MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 48304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_004116	CTA	2	6	362169	362174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536532
8002	NC_004116	GTT	2	6	362186	362191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536532
8003	NC_004116	CATAT	2	10	362214	362223	40 %	40 %	0 %	20 %	22536532
8004	NC_004116	CAC	2	6	362229	362234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22536532
8005	NC_004116	GAA	2	6	362300	362305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536532
8006	NC_004116	GA	3	6	362355	362360	50 %	0 %	50 %	0 %	22536532
8007	NC_004116	TTG	2	6	362370	362375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536532
8008	NC_004116	TTC	2	6	362401	362406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536532
8009	NC_004116	CTG	2	6	362502	362507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536532
8010	NC_004116	AGA	2	6	362524	362529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536532
8011	NC_004116	GGA	2	6	362606	362611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536532
8012	NC_004116	GGA	2	6	362641	362646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536532
8013	NC_004116	TGA	2	6	362690	362695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536533
8014	NC_004116	GA	3	6	362705	362710	50 %	0 %	50 %	0 %	22536533
8015	NC_004116	TTCA	2	8	362714	362721	25 %	50 %	0 %	25 %	22536533
8016	NC_004116	TCA	2	6	362798	362803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536533
8017	NC_004116	AGT	2	6	362876	362881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536533
8018	NC_004116	GACTGT	2	12	362900	362911	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22536533
8019	NC_004116	GAA	2	6	363008	363013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536533
8020	NC_004116	TGA	2	6	363025	363030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536533
8021	NC_004116	TGA	2	6	363049	363054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536533
8022	NC_004116	TGCC	2	8	363061	363068	0 %	25 %	25 %	50 %	22536533
8023	NC_004116	C	6	6	363067	363072	0 %	0 %	0 %	100 %	22536533
8024	NC_004116	ATG	2	6	363073	363078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536533
8025	NC_004116	GAA	2	6	363108	363113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536533
8026	NC_004116	TGAT	2	8	363150	363157	25 %	50 %	25 %	0 %	22536533
8027	NC_004116	TTA	2	6	363200	363205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536534
8028	NC_004116	AGA	2	6	363229	363234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536534
8029	NC_004116	T	6	6	363274	363279	0 %	100 %	0 %	0 %	22536534
8030	NC_004116	AGA	2	6	363370	363375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536534
8031	NC_004116	T	6	6	363393	363398	0 %	100 %	0 %	0 %	22536534
8032	NC_004116	GTT	2	6	363434	363439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536534
8033	NC_004116	GTT	2	6	363497	363502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536534
8034	NC_004116	GA	3	6	363593	363598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_004116	ATTG	2	8	363623	363630	25 %	50 %	25 %	0 %	22536535
8036	NC_004116	CTAT	2	8	363697	363704	25 %	50 %	0 %	25 %	22536535
8037	NC_004116	CA	3	6	363729	363734	50 %	0 %	0 %	50 %	22536535
8038	NC_004116	CAG	2	6	363775	363780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536535
8039	NC_004116	TAT	2	6	363805	363810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536535
8040	NC_004116	CTG	2	6	363811	363816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536535
8041	NC_004116	CTA	2	6	363883	363888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536535
8042	NC_004116	TG	3	6	363889	363894	0 %	50 %	50 %	0 %	22536535
8043	NC_004116	GAT	2	6	363974	363979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536535
8044	NC_004116	AGA	2	6	364031	364036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536535
8045	NC_004116	CGGTGG	2	12	364091	364102	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	22536535
8046	NC_004116	CAG	2	6	364126	364131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536535
8047	NC_004116	AGG	2	6	364165	364170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536535
8048	NC_004116	TA	3	6	364214	364219	50 %	50 %	0 %	0 %	22536535
8049	NC_004116	GAA	2	6	364326	364331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536535
8050	NC_004116	CAA	2	6	364365	364370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536535
8051	NC_004116	AGC	2	6	364379	364384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536535
8052	NC_004116	GCT	2	6	364557	364562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536535
8053	NC_004116	AATTT	2	10	364645	364654	40 %	60 %	0 %	0 %	22536535
8054	NC_004116	CTG	2	6	364693	364698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536535
8055	NC_004116	TCC	2	6	364748	364753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22536535
8056	NC_004116	TTA	2	6	364754	364759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536535
8057	NC_004116	A	6	6	364899	364904	100 %	0 %	0 %	0 %	22536535
8058	NC_004116	TAT	2	6	364959	364964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536535
8059	NC_004116	CAAT	2	8	364970	364977	50 %	25 %	0 %	25 %	22536535
8060	NC_004116	AGG	2	6	364978	364983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536535
8061	NC_004116	TTTA	2	8	364993	365000	25 %	75 %	0 %	0 %	22536536
8062	NC_004116	AT	3	6	365014	365019	50 %	50 %	0 %	0 %	22536536
8063	NC_004116	CAAA	2	8	365031	365038	75 %	0 %	0 %	25 %	22536536
8064	NC_004116	TCT	2	6	365048	365053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536536
8065	NC_004116	TGA	2	6	365080	365085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536536
