MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
78001	NC_004337	CAT	2	6	3836272	3836277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78002	NC_004337	TA	4	8	3836371	3836378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78003	NC_004337	CAA	2	6	3836415	3836420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78004	NC_004337	TCC	2	6	3836436	3836441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78005	NC_004337	ACC	2	6	3836468	3836473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114956
78006	NC_004337	TGT	2	6	3836482	3836487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114956
78007	NC_004337	CGC	2	6	3836488	3836493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114956
78008	NC_004337	AAGC	2	8	3836529	3836536	50 %	0 %	25 %	25 %	24114956
78009	NC_004337	CAGGTG	2	12	3836541	3836552	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	24114956
78010	NC_004337	AGAA	2	8	3836598	3836605	75 %	0 %	25 %	0 %	24114956
78011	NC_004337	TAA	2	6	3836611	3836616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24114956
78012	NC_004337	TTC	2	6	3836638	3836643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114956
78013	NC_004337	CGC	2	6	3836697	3836702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114956
78014	NC_004337	GGC	2	6	3836756	3836761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114956
78015	NC_004337	GTG	2	6	3836762	3836767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114956
78016	NC_004337	AAG	2	6	3836852	3836857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114956
78017	NC_004337	GAT	2	6	3836861	3836866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114956
78018	NC_004337	GTA	2	6	3836921	3836926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114956
78019	NC_004337	CGC	2	6	3836927	3836932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114956
78020	NC_004337	CTTC	2	8	3836949	3836956	0 %	50 %	0 %	50 %	24114956
78021	NC_004337	AAC	2	6	3836999	3837004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114956
78022	NC_004337	ACG	2	6	3837057	3837062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114956
78023	NC_004337	CGC	2	6	3837067	3837072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114956
78024	NC_004337	GTTC	2	8	3837073	3837080	0 %	50 %	25 %	25 %	24114956
78025	NC_004337	AAC	2	6	3837131	3837136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114956
78026	NC_004337	CCGA	2	8	3837182	3837189	25 %	0 %	25 %	50 %	24114956
78027	NC_004337	GCA	2	6	3837206	3837211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114956
78028	NC_004337	ACCA	2	8	3837251	3837258	50 %	0 %	0 %	50 %	24114956
78029	NC_004337	AGA	2	6	3837318	3837323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114956
78030	NC_004337	TTC	2	6	3837353	3837358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114956
78031	NC_004337	TAA	2	6	3837491	3837496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24114956
78032	NC_004337	CGC	2	6	3837523	3837528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78033	NC_004337	GGC	2	6	3837654	3837659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344915354
78034	NC_004337	ATT	2	6	3837688	3837693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344915354
78035	NC_004337	TC	3	6	3837695	3837700	0 %	50 %	0 %	50 %	344915354
78036	NC_004337	ATC	2	6	3837703	3837708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344915354
78037	NC_004337	TCC	2	6	3837709	3837714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344915354
78038	NC_004337	GCT	2	6	3837834	3837839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915354
78039	NC_004337	CTGA	2	8	3837877	3837884	25 %	25 %	25 %	25 %	344915354
78040	NC_004337	CTGG	2	8	3837893	3837900	0 %	25 %	50 %	25 %	344915354
78041	NC_004337	GCT	2	6	3837930	3837935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915354
78042	NC_004337	TTG	2	6	3838046	3838051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344915354
78043	NC_004337	GC	3	6	3838052	3838057	0 %	0 %	50 %	50 %	344915354
78044	NC_004337	GGTATC	2	12	3838078	3838089	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344915354
78045	NC_004337	CAT	2	6	3838113	3838118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344915354
78046	NC_004337	ATT	2	6	3838120	3838125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344915354
78047	NC_004337	GCG	2	6	3838135	3838140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344915354
78048	NC_004337	TGA	3	9	3838172	3838180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344915354
78049	NC_004337	CAC	2	6	3838206	3838211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344915354
78050	NC_004337	TTC	2	6	3838235	3838240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344915354
