MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_004337	GTG	2	6	418689	418694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111845
8502	NC_004337	GCT	2	6	418815	418820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111845
8503	NC_004337	AGC	2	6	418827	418832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111845
8504	NC_004337	TCAAAG	2	12	418887	418898	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	24111845
8505	NC_004337	TTC	2	6	419012	419017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111845
8506	NC_004337	AACG	2	8	419048	419055	50 %	0 %	25 %	25 %	24111845
8507	NC_004337	AAGCCG	2	12	419085	419096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111845
8508	NC_004337	GTT	2	6	419120	419125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111845
8509	NC_004337	CTG	2	6	419194	419199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111845
8510	NC_004337	AAG	2	6	419244	419249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111845
8511	NC_004337	GAT	2	6	419291	419296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111845
8512	NC_004337	GTG	2	6	419357	419362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111845
8513	NC_004337	GAA	2	6	419396	419401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111845
8514	NC_004337	T	6	6	419405	419410	0 %	100 %	0 %	0 %	24111845
8515	NC_004337	TGG	2	6	419449	419454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111845
8516	NC_004337	GATA	2	8	419533	419540	50 %	25 %	25 %	0 %	24111845
8517	NC_004337	AAG	2	6	419559	419564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111845
8518	NC_004337	CCG	2	6	419581	419586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111845
8519	NC_004337	CTT	2	6	419647	419652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111845
8520	NC_004337	GGC	2	6	419655	419660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111845
8521	NC_004337	CTT	2	6	419665	419670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111845
8522	NC_004337	CCA	2	6	419716	419721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111845
8523	NC_004337	GGC	2	6	419780	419785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111845
8524	NC_004337	ACC	2	6	419811	419816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111845
8525	NC_004337	CG	3	6	419843	419848	0 %	0 %	50 %	50 %	24111845
8526	NC_004337	GAT	2	6	419888	419893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111845
8527	NC_004337	GTG	2	6	419946	419951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111845
8528	NC_004337	GAA	2	6	419984	419989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111845
8529	NC_004337	GAT	2	6	420101	420106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111845
8530	NC_004337	CAC	2	6	420118	420123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111845
8531	NC_004337	GCA	2	6	420148	420153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111845
8532	NC_004337	CAG	2	6	420182	420187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111845
8533	NC_004337	AAT	2	6	420230	420235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111845
8534	NC_004337	CGG	2	6	420263	420268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111845
8535	NC_004337	ACC	2	6	420272	420277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111845
8536	NC_004337	CGC	2	6	420287	420292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111845
8537	NC_004337	AAC	2	6	420402	420407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111845
8538	NC_004337	CGC	2	6	420455	420460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111845
8539	NC_004337	TCC	2	6	420477	420482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24111845
8540	NC_004337	GCT	2	6	420530	420535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111845
8541	NC_004337	GAT	2	6	420537	420542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111845
8542	NC_004337	TGC	2	6	420561	420566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111845
8543	NC_004337	CTT	2	6	420571	420576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111845
8544	NC_004337	GCA	2	6	420580	420585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111845
8545	NC_004337	CGG	2	6	420812	420817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111845
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8547	NC_004337	ATG	2	6	420876	420881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111845
8548	NC_004337	CGAT	2	8	420912	420919	25 %	25 %	25 %	25 %	24111845
8549	NC_004337	TTAAG	2	10	420952	420961	40 %	40 %	20 %	0 %	56479668
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8552	NC_004337	TTA	2	6	421067	421072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56479668
8553	NC_004337	CAC	2	6	421193	421198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479668
8554	NC_004337	GCG	2	6	421199	421204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479668
8555	NC_004337	CTT	2	6	421253	421258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56479668
8556	NC_004337	GC	3	6	421267	421272	0 %	0 %	50 %	50 %	56479668
8557	NC_004337	GCA	2	6	421286	421291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479668
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8559	NC_004337	TGC	2	6	421528	421533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479668
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8561	NC_004337	GCA	2	6	421684	421689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479668
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8566	NC_004337	CTG	2	6	422043	422048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479668
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8569	NC_004337	TAA	2	6	422198	422203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_004337	TGC	2	6	422210	422215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_004337	TAT	2	6	422221	422226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_004337	CGT	2	6	422227	422232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8573	NC_004337	TACA	2	8	422240	422247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8574	NC_004337	ATGT	2	8	422255	422262	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_004337	AAG	2	6	422311	422316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111847
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8580	NC_004337	AG	3	6	422559	422564	50 %	0 %	50 %	0 %	24111847
8581	NC_004337	AGA	2	6	422597	422602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111847
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8586	NC_004337	GCA	2	6	422778	422783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111847
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8589	NC_004337	TCG	2	6	422976	422981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8590	NC_004337	CGT	2	6	423001	423006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8592	NC_004337	TTCA	2	8	423057	423064	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8593	NC_004337	T	6	6	423107	423112	0 %	100 %	0 %	0 %	24111848
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8600	NC_004337	ACG	2	6	423416	423421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111848
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8605	NC_004337	CCAG	2	8	423659	423666	25 %	0 %	25 %	50 %	24111848
8606	NC_004337	CAG	2	6	423685	423690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111848
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8608	NC_004337	AAG	2	6	423827	423832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111848
8609	NC_004337	A	6	6	423863	423868	100 %	0 %	0 %	0 %	24111848
8610	NC_004337	CG	3	6	423900	423905	0 %	0 %	50 %	50 %	24111848
8611	NC_004337	CAG	2	6	423949	423954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111848
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8614	NC_004337	CTG	2	6	424093	424098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111848
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8620	NC_004337	TCAAC	2	10	424338	424347	40 %	20 %	0 %	40 %	24111848
8621	NC_004337	TGA	2	6	424367	424372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111848
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8623	NC_004337	ATCC	2	8	424431	424438	25 %	25 %	0 %	50 %	24111848
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8995	NC_004337	CAG	2	6	441716	441721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111863
8996	NC_004337	GAAGC	2	10	441917	441926	40 %	0 %	40 %	20 %	24111863
8997	NC_004337	ACAG	2	8	441946	441953	50 %	0 %	25 %	25 %	24111863
8998	NC_004337	ATT	2	6	441965	441970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111863
8999	NC_004337	CG	3	6	442046	442051	0 %	0 %	50 %	50 %	24111863
9000	NC_004337	CTGC	2	8	442052	442059	0 %	25 %	25 %	50 %	24111863

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