MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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85502	NC_004337	CTG	2	6	4202222	4202227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480500
85503	NC_004337	GAA	2	6	4202231	4202236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480500
85504	NC_004337	GAC	2	6	4202264	4202269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480500
85505	NC_004337	GAT	2	6	4202324	4202329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480500
85506	NC_004337	ACC	2	6	4202334	4202339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480500
85507	NC_004337	CGT	2	6	4202348	4202353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480500
85508	NC_004337	TCCGT	2	10	4202355	4202364	0 %	40 %	20 %	40 %	56480500
85509	NC_004337	GTCT	2	8	4202430	4202437	0 %	50 %	25 %	25 %	56480500
85510	NC_004337	GCA	2	6	4202495	4202500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480500
85511	NC_004337	TTC	2	6	4202510	4202515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56480500
85512	NC_004337	CCAG	2	8	4202520	4202527	25 %	0 %	25 %	50 %	56480500
85513	NC_004337	AAC	2	6	4202549	4202554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56480500
85514	NC_004337	CGT	2	6	4202579	4202584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480500
85515	NC_004337	CT	3	6	4202716	4202721	0 %	50 %	0 %	50 %	56480500
85516	NC_004337	GAA	2	6	4202825	4202830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480500
85517	NC_004337	GAA	2	6	4202870	4202875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480500
85518	NC_004337	AGA	2	6	4202887	4202892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480500
85519	NC_004337	CAG	2	6	4202969	4202974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480500
85520	NC_004337	GC	3	6	4203076	4203081	0 %	0 %	50 %	50 %	56480500
85521	NC_004337	TGGT	2	8	4203093	4203100	0 %	50 %	50 %	0 %	56480500
85522	NC_004337	GTG	3	9	4203156	4203164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480500
85523	NC_004337	GT	4	8	4203304	4203311	0 %	50 %	50 %	0 %	56480500
85524	NC_004337	GTCC	2	8	4203354	4203361	0 %	25 %	25 %	50 %	56480500
85525	NC_004337	GTT	2	6	4203461	4203466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56480500
85526	NC_004337	CAC	2	6	4203481	4203486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480500
85527	NC_004337	GT	4	8	4203508	4203515	0 %	50 %	50 %	0 %	56480500
85528	NC_004337	TGGT	2	8	4203645	4203652	0 %	50 %	50 %	0 %	56480500
85529	NC_004337	AGA	2	6	4203688	4203693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480500
85530	NC_004337	CTG	2	6	4203698	4203703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480500
85531	NC_004337	GAA	2	6	4203842	4203847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480500
85532	NC_004337	GAA	2	6	4203865	4203870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480500
85533	NC_004337	GAA	2	6	4203881	4203886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480500
85534	NC_004337	GTGCT	2	10	4203924	4203933	0 %	40 %	40 %	20 %	56480500
85535	NC_004337	CG	3	6	4203975	4203980	0 %	0 %	50 %	50 %	56480500
85536	NC_004337	GCTG	2	8	4203984	4203991	0 %	25 %	50 %	25 %	56480500
85537	NC_004337	GCTG	2	8	4204036	4204043	0 %	25 %	50 %	25 %	56480500
85538	NC_004337	GAA	2	6	4204075	4204080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480500
85539	NC_004337	CGC	2	6	4204094	4204099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480500
85540	NC_004337	CGA	2	6	4204114	4204119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480500
85541	NC_004337	GTC	2	6	4204200	4204205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480500
85542	NC_004337	CAG	2	6	4204397	4204402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480500
85543	NC_004337	AAG	2	6	4204404	4204409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480500
85544	NC_004337	GCGT	2	8	4204435	4204442	0 %	25 %	50 %	25 %	56480500
85545	NC_004337	GAA	2	6	4204496	4204501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480500
85546	NC_004337	AAG	2	6	4204569	4204574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480500
85547	NC_004337	GCT	2	6	4204588	4204593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480500
85548	NC_004337	TACATG	2	12	4204682	4204693	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56480500
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85550	NC_004337	CGA	2	6	4204714	4204719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480500
85551	NC_004337	CG	3	6	4204729	4204734	0 %	0 %	50 %	50 %	56480500
85552	NC_004337	CAG	2	6	4204763	4204768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480500
85553	NC_004337	GGT	2	6	4204775	4204780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480500
85554	NC_004337	GGT	2	6	4204793	4204798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480500
