MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 48304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_004116	CCTT	2	8	1854212	1854219	0 %	50 %	0 %	50 %	22538000
41502	NC_004116	CAA	2	6	1854240	1854245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22538000
41503	NC_004116	GTGGTT	2	12	1854255	1854266	0 %	50 %	50 %	0 %	22538000
41504	NC_004116	TCA	2	6	1854275	1854280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538000
41505	NC_004116	CCAA	2	8	1854283	1854290	50 %	0 %	0 %	50 %	22538000
41506	NC_004116	AGC	2	6	1854374	1854379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22538000
41507	NC_004116	GTTT	2	8	1854432	1854439	0 %	75 %	25 %	0 %	22538000
41508	NC_004116	TTC	2	6	1854445	1854450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22538000
41509	NC_004116	TCT	2	6	1854477	1854482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22538000
41510	NC_004116	TA	3	6	1854638	1854643	50 %	50 %	0 %	0 %	22538001
41511	NC_004116	CCT	2	6	1854728	1854733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22538002
41512	NC_004116	ATC	3	9	1854744	1854752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538002
41513	NC_004116	ATG	2	6	1854782	1854787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22538002
41514	NC_004116	CAA	2	6	1854860	1854865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22538002
41515	NC_004116	CTT	2	6	1854907	1854912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22538002
41516	NC_004116	T	6	6	1854948	1854953	0 %	100 %	0 %	0 %	22538002
41517	NC_004116	TTG	2	6	1854978	1854983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22538002
41518	NC_004116	CA	3	6	1854993	1854998	50 %	0 %	0 %	50 %	22538002
41519	NC_004116	TGA	2	6	1855001	1855006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22538002
41520	NC_004116	CAG	2	6	1855025	1855030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22538002
41521	NC_004116	ACA	2	6	1855132	1855137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22538002
41522	NC_004116	ATC	2	6	1855144	1855149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538002
41523	NC_004116	TTA	2	6	1855232	1855237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22538003
41524	NC_004116	CCA	2	6	1855289	1855294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22538003
41525	NC_004116	T	6	6	1855336	1855341	0 %	100 %	0 %	0 %	22538003
41526	NC_004116	TTTCTC	2	12	1855344	1855355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22538003
41527	NC_004116	TCAA	2	8	1855363	1855370	50 %	25 %	0 %	25 %	22538004
41528	NC_004116	TTCT	2	8	1855381	1855388	0 %	75 %	0 %	25 %	22538004
41529	NC_004116	T	6	6	1855392	1855397	0 %	100 %	0 %	0 %	22538004
41530	NC_004116	TTTC	2	8	1855416	1855423	0 %	75 %	0 %	25 %	22538004
41531	NC_004116	TTC	2	6	1855630	1855635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41532	NC_004116	TCA	2	6	1855648	1855653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41533	NC_004116	TCA	2	6	1855731	1855736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538005
41534	NC_004116	ATTGT	2	10	1855751	1855760	20 %	60 %	20 %	0 %	22538005
41535	NC_004116	TG	3	6	1855802	1855807	0 %	50 %	50 %	0 %	22538005
41536	NC_004116	TGA	3	9	1855960	1855968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22538005
41537	NC_004116	TTG	2	6	1855992	1855997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22538005
41538	NC_004116	TTC	2	6	1856003	1856008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22538005
41539	NC_004116	TCC	2	6	1856033	1856038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22538006
41540	NC_004116	TTC	2	6	1856086	1856091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22538006
41541	NC_004116	ATC	2	6	1856110	1856115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538006
41542	NC_004116	GAAT	2	8	1856144	1856151	50 %	25 %	25 %	0 %	22538006
41543	NC_004116	AAGC	2	8	1856161	1856168	50 %	0 %	25 %	25 %	22538006
41544	NC_004116	TGT	2	6	1856315	1856320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22538006
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41547	NC_004116	TCC	2	6	1856683	1856688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22538007
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41549	NC_004116	AGT	2	6	1856713	1856718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22538007
41550	NC_004116	TTG	2	6	1856770	1856775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22538007
41551	NC_004116	TATG	2	8	1856791	1856798	25 %	50 %	25 %	0 %	22538007
41552	NC_004116	AAT	2	6	1856822	1856827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22538007
41553	NC_004116	GCA	2	6	1856933	1856938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22538008
41554	NC_004116	TA	3	6	1856973	1856978	50 %	50 %	0 %	0 %	22538008
41555	NC_004116	GTA	3	9	1857104	1857112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22538008
