MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces coelicolor A3(2) chromosome

Total Repeats: 254641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003888	GCGA	2	8	35	42	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_003888	TCCG	2	8	145	152	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_003888	TCGCT	2	10	198	207	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_003888	GCG	2	6	221	226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_003888	CTGG	2	8	297	304	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_003888	TCGT	2	8	325	332	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_003888	TAGTG	2	10	342	351	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003888	AGAT	2	8	360	367	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003888	GCA	2	6	368	373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_003888	CAC	2	6	455	460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21218583
11	NC_003888	AGC	2	6	488	493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218583
12	NC_003888	CGG	2	6	525	530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21218583
13	NC_003888	CGAG	2	8	584	591	25 %	0 %	50 %	25 %	21218583
14	NC_003888	GAC	2	6	595	600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218583
15	NC_003888	TGG	2	6	602	607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21218583
16	NC_003888	GGT	2	6	624	629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21218583
17	NC_003888	G	6	6	719	724	0 %	0 %	100 %	0 %	21218583
18	NC_003888	CGGCG	2	10	747	756	0 %	0 %	60 %	40 %	21218583
19	NC_003888	CGGG	2	8	762	769	0 %	0 %	75 %	25 %	21218583
20	NC_003888	TGC	2	6	858	863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21218583
21	NC_003888	CG	3	6	864	869	0 %	0 %	50 %	50 %	21218583
22	NC_003888	CAC	2	6	880	885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21218583
23	NC_003888	GGCGC	2	10	886	895	0 %	0 %	60 %	40 %	21218583
24	NC_003888	CGA	2	6	955	960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218583
25	NC_003888	GAC	2	6	1004	1009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218583
26	NC_003888	CAC	2	6	1287	1292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21218584
27	NC_003888	TGCG	2	8	1296	1303	0 %	25 %	50 %	25 %	21218584
28	NC_003888	GGC	2	6	1382	1387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21218584
29	NC_003888	AGC	2	6	1448	1453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218584
30	NC_003888	CAC	3	9	1464	1472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21218584
31	NC_003888	CCGGT	2	10	1505	1514	0 %	20 %	40 %	40 %	21218584
32	NC_003888	CCTC	2	8	1535	1542	0 %	25 %	0 %	75 %	21218584
33	NC_003888	CCG	2	6	1559	1564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21218584
34	NC_003888	GGCG	2	8	1611	1618	0 %	0 %	75 %	25 %	21218584
35	NC_003888	GGC	2	6	1700	1705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21218584
36	NC_003888	GCG	2	6	1711	1716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21218584
37	NC_003888	ACA	2	6	1724	1729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21218584
38	NC_003888	CGC	2	6	1782	1787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21218584
39	NC_003888	GCGG	2	8	1802	1809	0 %	0 %	75 %	25 %	21218584
40	NC_003888	CGGG	2	8	1812	1819	0 %	0 %	75 %	25 %	21218584
41	NC_003888	GGA	2	6	1839	1844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21218584
42	NC_003888	CGACCC	2	12	1947	1958	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	21218584
43	NC_003888	CGGC	2	8	1989	1996	0 %	0 %	50 %	50 %	21218584
44	NC_003888	CTG	2	6	2020	2025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21218584
45	NC_003888	GCA	2	6	2037	2042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218584
46	NC_003888	CAC	2	6	2052	2057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21218584
47	NC_003888	CCA	2	6	2067	2072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21218584
48	NC_003888	GAA	2	6	2080	2085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21218584
49	NC_003888	GCC	2	6	2119	2124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21218584
50	NC_003888	CGG	2	6	2150	2155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21218584
51	NC_003888	GGC	2	6	2166	2171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21218584
52	NC_003888	CGT	2	6	2183	2188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21218584
53	NC_003888	GGA	2	6	2214	2219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21218584
54	NC_003888	CCATC	2	10	2271	2280	20 %	20 %	0 %	60 %	21218584
55	NC_003888	CGG	2	6	2335	2340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21218584
56	NC_003888	TCC	2	6	2359	2364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21218584
57	NC_003888	TCG	2	6	2426	2431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21218584
58	NC_003888	CGT	2	6	2454	2459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21218584
59	NC_003888	CG	3	6	2511	2516	0 %	0 %	50 %	50 %	21218584
60	NC_003888	ATC	3	9	2518	2526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21218584
61	NC_003888	TCC	2	6	2534	2539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21218584
62	NC_003888	GGA	2	6	2547	2552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21218584
63	NC_003888	TCC	2	6	2600	2605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21218584
64	NC_003888	CGG	2	6	2677	2682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21218584
65	NC_003888	CGTC	2	8	2691	2698	0 %	25 %	25 %	50 %	21218584