8066	NC_004116	CTT	2	6	365103	365108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536536
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8068	NC_004116	GCT	2	6	365294	365299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536536
8069	NC_004116	GGT	2	6	365329	365334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536536
8070	NC_004116	TAAAA	2	10	365347	365356	80 %	20 %	0 %	0 %	22536536
8071	NC_004116	TAT	2	6	365377	365382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536536
8072	NC_004116	ATT	2	6	365440	365445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536536
8073	NC_004116	AAG	2	6	365511	365516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536536
8074	NC_004116	TAT	2	6	365518	365523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536536
8075	NC_004116	GCA	2	6	365552	365557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536536
8076	NC_004116	TTTA	2	8	365586	365593	25 %	75 %	0 %	0 %	22536536
8077	NC_004116	CAA	2	6	365610	365615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536536
8078	NC_004116	CGG	2	6	365617	365622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22536536
8079	NC_004116	ATT	2	6	365654	365659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536536
8080	NC_004116	GTTG	2	8	365677	365684	0 %	50 %	50 %	0 %	22536536
8081	NC_004116	GTC	2	6	365694	365699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536536
8082	NC_004116	ACA	2	6	365711	365716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536536
8083	NC_004116	GA	3	6	365719	365724	50 %	0 %	50 %	0 %	22536536
8084	NC_004116	TAT	2	6	365785	365790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536536
8085	NC_004116	AAT	2	6	365859	365864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536536
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8088	NC_004116	CTG	2	6	366178	366183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536537
8089	NC_004116	GAG	2	6	366207	366212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536537
8090	NC_004116	TAT	2	6	366272	366277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536537
8091	NC_004116	TAT	3	9	366281	366289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536537
8092	NC_004116	GGA	2	6	366306	366311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536537
8093	NC_004116	TTAGCT	2	12	366315	366326	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22536537
8094	NC_004116	AAC	2	6	366419	366424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536537
8095	NC_004116	AGC	2	6	366428	366433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536537
8096	NC_004116	CTG	2	6	366451	366456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536537
8097	NC_004116	AAC	2	6	366598	366603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536537
8098	NC_004116	TAT	2	6	366678	366683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_004116	ATAGTT	2	12	366685	366696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_004116	AT	3	6	366727	366732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_004116	ATT	2	6	366822	366827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_004116	A	6	6	366880	366885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_004116	TAT	2	6	366890	366895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_004116	TGA	2	6	366946	366951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_004116	GTTA	2	8	366967	366974	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_004116	GTAT	2	8	367041	367048	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_004116	AT	4	8	367051	367058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_004116	ATT	2	6	367118	367123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536538
8109	NC_004116	CAAT	2	8	367132	367139	50 %	25 %	0 %	25 %	22536538
8110	NC_004116	TAT	2	6	367146	367151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536538
8111	NC_004116	AGGC	2	8	367160	367167	25 %	0 %	50 %	25 %	22536538
8112	NC_004116	AAC	2	6	367250	367255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536538
8113	NC_004116	ATGG	2	8	367258	367265	25 %	25 %	50 %	0 %	22536538
8114	NC_004116	TAT	2	6	367333	367338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536538
8115	NC_004116	GAT	2	6	367360	367365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536538
8116	NC_004116	AG	3	6	367434	367439	50 %	0 %	50 %	0 %	22536538
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8118	NC_004116	A	6	6	367740	367745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_004116	TAA	2	6	367788	367793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536539
8120	NC_004116	AT	3	6	367808	367813	50 %	50 %	0 %	0 %	22536539
8121	NC_004116	GAA	2	6	367818	367823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536539
8122	NC_004116	TGC	2	6	367873	367878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536539
8123	NC_004116	ACG	2	6	367969	367974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536539
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8125	NC_004116	GCT	2	6	368063	368068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536539
8126	NC_004116	GAA	2	6	368127	368132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536539
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8244	NC_004116	CAC	2	6	372905	372910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22536544
8245	NC_004116	GT	3	6	372962	372967	0 %	50 %	50 %	0 %	22536544
8246	NC_004116	AATT	2	8	372996	373003	50 %	50 %	0 %	0 %	22536544
8247	NC_004116	CTC	2	6	373031	373036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22536544
8248	NC_004116	AGC	2	6	373041	373046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536544
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