
9042	NC_004337	TGT	2	6	444047	444052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111865
9043	NC_004337	CGC	2	6	444058	444063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111865
9044	NC_004337	GAA	2	6	444129	444134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111865
9045	NC_004337	TGC	2	6	444203	444208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111865
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9048	NC_004337	TGG	2	6	444285	444290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111865
9049	NC_004337	CGA	2	6	444303	444308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111865
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9051	NC_004337	GC	3	6	444531	444536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9052	NC_004337	CAA	2	6	444649	444654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111866
9053	NC_004337	CGA	2	6	444661	444666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111866
9054	NC_004337	TTC	2	6	444679	444684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111866
9055	NC_004337	TGC	2	6	444736	444741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111866
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9057	NC_004337	GGC	2	6	444860	444865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111866
9058	NC_004337	ACA	2	6	444889	444894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111866
9059	NC_004337	GAA	2	6	444906	444911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111866
9060	NC_004337	A	6	6	444965	444970	100 %	0 %	0 %	0 %	24111866
9061	NC_004337	CGC	2	6	445024	445029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9062	NC_004337	CGC	2	6	445125	445130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9063	NC_004337	GCC	2	6	445161	445166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9064	NC_004337	AGC	2	6	445171	445176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9065	NC_004337	GCA	2	6	445215	445220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111867
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9067	NC_004337	CGG	2	6	445320	445325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111867
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9071	NC_004337	CGT	2	6	445527	445532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111867
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9073	NC_004337	GCA	2	6	445608	445613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111867
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9079	NC_004337	CAG	2	6	445795	445800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111867
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9082	NC_004337	GCC	3	9	446036	446044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111867
9083	NC_004337	ACG	2	6	446138	446143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111867
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9093	NC_004337	GC	3	6	446722	446727	0 %	0 %	50 %	50 %	24111867
9094	NC_004337	AGA	2	6	446767	446772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111867
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9105	NC_004337	CAG	2	6	447385	447390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111867
9106	NC_004337	CTG	2	6	447394	447399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111867
9107	NC_004337	GTCATC	2	12	447403	447414	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	24111867
9108	NC_004337	TGA	2	6	447469	447474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111867
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9110	NC_004337	TAA	2	6	447775	447780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_004337	A	6	6	447809	447814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_004337	ATTT	2	8	447842	447849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_004337	CAAA	2	8	447971	447978	75 %	0 %	0 %	25 %	24111868
9114	NC_004337	CAG	2	6	447982	447987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111868
9115	NC_004337	TCAC	2	8	448014	448021	25 %	25 %	0 %	50 %	24111868
9116	NC_004337	CGG	2	6	448026	448031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111868
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9120	NC_004337	CCA	3	9	448325	448333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111868
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9122	NC_004337	CTGG	2	8	448396	448403	0 %	25 %	50 %	25 %	24111868
9123	NC_004337	CT	3	6	448417	448422	0 %	50 %	0 %	50 %	24111868
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9125	NC_004337	GCT	2	6	448479	448484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111868
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