66	NC_003888	CGGC	2	8	2708	2715	0 %	0 %	50 %	50 %	21218584
67	NC_003888	GAG	2	6	2737	2742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21218584
68	NC_003888	CCAG	2	8	2744	2751	25 %	0 %	25 %	50 %	21218584
69	NC_003888	GCA	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218584
70	NC_003888	C	6	6	2801	2806	0 %	0 %	0 %	100 %	21218584
71	NC_003888	CGC	2	6	2811	2816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21218584
72	NC_003888	CGC	2	6	2823	2828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21218584
73	NC_003888	ACG	2	6	2965	2970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218584
74	NC_003888	CCA	2	6	2997	3002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21218584
75	NC_003888	CGC	2	6	3007	3012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21218584
76	NC_003888	GC	3	6	3011	3016	0 %	0 %	50 %	50 %	21218584
77	NC_003888	CTC	2	6	3052	3057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21218584
78	NC_003888	GAC	2	6	3058	3063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218584
79	NC_003888	CGA	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218584
80	NC_003888	CGC	2	6	3111	3116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21218584
81	NC_003888	GC	4	8	3132	3139	0 %	0 %	50 %	50 %	21218584
82	NC_003888	GCGAGG	2	12	3176	3187	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	21218584
83	NC_003888	GCA	2	6	3204	3209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218584
84	NC_003888	GAA	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21218584
85	NC_003888	GC	3	6	3276	3281	0 %	0 %	50 %	50 %	21218584
86	NC_003888	GGC	2	6	3291	3296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21218584
87	NC_003888	TCG	2	6	3365	3370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21218584
88	NC_003888	CGA	2	6	3420	3425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218584
89	NC_003888	CCG	2	6	3479	3484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21218584
90	NC_003888	AAC	2	6	3485	3490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21218584
91	NC_003888	CGG	2	6	3545	3550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21218584
92	NC_003888	GGC	2	6	3606	3611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21218584
93	NC_003888	CG	3	6	3656	3661	0 %	0 %	50 %	50 %	21218584
94	NC_003888	GAG	2	6	3670	3675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21218584
95	NC_003888	ATC	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21218584
96	NC_003888	CG	3	6	3739	3744	0 %	0 %	50 %	50 %	21218584
97	NC_003888	AGC	2	6	3767	3772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218584
98	NC_003888	GCG	2	6	3805	3810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21218584
99	NC_003888	GTC	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21218585
100	NC_003888	ACG	2	6	3935	3940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218585
101	NC_003888	CGCT	2	8	3964	3971	0 %	25 %	25 %	50 %	21218585
102	NC_003888	TTG	2	6	3992	3997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21218585
103	NC_003888	GCGT	2	8	4017	4024	0 %	25 %	50 %	25 %	21218585
104	NC_003888	TCG	2	6	4047	4052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21218585
105	NC_003888	CCTC	2	8	4092	4099	0 %	25 %	0 %	75 %	21218585
106	NC_003888	CG	3	6	4127	4132	0 %	0 %	50 %	50 %	21218585
107	NC_003888	AGC	2	6	4176	4181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218585
108	NC_003888	CGG	2	6	4245	4250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21218585
109	NC_003888	GCT	2	6	4429	4434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21218585
110	NC_003888	CCT	2	6	4488	4493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21218585
111	NC_003888	GTG	2	6	4595	4600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21218585
112	NC_003888	ACG	2	6	4625	4630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218585
113	NC_003888	TG	3	6	4635	4640	0 %	50 %	50 %	0 %	21218585
114	NC_003888	GGA	2	6	4666	4671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21218585
115	NC_003888	CACG	2	8	4672	4679	25 %	0 %	25 %	50 %	21218585
116	NC_003888	CTG	2	6	4715	4720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21218585
117	NC_003888	GCC	2	6	4743	4748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21218585
118	NC_003888	TGG	2	6	4755	4760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21218585
119	NC_003888	AGC	2	6	4761	4766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218585
120	NC_003888	GCC	2	6	4769	4774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21218585
121	NC_003888	GT	3	6	4810	4815	0 %	50 %	50 %	0 %	21218585
122	NC_003888	GCG	2	6	4816	4821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21218585
123	NC_003888	TG	3	6	4849	4854	0 %	50 %	50 %	0 %	21218585
124	NC_003888	GCG	2	6	4889	4894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21218585
125	NC_003888	GGA	2	6	4940	4945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21218585
126	NC_003888	AGC	2	6	5095	5100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218585
127	NC_003888	GCATC	2	10	5128	5137	20 %	20 %	20 %	40 %	21218585
128	NC_003888	TGG	2	6	5144	5149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21218585
129	NC_003888	GACG	2	8	5175	5182	25 %	0 %	50 %	25 %	21218585
130	NC_003888	TCG	2	6	5220	5225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21218585
131	NC_003888	ACG	2	6	5295	5300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218585
132	NC_003888	CGC	2	6	5375	5380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21218585