78051	NC_004337	CGG	2	6	3838263	3838268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344915354
78052	NC_004337	CAT	2	6	3838269	3838274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344915354
78053	NC_004337	GCTGGG	2	12	3838275	3838286	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	344915354
78054	NC_004337	CG	3	6	3838288	3838293	0 %	0 %	50 %	50 %	344915354
78055	NC_004337	ATC	2	6	3838321	3838326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344915354
78056	NC_004337	CGAA	2	8	3838394	3838401	50 %	0 %	25 %	25 %	344915354
78057	NC_004337	GCGGAA	2	12	3838405	3838416	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	344915354
78058	NC_004337	CGC	2	6	3838485	3838490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344915354
78059	NC_004337	GCG	2	6	3838566	3838571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114958
78060	NC_004337	CGC	2	6	3838584	3838589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114958
78061	NC_004337	CGC	2	6	3838605	3838610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114958
78062	NC_004337	CGA	2	6	3838645	3838650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114958
78063	NC_004337	CCA	2	6	3838690	3838695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114958
78064	NC_004337	CGC	3	9	3838744	3838752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114958
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78066	NC_004337	CGC	2	6	3838831	3838836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114958
78067	NC_004337	CTGG	2	8	3838883	3838890	0 %	25 %	50 %	25 %	24114958
78068	NC_004337	TGGT	2	8	3838942	3838949	0 %	50 %	50 %	0 %	24114958
78069	NC_004337	GTG	2	6	3838968	3838973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114958
78070	NC_004337	GGGC	2	8	3838999	3839006	0 %	0 %	75 %	25 %	24114958
78071	NC_004337	GCGCTG	2	12	3839013	3839024	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	24114958
78072	NC_004337	CAC	2	6	3839048	3839053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114958
78073	NC_004337	GAT	2	6	3839126	3839131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114958
78074	NC_004337	CTG	2	6	3839181	3839186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114958
78075	NC_004337	CGC	2	6	3839215	3839220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114958
78076	NC_004337	ATG	2	6	3839262	3839267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114958
78077	NC_004337	CAA	2	6	3839331	3839336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114958
78078	NC_004337	CTG	3	9	3839376	3839384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114958
78079	NC_004337	GC	3	6	3839394	3839399	0 %	0 %	50 %	50 %	24114958
78080	NC_004337	GTT	2	6	3839400	3839405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114958
78081	NC_004337	GAA	2	6	3839411	3839416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114958
78082	NC_004337	GCG	2	6	3839443	3839448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78083	NC_004337	CTA	2	6	3839574	3839579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114959
78084	NC_004337	GCT	2	6	3839673	3839678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114959
78085	NC_004337	CAA	2	6	3839688	3839693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114959
78086	NC_004337	AGC	2	6	3839714	3839719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114959
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78088	NC_004337	CTG	2	6	3839782	3839787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114959
78089	NC_004337	ACA	2	6	3839846	3839851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114959
78090	NC_004337	CT	5	10	3839976	3839985	0 %	50 %	0 %	50 %	24114959
78091	NC_004337	GGT	2	6	3839986	3839991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114959
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78101	NC_004337	CGCA	2	8	3840372	3840379	25 %	0 %	25 %	50 %	56480402
78102	NC_004337	TGA	2	6	3840382	3840387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480402
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78104	NC_004337	AGC	3	9	3840406	3840414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480402
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78107	NC_004337	TGCG	2	8	3840522	3840529	0 %	25 %	50 %	25 %	56480402
78108	NC_004337	GCGA	2	8	3840555	3840562	25 %	0 %	50 %	25 %	56480402
78109	NC_004337	CAG	2	6	3840663	3840668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480402
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78112	NC_004337	CG	3	6	3840746	3840751	0 %	0 %	50 %	50 %	56480402
78113	NC_004337	A	6	6	3840792	3840797	100 %	0 %	0 %	0 %	56480402
78114	NC_004337	TGA	2	6	3840832	3840837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480402
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