MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS315 chromosome

Total Repeats: 40352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35235	NC_004070	CCAA	2	8	1662014	1662021	50 %	0 %	0 %	50 %	21911187
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35241	NC_004070	AATC	2	8	1662322	1662329	50 %	25 %	0 %	25 %	21911187
35242	NC_004070	ATAATT	2	12	1662389	1662400	50 %	50 %	0 %	0 %	21911187
35243	NC_004070	TCTGAA	2	12	1662474	1662485	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	21911187
35244	NC_004070	ATC	2	6	1662509	1662514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911187
35245	NC_004070	T	6	6	1662518	1662523	0 %	100 %	0 %	0 %	21911187
35246	NC_004070	AAT	2	6	1662533	1662538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21911187
35247	NC_004070	ATTA	2	8	1662554	1662561	50 %	50 %	0 %	0 %	21911187
35248	NC_004070	TA	3	6	1662592	1662597	50 %	50 %	0 %	0 %	21911187
35249	NC_004070	AAC	2	6	1662608	1662613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21911187
35250	NC_004070	TAA	2	6	1662614	1662619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21911187
35251	NC_004070	CTC	2	6	1662653	1662658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21911187
35252	NC_004070	CTGG	2	8	1662665	1662672	0 %	25 %	50 %	25 %	21911187
35253	NC_004070	CCT	2	6	1662759	1662764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21911187
35254	NC_004070	A	7	7	1662771	1662777	100 %	0 %	0 %	0 %	21911187
35255	NC_004070	ATAA	2	8	1662883	1662890	75 %	25 %	0 %	0 %	21911187
35256	NC_004070	CAAT	2	8	1662904	1662911	50 %	25 %	0 %	25 %	21911187
35257	NC_004070	GAG	2	6	1662934	1662939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21911187
35258	NC_004070	TCC	2	6	1662990	1662995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21911187
35259	NC_004070	GAA	2	6	1662999	1663004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21911187
35260	NC_004070	AATA	2	8	1663025	1663032	75 %	25 %	0 %	0 %	21911187
35261	NC_004070	GAG	2	6	1663077	1663082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21911187
35262	NC_004070	T	6	6	1663136	1663141	0 %	100 %	0 %	0 %	21911187
35263	NC_004070	TCA	2	6	1663306	1663311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911187
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35266	NC_004070	T	7	7	1663389	1663395	0 %	100 %	0 %	0 %	21911187
35267	NC_004070	CTA	2	6	1663495	1663500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911187
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35270	NC_004070	TCT	2	6	1663626	1663631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911187
35271	NC_004070	TTTA	2	8	1663673	1663680	25 %	75 %	0 %	0 %	21911187
35272	NC_004070	T	7	7	1663697	1663703	0 %	100 %	0 %	0 %	21911187
35273	NC_004070	CTTT	2	8	1663856	1663863	0 %	75 %	0 %	25 %	21911187
35274	NC_004070	A	6	6	1663865	1663870	100 %	0 %	0 %	0 %	21911187
35275	NC_004070	TGC	2	6	1663958	1663963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21911187
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35278	NC_004070	GTA	2	6	1664153	1664158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21911187
35279	NC_004070	TCT	2	6	1664283	1664288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911187
35280	NC_004070	ATA	2	6	1664302	1664307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21911187
35281	NC_004070	CTT	2	6	1664335	1664340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911187
35282	NC_004070	A	7	7	1664375	1664381	100 %	0 %	0 %	0 %	21911187
35283	NC_004070	TCT	2	6	1664397	1664402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911187
35284	NC_004070	CTG	2	6	1664408	1664413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21911187
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35286	NC_004070	T	6	6	1664683	1664688	0 %	100 %	0 %	0 %	21911187
35287	NC_004070	ACT	2	6	1664695	1664700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35291	NC_004070	T	6	6	1664829	1664834	0 %	100 %	0 %	0 %	21911188
35292	NC_004070	ACC	2	6	1664835	1664840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21911188
35293	NC_004070	CTT	2	6	1664870	1664875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911188
35294	NC_004070	ATA	2	6	1664971	1664976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35295	NC_004070	T	6	6	1665015	1665020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35296	NC_004070	T	6	6	1665025	1665030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35297	NC_004070	A	6	6	1665090	1665095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35298	NC_004070	TTACT	2	10	1665171	1665180	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35299	NC_004070	TCAGG	2	10	1665188	1665197	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35300	NC_004070	TAAA	2	8	1665237	1665244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35301	NC_004070	TCA	2	6	1665262	1665267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35302	NC_004070	ATA	2	6	1665322	1665327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35303	NC_004070	CAT	2	6	1665348	1665353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35304	NC_004070	GTA	2	6	1665394	1665399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35305	NC_004070	AAG	2	6	1665411	1665416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35310	NC_004070	T	6	6	1665634	1665639	0 %	100 %	0 %	0 %	21911189
35311	NC_004070	CAT	3	9	1665657	1665665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911189
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35317	NC_004070	ATA	2	6	1665937	1665942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21911189
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35320	NC_004070	TAT	2	6	1666104	1666109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21911189
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35333	NC_004070	AGC	2	6	1666783	1666788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21911189
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35336	NC_004070	TTTCA	2	10	1666852	1666861	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35337	NC_004070	ATT	2	6	1666905	1666910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21911190
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35347	NC_004070	CTT	2	6	1667340	1667345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911190
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35351	NC_004070	AATG	2	8	1667425	1667432	50 %	25 %	25 %	0 %	21911190
35352	NC_004070	GT	3	6	1667520	1667525	0 %	50 %	50 %	0 %	21911190
35353	NC_004070	AGA	2	6	1667583	1667588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21911190
35354	NC_004070	CAAA	2	8	1667613	1667620	75 %	0 %	0 %	25 %	21911190
35355	NC_004070	AAC	2	6	1667650	1667655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21911190
35356	NC_004070	TTG	2	6	1667675	1667680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21911190
35357	NC_004070	CATGAA	2	12	1667701	1667712	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	21911190
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35359	NC_004070	ACC	2	6	1667737	1667742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21911190
35360	NC_004070	GTAA	2	8	1667836	1667843	50 %	25 %	25 %	0 %	21911190
35361	NC_004070	CAA	2	6	1667862	1667867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21911190
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