133	NC_003888	CCTGGC	2	12	5386	5397	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	21218585
134	NC_003888	CGGC	2	8	5403	5410	0 %	0 %	50 %	50 %	21218585
135	NC_003888	GCC	2	6	5432	5437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21218585
136	NC_003888	TGA	2	6	5502	5507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21218585
137	NC_003888	ACCG	2	8	5543	5550	25 %	0 %	25 %	50 %	21218585
138	NC_003888	GTG	2	6	5578	5583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21218585
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244	NC_003888	GCCG	2	8	9333	9340	0 %	0 %	50 %	50 %	21226090
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256	NC_003888	CAC	3	9	10029	10037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21226090
257	NC_003888	GCCG	2	8	10072	10079	0 %	0 %	50 %	50 %	21226090
258	NC_003888	CCTC	2	8	10082	10089	0 %	25 %	0 %	75 %	21226090
259	NC_003888	GCC	2	6	10099	10104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21226090
260	NC_003888	TCA	2	6	10145	10150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226090
261	NC_003888	GC	3	6	10163	10168	0 %	0 %	50 %	50 %	21226090
262	NC_003888	CCA	2	6	10179	10184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21226090
263	NC_003888	CCG	2	6	10232	10237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21226090
264	NC_003888	CGCC	2	8	10254	10261	0 %	0 %	25 %	75 %	21226090
265	NC_003888	ACC	2	6	10318	10323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21226090
266	NC_003888	ACC	2	6	10343	10348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21226090
267	NC_003888	GCC	2	6	10446	10451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
268	NC_003888	GC	3	6	10460	10465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
269	NC_003888	CAC	2	6	10472	10477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
270	NC_003888	CCACGG	2	12	10628	10639	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	21218589
271	NC_003888	CAG	2	6	10648	10653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218589
272	NC_003888	GCC	2	6	10692	10697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21218589
273	NC_003888	CG	3	6	10726	10731	0 %	0 %	50 %	50 %	21218589
274	NC_003888	GCC	2	6	10776	10781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21218589
275	NC_003888	CAG	2	6	10809	10814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218589
276	NC_003888	ACG	2	6	10855	10860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218589
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278	NC_003888	CGC	2	6	10982	10987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21218589
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281	NC_003888	GC	4	8	11046	11053	0 %	0 %	50 %	50 %	21218590
282	NC_003888	CAC	2	6	11057	11062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21218590
283	NC_003888	ACC	2	6	11074	11079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21218590
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285	NC_003888	ACC	2	6	11145	11150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21218590
286	NC_003888	CGC	2	6	11228	11233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21218590
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289	NC_003888	CA	3	6	11349	11354	50 %	0 %	0 %	50 %	21218590
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292	NC_003888	CCA	2	6	11418	11423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_003888	CA	3	6	11451	11456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
294	NC_003888	AAC	2	6	11484	11489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_003888	CGC	2	6	11501	11506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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301	NC_003888	GCA	2	6	11718	11723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218591
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385	NC_003888	GTC	2	6	14958	14963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21218595
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387	NC_003888	CG	3	6	15109	15114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
388	NC_003888	CAC	2	6	15121	15126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
389	NC_003888	CCGG	2	8	15179	15186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
390	NC_003888	GGC	2	6	15218	15223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
391	NC_003888	GTC	2	6	15227	15232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
392	NC_003888	CGTCA	2	10	15233	15242	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
393	NC_003888	TGG	2	6	15296	15301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
394	NC_003888	AGC	2	6	15311	15316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
395	NC_003888	GGT	2	6	15331	15336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21218596
396	NC_003888	CCTC	2	8	15367	15374	0 %	25 %	0 %	75 %	21218596
397	NC_003888	GGCC	2	8	15439	15446	0 %	0 %	50 %	50 %	21218596
398	NC_003888	GGA	2	6	15502	15507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21218596
399	NC_003888	CTC	2	6	15521	15526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21218596
400	NC_003888	CCAC	2	8	15529	15536	25 %	0 %	0 %	75 %	21218596
401	NC_003888	CGC	2	6	15553	15558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21218596
402	NC_003888	G	6	6	15565	15570	0 %	0 %	100 %	0 %	21218596
403	NC_003888	CGA	2	6	15577	15582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21218596
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