MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 48304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004116	TTG	2	6	9	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004116	TTC	2	6	21	26	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004116	T	7	7	47	53	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004116	AAT	2	6	69	74	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004116	GAA	2	6	93	98	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004116	AAC	2	6	115	120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536186
7	NC_004116	CAG	2	6	166	171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536186
8	NC_004116	T	6	6	180	185	0 %	100 %	0 %	0 %	22536186
9	NC_004116	CTC	2	6	201	206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22536186
10	NC_004116	TTA	2	6	229	234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536186
11	NC_004116	TGAAA	2	10	248	257	60 %	20 %	20 %	0 %	22536186
12	NC_004116	ATTTAC	2	12	352	363	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	22536186
13	NC_004116	G	7	7	559	565	0 %	0 %	100 %	0 %	22536186
14	NC_004116	CTA	2	6	588	593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536186
15	NC_004116	CTG	2	6	652	657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536186
16	NC_004116	TTA	2	6	664	669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536186
17	NC_004116	GTCA	2	8	678	685	25 %	25 %	25 %	25 %	22536186
18	NC_004116	GAA	2	6	705	710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536186
19	NC_004116	AAAAG	2	10	713	722	80 %	0 %	20 %	0 %	22536186
20	NC_004116	TGAT	2	8	745	752	25 %	50 %	25 %	0 %	22536186
21	NC_004116	G	6	6	783	788	0 %	0 %	100 %	0 %	22536186
22	NC_004116	TTC	2	6	801	806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536186
23	NC_004116	TACA	2	8	823	830	50 %	25 %	0 %	25 %	22536186
24	NC_004116	AGA	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536186
25	NC_004116	CAC	2	6	937	942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22536186
26	NC_004116	ACGT	2	8	1048	1055	25 %	25 %	25 %	25 %	22536186
27	NC_004116	ATG	2	6	1159	1164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536186
28	NC_004116	AGA	2	6	1190	1195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536186
29	NC_004116	TAA	2	6	1385	1390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536186
30	NC_004116	A	6	6	1394	1399	100 %	0 %	0 %	0 %	22536186
31	NC_004116	AAAAT	2	10	1447	1456	80 %	20 %	0 %	0 %	22536186
32	NC_004116	CTA	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_004116	TAC	2	6	1581	1586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_004116	AT	3	6	1600	1605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004116	AATA	2	8	1632	1639	75 %	25 %	0 %	0 %	22536187
36	NC_004116	TCT	2	6	1646	1651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536187
37	NC_004116	ATT	2	6	1870	1875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536187
38	NC_004116	AAC	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536187
39	NC_004116	ACA	2	6	2005	2010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536187
40	NC_004116	AAACT	2	10	2030	2039	60 %	20 %	0 %	20 %	22536187
41	NC_004116	ATT	2	6	2050	2055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536187
42	NC_004116	TGC	2	6	2070	2075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536187
43	NC_004116	CAA	2	6	2080	2085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536187
44	NC_004116	AAAT	2	8	2130	2137	75 %	25 %	0 %	0 %	22536187
45	NC_004116	TAA	2	6	2205	2210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536187
46	NC_004116	GTT	2	6	2221	2226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536187
47	NC_004116	GAT	2	6	2266	2271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536187
48	NC_004116	TCT	2	6	2291	2296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536187
49	NC_004116	CCT	2	6	2379	2384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22536187
50	NC_004116	CGATT	2	10	2657	2666	20 %	40 %	20 %	20 %	22536187
51	NC_004116	TAA	2	6	2729	2734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536187
52	NC_004116	ACTA	2	8	2746	2753	50 %	25 %	0 %	25 %	22536187
53	NC_004116	ATG	2	6	2812	2817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004116	TA	4	8	2831	2838	50 %	50 %	0 %	0 %	22536188
55	NC_004116	TAA	2	6	2859	2864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536188
56	NC_004116	TTG	2	6	2879	2884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536188
57	NC_004116	ACAGA	2	10	2932	2941	60 %	0 %	20 %	20 %	22536188
58	NC_004116	GAT	2	6	2944	2949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536188
59	NC_004116	A	8	8	2951	2958	100 %	0 %	0 %	0 %	22536188
60	NC_004116	AAAG	2	8	2986	2993	75 %	0 %	25 %	0 %	22536188
61	NC_004116	ATC	2	6	2996	3001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536188