85555	NC_004337	GCA	2	6	4204844	4204849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480500
85556	NC_004337	TGA	2	6	4204882	4204887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480500
85557	NC_004337	TTG	2	6	4204973	4204978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56480500
85558	NC_004337	TTCG	2	8	4204986	4204993	0 %	50 %	25 %	25 %	56480500
85559	NC_004337	CTG	2	6	4205046	4205051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85560	NC_004337	TTA	2	6	4205112	4205117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24115273
85561	NC_004337	GCG	2	6	4205365	4205370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115273
85562	NC_004337	CTG	2	6	4205478	4205483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115273
85563	NC_004337	GTACT	2	10	4205514	4205523	20 %	40 %	20 %	20 %	24115273
85564	NC_004337	CAG	2	6	4205571	4205576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24115273
85565	NC_004337	CTGA	2	8	4205580	4205587	25 %	25 %	25 %	25 %	24115273
85566	NC_004337	CTG	2	6	4205664	4205669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115273
85567	NC_004337	CTG	2	6	4205769	4205774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115273
85568	NC_004337	CGTT	2	8	4205779	4205786	0 %	50 %	25 %	25 %	24115273
85569	NC_004337	GAT	2	6	4205810	4205815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115273
85570	NC_004337	GCC	2	6	4205837	4205842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24115273
85571	NC_004337	TGG	2	6	4205870	4205875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24115273
85572	NC_004337	TCG	2	6	4205909	4205914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115273
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85575	NC_004337	CAT	2	6	4205969	4205974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115273
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85577	NC_004337	TGC	2	6	4205995	4206000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115273
85578	NC_004337	CTG	2	6	4206018	4206023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115273
85579	NC_004337	GTC	2	6	4206031	4206036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115273
85580	NC_004337	ACT	2	6	4206145	4206150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115273
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85583	NC_004337	GAA	2	6	4206293	4206298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24115273
85584	NC_004337	GAA	2	6	4206312	4206317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24115273
85585	NC_004337	CTG	2	6	4206366	4206371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115273
85586	NC_004337	TGA	2	6	4206550	4206555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115273
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85588	NC_004337	ATC	2	6	4206597	4206602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115273
85589	NC_004337	TAC	2	6	4206633	4206638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115273
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85592	NC_004337	TAG	2	6	4206790	4206795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115273
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85598	NC_004337	GCAGAA	2	12	4207071	4207082	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	24115273
85599	NC_004337	GTCTG	2	10	4207109	4207118	0 %	40 %	40 %	20 %	24115273
85600	NC_004337	ACA	2	6	4207138	4207143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24115273
85601	NC_004337	GCG	2	6	4207164	4207169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115273
85602	NC_004337	GAT	2	6	4207190	4207195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115273
85603	NC_004337	TTA	2	6	4207219	4207224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24115273
85604	NC_004337	ATG	2	6	4207272	4207277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115273
85605	NC_004337	CAT	2	6	4207361	4207366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115273
85606	NC_004337	CCAC	2	8	4207426	4207433	25 %	0 %	0 %	75 %	24115273
85607	NC_004337	TCG	2	6	4207493	4207498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115273
85608	NC_004337	TGG	2	6	4207522	4207527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24115273
85609	NC_004337	ATG	2	6	4207563	4207568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115273
85610	NC_004337	G	6	6	4207583	4207588	0 %	0 %	100 %	0 %	24115273
85611	NC_004337	CTG	2	6	4207633	4207638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115273
85612	NC_004337	CTG	2	6	4207660	4207665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115273
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85617	NC_004337	CAT	2	6	4207823	4207828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115273
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