MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
76001	NC_004337	CAG	2	6	3738918	3738923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114863
76002	NC_004337	TCT	2	6	3738946	3738951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114863
76003	NC_004337	CCAGGT	2	12	3738969	3738980	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	24114863
76004	NC_004337	TGC	2	6	3738988	3738993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114863
76005	NC_004337	GCGG	2	8	3739035	3739042	0 %	0 %	75 %	25 %	24114863
76006	NC_004337	ATC	2	6	3739050	3739055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114863
76007	NC_004337	GGT	2	6	3739065	3739070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114863
76008	NC_004337	TGA	2	6	3739099	3739104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114863
76009	NC_004337	CGG	2	6	3739133	3739138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114863
76010	NC_004337	GGT	2	6	3739173	3739178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114863
76011	NC_004337	GT	4	8	3739261	3739268	0 %	50 %	50 %	0 %	24114863
76012	NC_004337	GCG	2	6	3739269	3739274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114863
76013	NC_004337	AGA	3	9	3739328	3739336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114863
76014	NC_004337	AGC	2	6	3739346	3739351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114863
76015	NC_004337	TCG	2	6	3739355	3739360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114863
76016	NC_004337	ACGT	2	8	3739435	3739442	25 %	25 %	25 %	25 %	24114863
76017	NC_004337	ATC	2	6	3739446	3739451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114863
76018	NC_004337	TGC	2	6	3739498	3739503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114863
76019	NC_004337	CAA	2	6	3739559	3739564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114863
76020	NC_004337	GCC	2	6	3739568	3739573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114863
76021	NC_004337	TCA	2	6	3739588	3739593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114863
76022	NC_004337	TGACC	2	10	3739601	3739610	20 %	20 %	20 %	40 %	24114863
76023	NC_004337	TGC	2	6	3739706	3739711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114863
76024	NC_004337	AAGTGA	2	12	3739732	3739743	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	24114863
76025	NC_004337	AGC	2	6	3739826	3739831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114863
76026	NC_004337	AGA	2	6	3739838	3739843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114863
76027	NC_004337	AGC	2	6	3739864	3739869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114863
76028	NC_004337	ACGGT	2	10	3739969	3739978	20 %	20 %	40 %	20 %	24114863
76029	NC_004337	GTG	2	6	3740010	3740015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114863
76030	NC_004337	GAA	3	9	3740049	3740057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114863
76031	NC_004337	AAC	2	6	3740097	3740102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114863
76032	NC_004337	GAT	2	6	3740142	3740147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114863
76033	NC_004337	CA	3	6	3740170	3740175	50 %	0 %	0 %	50 %	24114863
76034	NC_004337	CCA	2	6	3740176	3740181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114863
76035	NC_004337	CTG	2	6	3740202	3740207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114863
76036	NC_004337	GTAA	2	8	3740215	3740222	50 %	25 %	25 %	0 %	24114863
76037	NC_004337	CTC	2	6	3740237	3740242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76038	NC_004337	TGA	2	6	3740300	3740305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76039	NC_004337	CTG	2	6	3740371	3740376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480382
76040	NC_004337	GGT	2	6	3740418	3740423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480382
76041	NC_004337	CAG	2	6	3740514	3740519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480382
76042	NC_004337	TGA	2	6	3740526	3740531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480382
76043	NC_004337	CCG	2	6	3740570	3740575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480382
76044	NC_004337	CAT	2	6	3740664	3740669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480382
76045	NC_004337	CAC	2	6	3740694	3740699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480382
76046	NC_004337	TGA	2	6	3740717	3740722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480382
76047	NC_004337	AGA	2	6	3740754	3740759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480382
76048	NC_004337	CCG	2	6	3740780	3740785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480382
76049	NC_004337	CTTCGG	2	12	3740804	3740815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480382
76050	NC_004337	TCA	2	6	3741009	3741014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480382
76051	NC_004337	CGA	2	6	3741036	3741041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480382
76052	NC_004337	CG	3	6	3741049	3741054	0 %	0 %	50 %	50 %	56480382
76053	NC_004337	GAA	2	6	3741073	3741078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480382
76054	NC_004337	GTG	2	6	3741080	3741085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480382
