MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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78502	NC_004337	GCA	2	6	3861998	3862003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480408
78503	NC_004337	GTT	2	6	3862022	3862027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56480408
78504	NC_004337	GCA	2	6	3862148	3862153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480408
78505	NC_004337	CCGC	2	8	3862183	3862190	0 %	0 %	25 %	75 %	56480408
78506	NC_004337	CTG	2	6	3862191	3862196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480408
78507	NC_004337	CGATA	2	10	3862247	3862256	40 %	20 %	20 %	20 %	56480408
78508	NC_004337	AGCC	2	8	3862257	3862264	25 %	0 %	25 %	50 %	56480408
78509	NC_004337	CGC	2	6	3862313	3862318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480408
78510	NC_004337	GCC	2	6	3862326	3862331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480408
78511	NC_004337	CAC	2	6	3862353	3862358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480408
78512	NC_004337	GTC	2	6	3862398	3862403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480408
78513	NC_004337	GCC	2	6	3862419	3862424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480408
78514	NC_004337	TCTT	2	8	3862441	3862448	0 %	75 %	0 %	25 %	56480408
78515	NC_004337	GCT	2	6	3862532	3862537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480408
78516	NC_004337	TGA	2	6	3862538	3862543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480408
78517	NC_004337	ACC	2	6	3862579	3862584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480408
78518	NC_004337	TTC	2	6	3862597	3862602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56480408
78519	NC_004337	ACC	2	6	3862647	3862652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480408
78520	NC_004337	CTT	2	6	3862706	3862711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56480408
78521	NC_004337	ACGC	2	8	3862761	3862768	25 %	0 %	25 %	50 %	56480408
78522	NC_004337	CTT	2	6	3862781	3862786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56480408
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78525	NC_004337	T	6	6	3862905	3862910	0 %	100 %	0 %	0 %	56480408
78526	NC_004337	TAG	2	6	3863011	3863016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480408
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78530	NC_004337	CAG	2	6	3863130	3863135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480408
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78533	NC_004337	AGT	2	6	3863184	3863189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480408
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78535	NC_004337	TA	4	8	3863329	3863336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78536	NC_004337	CAT	2	6	3863344	3863349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78537	NC_004337	TAAA	2	8	3863363	3863370	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78538	NC_004337	GA	3	6	3863372	3863377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78539	NC_004337	CA	3	6	3863524	3863529	50 %	0 %	0 %	50 %	24114981
78540	NC_004337	CGC	2	6	3863571	3863576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78541	NC_004337	ATT	2	6	3863580	3863585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78542	NC_004337	TGC	2	6	3863604	3863609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78543	NC_004337	ATG	2	6	3863629	3863634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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78552	NC_004337	CTG	2	6	3864112	3864117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114983
78553	NC_004337	TGGC	2	8	3864150	3864157	0 %	25 %	50 %	25 %	24114983
78554	NC_004337	ACA	2	6	3864246	3864251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114983
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78556	NC_004337	T	7	7	3864442	3864448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78557	NC_004337	A	6	6	3864483	3864488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78558	NC_004337	GAAGC	2	10	3864519	3864528	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78559	NC_004337	TTAC	2	8	3864566	3864573	25 %	50 %	0 %	25 %	24114984
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78569	NC_004337	TTCAC	2	10	3864882	3864891	20 %	40 %	0 %	40 %	24114984
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78581	NC_004337	CAG	2	6	3865652	3865657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114984
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78585	NC_004337	GAAAA	2	10	3865981	3865990	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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78607	NC_004337	GA	3	6	3866671	3866676	50 %	0 %	50 %	0 %	56480409
78608	NC_004337	CAAC	2	8	3866684	3866691	50 %	0 %	0 %	50 %	56480409
78609	NC_004337	CGA	2	6	3866830	3866835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480409
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78980	NC_004337	A	8	8	3885204	3885211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78981	NC_004337	ACCTG	2	10	3885297	3885306	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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78984	NC_004337	GGC	2	6	3885449	3885454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56480415
78985	NC_004337	CTG	2	6	3885560	3885565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480415
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