MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS315 chromosome

Total Repeats: 40352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_004070	TTC	2	6	1220561	1220566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21910729
26003	NC_004070	CCATA	2	10	1220569	1220578	40 %	20 %	0 %	40 %	21910729
26004	NC_004070	CAAA	2	8	1220596	1220603	75 %	0 %	0 %	25 %	21910729
26005	NC_004070	T	6	6	1220626	1220631	0 %	100 %	0 %	0 %	21910729
26006	NC_004070	TTG	2	6	1220688	1220693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21910729
26007	NC_004070	AAAG	2	8	1220726	1220733	75 %	0 %	25 %	0 %	21910729
26008	NC_004070	A	6	6	1220801	1220806	100 %	0 %	0 %	0 %	21910729
26009	NC_004070	ACC	2	6	1220852	1220857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21910729
26010	NC_004070	ATG	2	6	1220910	1220915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21910729
26011	NC_004070	AAG	3	9	1220941	1220949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21910729
26012	NC_004070	T	8	8	1220966	1220973	0 %	100 %	0 %	0 %	21910729
26013	NC_004070	AGT	2	6	1221084	1221089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26014	NC_004070	TTAAA	2	10	1221097	1221106	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26015	NC_004070	TTA	2	6	1221150	1221155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21910730
26016	NC_004070	TGC	2	6	1221186	1221191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21910730
26017	NC_004070	TGC	2	6	1221251	1221256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21910730
26018	NC_004070	TCA	2	6	1221265	1221270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21910730
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26023	NC_004070	CTTT	2	8	1221544	1221551	0 %	75 %	0 %	25 %	21910730
26024	NC_004070	TCT	3	9	1221580	1221588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21910730
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26029	NC_004070	AGCA	2	8	1221744	1221751	50 %	0 %	25 %	25 %	21910730
26030	NC_004070	TGGGT	2	10	1221754	1221763	0 %	40 %	60 %	0 %	21910730
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26040	NC_004070	ATTA	2	8	1222205	1222212	50 %	50 %	0 %	0 %	21910731
26041	NC_004070	T	6	6	1222213	1222218	0 %	100 %	0 %	0 %	21910731
26042	NC_004070	GAGATA	2	12	1222221	1222232	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	21910731
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26048	NC_004070	ACC	2	6	1222714	1222719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26049	NC_004070	TTA	2	6	1222731	1222736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21910732
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26052	NC_004070	CTG	2	6	1222934	1222939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21910732
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26065	NC_004070	CAAT	2	8	1223606	1223613	50 %	25 %	0 %	25 %	21910732
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26079	NC_004070	A	6	6	1224261	1224266	100 %	0 %	0 %	0 %	21910733
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26091	NC_004070	A	8	8	1224794	1224801	100 %	0 %	0 %	0 %	21910733
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26104	NC_004070	AC	3	6	1225509	1225514	50 %	0 %	0 %	50 %	21910734
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26109	NC_004070	CTA	2	6	1225699	1225704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26123	NC_004070	GTT	2	6	1226440	1226445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21910736
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26126	NC_004070	TA	3	6	1226689	1226694	50 %	50 %	0 %	0 %	21910736
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26229	NC_004070	GAAA	2	8	1231706	1231713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26230	NC_004070	A	7	7	1231716	1231722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26231	NC_004070	A	6	6	1231732	1231737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26235	NC_004070	GTAA	2	8	1231970	1231977	50 %	25 %	25 %	0 %	21910741
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26238	NC_004070	ATTTT	2	10	1232059	1232068	20 %	80 %	0 %	0 %	21910741
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26243	NC_004070	AATTG	2	10	1232254	1232263	40 %	40 %	20 %	0 %	21910741
26244	NC_004070	ACA	2	6	1232274	1232279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21910741
26245	NC_004070	GTA	2	6	1232397	1232402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21910741
26246	NC_004070	AT	3	6	1232452	1232457	50 %	50 %	0 %	0 %	21910741
26247	NC_004070	T	7	7	1232460	1232466	0 %	100 %	0 %	0 %	21910741
26248	NC_004070	AAT	2	6	1232468	1232473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21910741
26249	NC_004070	TAT	2	6	1232479	1232484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21910741
26250	NC_004070	AT	3	6	1232483	1232488	50 %	50 %	0 %	0 %	21910741
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26252	NC_004070	AT	3	6	1232540	1232545	50 %	50 %	0 %	0 %	21910741
26253	NC_004070	CAT	2	6	1232563	1232568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21910741
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26259	NC_004070	T	6	6	1232677	1232682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26260	NC_004070	ATA	2	6	1232722	1232727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26262	NC_004070	A	8	8	1232754	1232761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26263	NC_004070	TAATA	2	10	1232782	1232791	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26264	NC_004070	ATT	2	6	1232808	1232813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26267	NC_004070	T	7	7	1232885	1232891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26268	NC_004070	AGA	2	6	1232897	1232902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26271	NC_004070	TCAA	2	8	1232942	1232949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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26273	NC_004070	T	6	6	1232962	1232967	0 %	100 %	0 %	0 %	21910742
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26359	NC_004070	T	6	6	1236909	1236914	0 %	100 %	0 %	0 %	21910748
26360	NC_004070	TTC	2	6	1236918	1236923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21910748
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26485	NC_004070	GCA	2	6	1244861	1244866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21910753
26486	NC_004070	CTTT	2	8	1244870	1244877	0 %	75 %	0 %	25 %	21910753
26487	NC_004070	CTT	2	6	1244893	1244898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21910753
26488	NC_004070	TTA	2	6	1244939	1244944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21910753
26489	NC_004070	CTT	2	6	1244958	1244963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21910753
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