76055	NC_004337	GCG	2	6	3741127	3741132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56480382
76056	NC_004337	GAT	2	6	3741178	3741183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480382
76057	NC_004337	GAT	2	6	3741328	3741333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480382
76058	NC_004337	GCA	2	6	3741352	3741357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480382
76059	NC_004337	GGC	2	6	3741381	3741386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56480382
76060	NC_004337	GCAAT	2	10	3741454	3741463	40 %	20 %	20 %	20 %	56480382
76061	NC_004337	TGG	2	6	3741466	3741471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114865
76062	NC_004337	CAA	2	6	3741523	3741528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114865
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76064	NC_004337	TCT	2	6	3741638	3741643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114865
76065	NC_004337	CGACGG	2	12	3741704	3741715	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	24114865
76066	NC_004337	CTG	2	6	3741798	3741803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114865
76067	NC_004337	ACG	2	6	3741829	3741834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114865
76068	NC_004337	CGA	3	9	3741854	3741862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114865
76069	NC_004337	ACTGC	2	10	3741884	3741893	20 %	20 %	20 %	40 %	24114865
76070	NC_004337	GGC	2	6	3741896	3741901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114865
76071	NC_004337	ACC	2	6	3741905	3741910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114865
76072	NC_004337	GCC	2	6	3741911	3741916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114865
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76076	NC_004337	ACTG	2	8	3742001	3742008	25 %	25 %	25 %	25 %	24114865
76077	NC_004337	A	7	7	3742031	3742037	100 %	0 %	0 %	0 %	24114865
76078	NC_004337	CGA	2	6	3742098	3742103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532141308
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76081	NC_004337	AAG	2	6	3742241	3742246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532141308
76082	NC_004337	ATG	2	6	3742272	3742277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532141308
76083	NC_004337	GCC	2	6	3742312	3742317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76084	NC_004337	TTTAG	2	10	3742321	3742330	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76085	NC_004337	AAT	2	6	3742374	3742379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76086	NC_004337	GCT	2	6	3742385	3742390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76087	NC_004337	TAT	2	6	3742394	3742399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76088	NC_004337	TTAA	2	8	3742417	3742424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76089	NC_004337	TCA	2	6	3742484	3742489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76090	NC_004337	TTTATC	2	12	3742533	3742544	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76091	NC_004337	AAG	2	6	3742561	3742566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114866
76092	NC_004337	A	7	7	3742570	3742576	100 %	0 %	0 %	0 %	24114866
76093	NC_004337	CCA	2	6	3742616	3742621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114866
76094	NC_004337	AAG	2	6	3742741	3742746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114866
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76097	NC_004337	A	6	6	3742788	3742793	100 %	0 %	0 %	0 %	24114866
76098	NC_004337	GAA	2	6	3742817	3742822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114866
76099	NC_004337	TGG	2	6	3742837	3742842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114866
76100	NC_004337	GAC	2	6	3742928	3742933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76101	NC_004337	TGT	2	6	3743138	3743143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114867
76102	NC_004337	TCAGAT	2	12	3743145	3743156	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24114867
76103	NC_004337	GCCA	2	8	3743232	3743239	25 %	0 %	25 %	50 %	24114867
76104	NC_004337	CAG	2	6	3743272	3743277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114867
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76106	NC_004337	TCC	2	6	3743337	3743342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24114867
76107	NC_004337	CAGC	2	8	3743365	3743372	25 %	0 %	25 %	50 %	24114867
76108	NC_004337	ATCAC	2	10	3743429	3743438	40 %	20 %	0 %	40 %	24114867
76109	NC_004337	T	6	6	3743479	3743484	0 %	100 %	0 %	0 %	24114868
76110	NC_004337	CAC	2	6	3743682	3743687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114868
76111	NC_004337	AGGA	2	8	3743705	3743712	50 %	0 %	50 %	0 %	24114868
76112	NC_004337	ATGGAA	2	12	3743719	3743730	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	24114868
76113	NC_004337	CAT	2	6	3743755	3743760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76114	NC_004337	GCA	2	6	3743780	3743785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76115	NC_004337	CAA	2	6	3743790	3743795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76116	NC_004337	AT	3	6	3743879	3743884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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