62	NC_004116	AGG	2	6	3012	3017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536188
63	NC_004116	TTA	2	6	3072	3077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536188
64	NC_004116	CAGA	2	8	3151	3158	50 %	0 %	25 %	25 %	22536188
65	NC_004116	TTTA	2	8	3181	3188	25 %	75 %	0 %	0 %	22536188
66	NC_004116	TAAAA	2	10	3261	3270	80 %	20 %	0 %	0 %	22536188
67	NC_004116	A	6	6	3267	3272	100 %	0 %	0 %	0 %	22536188
68	NC_004116	ATT	2	6	3330	3335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536188
69	NC_004116	TTC	2	6	3339	3344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536188
70	NC_004116	GA	3	6	3368	3373	50 %	0 %	50 %	0 %	22536188
71	NC_004116	CAG	2	6	3379	3384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536188
72	NC_004116	T	6	6	3405	3410	0 %	100 %	0 %	0 %	22536188
73	NC_004116	TAT	2	6	3536	3541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536188
74	NC_004116	TAC	2	6	3561	3566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536188
75	NC_004116	TTGA	2	8	3628	3635	25 %	50 %	25 %	0 %	22536188
76	NC_004116	A	6	6	3683	3688	100 %	0 %	0 %	0 %	22536188
77	NC_004116	TA	3	6	3695	3700	50 %	50 %	0 %	0 %	22536188
78	NC_004116	TTG	2	6	3734	3739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536189
79	NC_004116	A	6	6	3745	3750	100 %	0 %	0 %	0 %	22536189
80	NC_004116	ATG	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536189
81	NC_004116	A	7	7	3891	3897	100 %	0 %	0 %	0 %	22536189
82	NC_004116	AAT	2	6	3928	3933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004116	AAT	2	6	3965	3970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004116	AGA	2	6	4014	4019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004116	GGT	2	6	4022	4027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004116	TTAT	2	8	4057	4064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004116	ATT	2	6	4270	4275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536190
88	NC_004116	CTA	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536190
89	NC_004116	ATT	2	6	4288	4293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536190
90	NC_004116	TCT	2	6	4401	4406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_004116	TCT	2	6	4422	4427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_004116	T	6	6	4429	4434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004116	ATA	2	6	4438	4443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004116	TTGA	2	8	4447	4454	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004116	CAG	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536191
96	NC_004116	TTTA	2	8	4527	4534	25 %	75 %	0 %	0 %	22536191
97	NC_004116	GCT	2	6	4561	4566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536191
98	NC_004116	TGGTA	2	10	4599	4608	20 %	40 %	40 %	0 %	22536191
99	NC_004116	A	7	7	4657	4663	100 %	0 %	0 %	0 %	22536191
100	NC_004116	TAA	2	6	4737	4742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536191
101	NC_004116	TGA	3	9	4797	4805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
102	NC_004116	TCAA	2	8	4903	4910	50 %	25 %	0 %	25 %	22536191
103	NC_004116	A	6	6	4931	4936	100 %	0 %	0 %	0 %	22536191
104	NC_004116	AGA	2	6	5043	5048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536191
105	NC_004116	GTT	2	6	5059	5064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536191
106	NC_004116	T	7	7	5072	5078	0 %	100 %	0 %	0 %	22536191
107	NC_004116	AAC	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536191
108	NC_004116	TGA	2	6	5115	5120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
109	NC_004116	TGA	2	6	5139	5144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
110	NC_004116	AGT	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
111	NC_004116	GAA	3	9	5221	5229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536191
112	NC_004116	TGA	3	9	5241	5249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
113	NC_004116	GCT	2	6	5314	5319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536191
114	NC_004116	ATC	2	6	5321	5326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536191
115	NC_004116	ACTT	2	8	5341	5348	25 %	50 %	0 %	25 %	22536191
116	NC_004116	CTG	2	6	5351	5356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536191
117	NC_004116	GCT	2	6	5410	5415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536191
118	NC_004116	TAT	2	6	5418	5423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536191
119	NC_004116	ATG	2	6	5471	5476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
120	NC_004116	AAG	2	6	5510	5515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536191
121	NC_004116	GAA	2	6	5530	5535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536191
122	NC_004116	TAA	2	6	5593	5598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004116	TTG	2	6	5689	5694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536192
