MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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92002	NC_004337	TTCA	2	8	4520460	4520467	25 %	50 %	0 %	25 %	56480587
92003	NC_004337	TAA	2	6	4520622	4520627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92004	NC_004337	ATTT	2	8	4520717	4520724	25 %	75 %	0 %	0 %	344915384
92005	NC_004337	CTGTC	2	10	4520752	4520761	0 %	40 %	20 %	40 %	344915384
92006	NC_004337	CCA	2	6	4520775	4520780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344915384
92007	NC_004337	GAC	2	6	4520782	4520787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915384
92008	NC_004337	TAA	2	6	4520792	4520797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344915384
92009	NC_004337	GCTG	2	8	4520945	4520952	0 %	25 %	50 %	25 %	344915384
92010	NC_004337	AAT	2	6	4520996	4521001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344915384
92011	NC_004337	TAGTG	2	10	4521048	4521057	20 %	40 %	40 %	0 %	344915384
92012	NC_004337	TTA	2	6	4521060	4521065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344915384
92013	NC_004337	CAG	2	6	4521172	4521177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92014	NC_004337	TTC	2	6	4521195	4521200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92015	NC_004337	GA	3	6	4521221	4521226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92016	NC_004337	GAT	2	6	4521229	4521234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115545
92017	NC_004337	TTC	2	6	4521270	4521275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24115545
92018	NC_004337	T	6	6	4521321	4521326	0 %	100 %	0 %	0 %	24115545
92019	NC_004337	CGA	2	6	4521442	4521447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24115545
92020	NC_004337	GCG	2	6	4521451	4521456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115545
92021	NC_004337	ACT	2	6	4521503	4521508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115545
92022	NC_004337	GAA	2	6	4521527	4521532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24115545
92023	NC_004337	GCT	2	6	4521538	4521543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115545
92024	NC_004337	TGA	2	6	4521544	4521549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115545
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92026	NC_004337	TCGC	2	8	4521662	4521669	0 %	25 %	25 %	50 %	24115545
92027	NC_004337	GCA	2	6	4521704	4521709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24115545
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92032	NC_004337	CTG	2	6	4521797	4521802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115545
92033	NC_004337	CGA	2	6	4521814	4521819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24115545
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92035	NC_004337	GCA	2	6	4521853	4521858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24115545
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92037	NC_004337	GCGT	2	8	4521912	4521919	0 %	25 %	50 %	25 %	24115545
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92041	NC_004337	ACC	2	6	4522124	4522129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480588
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92048	NC_004337	TGA	2	6	4522434	4522439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480588
92049	NC_004337	TCGCG	2	10	4522616	4522625	0 %	20 %	40 %	40 %	56480588
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92051	NC_004337	T	7	7	4522754	4522760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92052	NC_004337	GAT	2	6	4522762	4522767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92053	NC_004337	TAC	2	6	4522787	4522792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92054	NC_004337	ATC	2	6	4522884	4522889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115547
92055	NC_004337	CG	3	6	4522895	4522900	0 %	0 %	50 %	50 %	24115547
92056	NC_004337	GCC	2	6	4522947	4522952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24115547
92057	NC_004337	T	6	6	4522995	4523000	0 %	100 %	0 %	0 %	24115547
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92061	NC_004337	ATA	2	6	4523205	4523210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24115547
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92119	NC_004337	GC	3	6	4525607	4525612	0 %	0 %	50 %	50 %	344915385
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92227	NC_004337	CTCG	2	8	4531012	4531019	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92228	NC_004337	GCA	2	6	4531113	4531118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92229	NC_004337	ATG	2	6	4531119	4531124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92230	NC_004337	TTG	2	6	4531183	4531188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92231	NC_004337	AGC	2	6	4531201	4531206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92232	NC_004337	AAC	2	6	4531289	4531294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92233	NC_004337	AATA	2	8	4531344	4531351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92234	NC_004337	TCCA	2	8	4531435	4531442	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92235	NC_004337	CATT	2	8	4531456	4531463	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92236	NC_004337	AG	3	6	4531520	4531525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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