MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_004337	CTGGT	2	10	322293	322302	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6502	NC_004337	CAA	2	6	322423	322428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_004337	GGT	2	6	322492	322497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_004337	TA	3	6	322516	322521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_004337	ATA	2	6	322537	322542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_004337	TAA	2	6	322565	322570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_004337	CA	3	6	322616	322621	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6508	NC_004337	TAA	2	6	322648	322653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111751
6509	NC_004337	TA	3	6	322723	322728	50 %	50 %	0 %	0 %	24111751
6510	NC_004337	TTGGG	2	10	322740	322749	0 %	40 %	60 %	0 %	24111751
6511	NC_004337	GCT	2	6	322805	322810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111751
6512	NC_004337	T	7	7	322813	322819	0 %	100 %	0 %	0 %	24111751
6513	NC_004337	A	8	8	322826	322833	100 %	0 %	0 %	0 %	24111751
6514	NC_004337	TAA	3	9	322914	322922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111751
6515	NC_004337	GATT	2	8	322945	322952	25 %	50 %	25 %	0 %	24111751
6516	NC_004337	AT	3	6	322953	322958	50 %	50 %	0 %	0 %	24111751
6517	NC_004337	ATATA	2	10	322974	322983	60 %	40 %	0 %	0 %	24111751
6518	NC_004337	TGT	2	6	323121	323126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111751
6519	NC_004337	TGG	2	6	323201	323206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111751
6520	NC_004337	ATGT	2	8	323224	323231	25 %	50 %	25 %	0 %	24111751
6521	NC_004337	T	6	6	323255	323260	0 %	100 %	0 %	0 %	24111751
6522	NC_004337	TCT	2	6	323286	323291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111751
6523	NC_004337	ACT	2	6	323320	323325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111751
6524	NC_004337	ATA	2	6	323375	323380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111751
6525	NC_004337	AGT	2	6	323384	323389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111751
6526	NC_004337	TAT	2	6	323410	323415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111751
6527	NC_004337	CAC	2	6	323416	323421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111751
6528	NC_004337	AAT	2	6	323458	323463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111751
6529	NC_004337	GAA	2	6	323493	323498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111751
6530	NC_004337	ATT	2	6	323536	323541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111751
6531	NC_004337	AT	3	6	323606	323611	50 %	50 %	0 %	0 %	24111751
6532	NC_004337	AATT	2	8	323704	323711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_004337	AT	3	6	323726	323731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_004337	TTTC	2	8	323787	323794	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6535	NC_004337	GAAA	2	8	323876	323883	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_004337	TTA	2	6	323913	323918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_004337	GGT	2	6	323946	323951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_004337	AAC	2	6	323973	323978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_004337	TGA	2	6	323987	323992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_004337	ATT	2	6	324019	324024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_004337	C	6	6	324060	324065	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6542	NC_004337	TAT	2	6	324107	324112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_004337	CAA	2	6	324198	324203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_004337	TATG	2	8	324329	324336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_004337	TAAA	2	8	324359	324366	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_004337	TAT	2	6	324432	324437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_004337	CAA	2	6	324440	324445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_004337	TATT	2	8	324466	324473	25 %	75 %	0 %	0 %	24111752
6549	NC_004337	TAC	2	6	324498	324503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111752
6550	NC_004337	AGC	2	6	324517	324522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111752
6551	NC_004337	T	6	6	324531	324536	0 %	100 %	0 %	0 %	24111752
6552	NC_004337	GTTTC	2	10	324551	324560	0 %	60 %	20 %	20 %	24111752
6553	NC_004337	ATC	2	6	324561	324566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111752
6554	NC_004337	TCA	2	6	324646	324651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111752
6555	NC_004337	TTA	2	6	324653	324658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111752
6556	NC_004337	CAA	2	6	324692	324697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111752
6557	NC_004337	CAC	2	6	324716	324721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111752
6558	NC_004337	CAT	2	6	324791	324796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111752
6559	NC_004337	CAG	2	6	324900	324905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111753