41556	NC_004116	CAA	2	6	1857144	1857149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22538008
41557	NC_004116	TCTT	3	12	1857152	1857163	0 %	75 %	0 %	25 %	22538008
41558	NC_004116	TGT	2	6	1857165	1857170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22538008
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41562	NC_004116	GCCTCT	2	12	1857290	1857301	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	22538008
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41564	NC_004116	CTT	2	6	1857321	1857326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22538008
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41569	NC_004116	CATT	2	8	1857612	1857619	25 %	50 %	0 %	25 %	22538008
41570	NC_004116	GGATA	2	10	1857660	1857669	40 %	20 %	40 %	0 %	22538008
41571	NC_004116	ATA	2	6	1857734	1857739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22538008
41572	NC_004116	TGA	2	6	1857828	1857833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22538008
41573	NC_004116	C	7	7	1857849	1857855	0 %	0 %	0 %	100 %	22538008
41574	NC_004116	GAG	2	6	1857865	1857870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22538008
41575	NC_004116	TAGC	2	8	1858112	1858119	25 %	25 %	25 %	25 %	22538008
41576	NC_004116	ATTT	3	12	1858128	1858139	25 %	75 %	0 %	0 %	22538008
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41580	NC_004116	TAC	2	6	1858346	1858351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538009
41581	NC_004116	TGA	2	6	1858364	1858369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22538009
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41583	NC_004116	CTGT	2	8	1858512	1858519	0 %	50 %	25 %	25 %	22538009
41584	NC_004116	CTTT	2	8	1858540	1858547	0 %	75 %	0 %	25 %	22538009
41585	NC_004116	GTTC	2	8	1858616	1858623	0 %	50 %	25 %	25 %	22538009
41586	NC_004116	TAA	2	6	1858679	1858684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22538009
41587	NC_004116	TTC	2	6	1858935	1858940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22538009
41588	NC_004116	TTC	2	6	1859001	1859006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22538009
41589	NC_004116	GTG	2	6	1859087	1859092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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41591	NC_004116	ATC	2	6	1859205	1859210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41592	NC_004116	GTTTT	2	10	1859248	1859257	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41593	NC_004116	TTCA	2	8	1859292	1859299	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41594	NC_004116	AAT	2	6	1859307	1859312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41595	NC_004116	TCT	2	6	1859329	1859334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41596	NC_004116	CTTA	2	8	1859391	1859398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41597	NC_004116	TTGA	2	8	1859513	1859520	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41598	NC_004116	ATC	3	9	1859622	1859630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41600	NC_004116	AG	3	6	1859711	1859716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41601	NC_004116	GAT	2	6	1859722	1859727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41602	NC_004116	A	6	6	1859740	1859745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41603	NC_004116	CTA	2	6	1859767	1859772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538010
41604	NC_004116	CAT	2	6	1859790	1859795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538010
41605	NC_004116	CCT	2	6	1859799	1859804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22538010
41606	NC_004116	CT	3	6	1859823	1859828	0 %	50 %	0 %	50 %	22538010
41607	NC_004116	CAT	2	6	1859856	1859861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538010
41608	NC_004116	TTC	2	6	1859905	1859910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22538010
41609	NC_004116	GAA	2	6	1859943	1859948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22538010
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41611	NC_004116	TCA	3	9	1860005	1860013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538010
41612	NC_004116	ATC	2	6	1860022	1860027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538010
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41614	NC_004116	CAA	2	6	1860300	1860305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22538010
41615	NC_004116	T	6	6	1860326	1860331	0 %	100 %	0 %	0 %	22538010
41616	NC_004116	T	6	6	1860364	1860369	0 %	100 %	0 %	0 %	22538010
41617	NC_004116	TCC	2	6	1860378	1860383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22538011
41618	NC_004116	TTCT	2	8	1860453	1860460	0 %	75 %	0 %	25 %	22538011
41619	NC_004116	GAT	2	6	1860461	1860466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22538011
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41621	NC_004116	T	6	6	1860500	1860505	0 %	100 %	0 %	0 %	22538011
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