124	NC_004116	ATA	2	6	5734	5739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536192
125	NC_004116	AGA	2	6	5792	5797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536192
126	NC_004116	A	6	6	5842	5847	100 %	0 %	0 %	0 %	22536192
127	NC_004116	TTTAT	2	10	5848	5857	20 %	80 %	0 %	0 %	22536192
128	NC_004116	ACT	2	6	5865	5870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536192
129	NC_004116	CTTA	2	8	5907	5914	25 %	50 %	0 %	25 %	22536192
130	NC_004116	ACA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536192
131	NC_004116	AT	3	6	5946	5951	50 %	50 %	0 %	0 %	22536192
132	NC_004116	GAT	2	6	5952	5957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536192
133	NC_004116	CTG	2	6	6001	6006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536192
134	NC_004116	TAT	2	6	6029	6034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536192
135	NC_004116	TTA	2	6	6106	6111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536192
136	NC_004116	ATG	2	6	6139	6144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536192
137	NC_004116	ATT	3	9	6190	6198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536192
138	NC_004116	A	6	6	6217	6222	100 %	0 %	0 %	0 %	22536192
139	NC_004116	ATT	2	6	6262	6267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536193
140	NC_004116	GTG	2	6	6281	6286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536193
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142	NC_004116	AT	3	6	6447	6452	50 %	50 %	0 %	0 %	22536193
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264	NC_004116	ATC	2	6	12032	12037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536198
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268	NC_004116	TCA	2	6	12141	12146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536199
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270	NC_004116	TTG	2	6	12190	12195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536199
271	NC_004116	GTATTG	2	12	12233	12244	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	22536199
272	NC_004116	CA	3	6	12245	12250	50 %	0 %	0 %	50 %	22536199
273	NC_004116	AGA	3	9	12282	12290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536199
274	NC_004116	AT	3	6	12291	12296	50 %	50 %	0 %	0 %	22536199
275	NC_004116	ATG	2	6	12317	12322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536199
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403	NC_004116	CAG	2	6	16929	16934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
404	NC_004116	AGCG	2	8	16984	16991	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
405	NC_004116	GGA	2	6	17054	17059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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408	NC_004116	CT	3	6	17144	17149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
409	NC_004116	GAA	2	6	17383	17388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
410	NC_004116	GGT	2	6	17457	17462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
411	NC_004116	GTC	2	6	17471	17476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_004116	TCGTG	2	10	17480	17489	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
413	NC_004116	CAT	2	6	17539	17544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
414	NC_004116	TAA	2	6	17574	17579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_004116	GGA	2	6	17583	17588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
416	NC_004116	ATC	2	6	17607	17612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
417	NC_004116	AC	3	6	17634	17639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
418	NC_004116	TGGT	2	8	17649	17656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
419	NC_004116	CGC	2	6	17773	17778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
420	NC_004116	AC	3	6	17803	17808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
421	NC_004116	CAC	2	6	17818	17823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
422	NC_004116	AGCC	2	8	17866	17873	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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432	NC_004116	GAAG	2	8	18403	18410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
433	NC_004116	TAG	2	6	18469	18474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_004116	AG	3	6	18584	18589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_004116	ACA	2	6	18791	18796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_004116	ATG	2	6	18858	18863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_004116	GGA	2	6	18991	18996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_004116	TG	3	6	19467	19472	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
452	NC_004116	AAG	2	6	19473	19478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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