6560	NC_004337	GCA	2	6	325133	325138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111753
6561	NC_004337	GCT	2	6	325214	325219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111753
6562	NC_004337	CAG	2	6	325300	325305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111753
6563	NC_004337	CG	3	6	325306	325311	0 %	0 %	50 %	50 %	24111753
6564	NC_004337	GCC	2	6	325335	325340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111753
6565	NC_004337	CCA	2	6	325368	325373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111753
6566	NC_004337	CTC	2	6	325384	325389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24111753
6567	NC_004337	AGT	2	6	325404	325409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111753
6568	NC_004337	CAT	2	6	325410	325415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111753
6569	NC_004337	CTT	2	6	325489	325494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111753
6570	NC_004337	T	7	7	325569	325575	0 %	100 %	0 %	0 %	24111754
6571	NC_004337	AGC	2	6	325577	325582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111754
6572	NC_004337	TGA	2	6	325587	325592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111754
6573	NC_004337	GAC	2	6	325639	325644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111754
6574	NC_004337	TTA	2	6	325704	325709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111754
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6576	NC_004337	TG	3	6	326025	326030	0 %	50 %	50 %	0 %	24111754
6577	NC_004337	CAG	2	6	326093	326098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111754
6578	NC_004337	GGTTCG	2	12	326122	326133	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	24111754
6579	NC_004337	GAT	2	6	326213	326218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111754
6580	NC_004337	GCC	2	6	326245	326250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111754
6581	NC_004337	TCA	2	6	326310	326315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111754
6582	NC_004337	TCTG	2	8	326324	326331	0 %	50 %	25 %	25 %	24111754
6583	NC_004337	TAA	2	6	326355	326360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111754
6584	NC_004337	TTG	2	6	326408	326413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_004337	T	7	7	326473	326479	0 %	100 %	0 %	0 %	24111755
6586	NC_004337	AT	3	6	326481	326486	50 %	50 %	0 %	0 %	24111755
6587	NC_004337	GGC	2	6	326587	326592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111755
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6589	NC_004337	AGGA	2	8	326761	326768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_004337	GAAA	2	8	326908	326915	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_004337	AGGC	2	8	327009	327016	25 %	0 %	50 %	25 %	24111756
6592	NC_004337	GT	3	6	327101	327106	0 %	50 %	50 %	0 %	24111756
6593	NC_004337	A	6	6	327132	327137	100 %	0 %	0 %	0 %	24111756
6594	NC_004337	CGGAT	2	10	327159	327168	20 %	20 %	40 %	20 %	24111756
6595	NC_004337	A	7	7	327296	327302	100 %	0 %	0 %	0 %	24111756
6596	NC_004337	CTA	2	6	327381	327386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111756
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6598	NC_004337	GCTG	2	8	327466	327473	0 %	25 %	50 %	25 %	24111756
6599	NC_004337	TGAT	2	8	327496	327503	25 %	50 %	25 %	0 %	24111756
6600	NC_004337	TGT	2	6	327527	327532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111756
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6603	NC_004337	AG	3	6	327632	327637	50 %	0 %	50 %	0 %	24111756
6604	NC_004337	A	6	6	327693	327698	100 %	0 %	0 %	0 %	24111756
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6607	NC_004337	TGA	2	6	327839	327844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111756
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6609	NC_004337	TCG	2	6	327953	327958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111756
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6612	NC_004337	ATG	2	6	328069	328074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111756
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6614	NC_004337	AGCA	2	8	328169	328176	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6615	NC_004337	TGA	2	6	328202	328207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_004337	ATG	2	6	328228	328233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_004337	AT	4	8	328239	328246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_004337	CA	3	6	328284	328289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6619	NC_004337	AGA	2	6	328295	328300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_004337	GT	3	6	328333	328338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_004337	TCA	2	6	328351	328356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_004337	GCAT	2	8	328426	328433	25 %	25 %	25 %	25 %	24111757
6623	NC_004337	TAT	2	6	328453	328458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111757
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6626	NC_004337	TTG	2	6	328528	328533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111757
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