MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18 plasmid pHCM2

Total Repeats: 1990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_003385	TGG	2	6	80949	80954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466768
1502	NC_003385	TC	3	6	80973	80978	0 %	50 %	0 %	50 %	18466768
1503	NC_003385	TC	3	6	81086	81091	0 %	50 %	0 %	50 %	18466768
1504	NC_003385	CTG	2	6	81094	81099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466768
1505	NC_003385	TCA	2	6	81143	81148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466768
1506	NC_003385	TAAAT	2	10	81226	81235	60 %	40 %	0 %	0 %	18466768
1507	NC_003385	TAT	2	6	81345	81350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466769
1508	NC_003385	CCA	2	6	81487	81492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466769
1509	NC_003385	CGCC	2	8	81495	81502	0 %	0 %	25 %	75 %	18466769
1510	NC_003385	CT	3	6	81536	81541	0 %	50 %	0 %	50 %	18466769
1511	NC_003385	AG	3	6	81552	81557	50 %	0 %	50 %	0 %	18466769
1512	NC_003385	GCA	2	6	81626	81631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466769
1513	NC_003385	AG	3	6	81673	81678	50 %	0 %	50 %	0 %	18466769
1514	NC_003385	CAG	2	6	81728	81733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466769
1515	NC_003385	CAG	2	6	81758	81763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466769
1516	NC_003385	GGGTA	2	10	81820	81829	20 %	20 %	60 %	0 %	18466769
1517	NC_003385	CGC	2	6	81931	81936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466769
1518	NC_003385	CTTTGT	2	12	82012	82023	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	18466769
1519	NC_003385	TCT	2	6	82069	82074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466769
1520	NC_003385	TGC	2	6	82136	82141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466769
1521	NC_003385	TGA	2	6	82327	82332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466769
1522	NC_003385	GAA	2	6	82346	82351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466769
1523	NC_003385	GTC	2	6	82370	82375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466769
1524	NC_003385	ACGCTG	2	12	82401	82412	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	18466769
1525	NC_003385	GAT	2	6	82442	82447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466769
1526	NC_003385	CGCT	2	8	82452	82459	0 %	25 %	25 %	50 %	18466769
1527	NC_003385	AG	3	6	82526	82531	50 %	0 %	50 %	0 %	18466769
1528	NC_003385	CAG	2	6	82550	82555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466769
1529	NC_003385	TCG	2	6	82689	82694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466769
1530	NC_003385	CGG	2	6	82695	82700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466769
1531	NC_003385	CAG	2	6	82715	82720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466769
1532	NC_003385	CTT	2	6	82742	82747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466769
1533	NC_003385	CCAG	2	8	82798	82805	25 %	0 %	25 %	50 %	18466769
1534	NC_003385	CCGG	2	8	82834	82841	0 %	0 %	50 %	50 %	18466769
1535	NC_003385	GCA	2	6	82852	82857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466769
1536	NC_003385	TGT	2	6	82870	82875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466769
1537	NC_003385	TCG	2	6	82881	82886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466769
1538	NC_003385	ATG	2	6	83010	83015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466769
1539	NC_003385	TTG	2	6	83060	83065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_003385	AGC	2	6	83098	83103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_003385	A	6	6	83135	83140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_003385	GTG	2	6	83177	83182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466770
1543	NC_003385	TGC	2	6	83187	83192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466770
1544	NC_003385	TGTT	2	8	83205	83212	0 %	75 %	25 %	0 %	18466770
1545	NC_003385	CAT	2	6	83240	83245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466770
1546	NC_003385	GTC	2	6	83267	83272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466770
1547	NC_003385	CAG	2	6	83294	83299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466770
1548	NC_003385	TCG	2	6	83319	83324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466770
1549	NC_003385	GGC	2	6	83375	83380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466770
1550	NC_003385	AGA	2	6	83396	83401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466770
1551	NC_003385	GCTT	2	8	83476	83483	0 %	50 %	25 %	25 %	18466770
1552	NC_003385	TTCT	2	8	83519	83526	0 %	75 %	0 %	25 %	18466770
1553	NC_003385	ATC	2	6	83579	83584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466770
1554	NC_003385	CGT	2	6	83635	83640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466770
1555	NC_003385	ACCA	2	8	83648	83655	50 %	0 %	0 %	50 %	18466770
1556	NC_003385	T	6	6	83693	83698	0 %	100 %	0 %	0 %	18466770
1557	NC_003385	T	7	7	83725	83731	0 %	100 %	0 %	0 %	18466770
1558	NC_003385	T	6	6	83750	83755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_003385	GTT	2	6	83774	83779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_003385	GCA	2	6	83943	83948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466771
1561	NC_003385	GCA	2	6	83961	83966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466771
1562	NC_003385	GTG	2	6	84075	84080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466771
1563	NC_003385	TTCA	2	8	84164	84171	25 %	50 %	0 %	25 %	18466771
1564	NC_003385	TCA	2	6	84183	84188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466771
1565	NC_003385	TTC	2	6	84266	84271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466771
1566	NC_003385	CAG	2	6	84385	84390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466771
1567	NC_003385	ACA	2	6	84483	84488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466771
1568	NC_003385	CAA	2	6	84496	84501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466771
1569	NC_003385	GTAA	2	8	84504	84511	50 %	25 %	25 %	0 %	18466771
1570	NC_003385	TCG	2	6	84549	84554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466771
1571	NC_003385	GAA	2	6	84589	84594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466771
1572	NC_003385	AGT	2	6	84680	84685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466771
1573	NC_003385	ACAT	2	8	84694	84701	50 %	25 %	0 %	25 %	18466771
1574	NC_003385	TTG	2	6	84737	84742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_003385	TGC	2	6	84823	84828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466772
1576	NC_003385	AAC	2	6	84836	84841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466772
1577	NC_003385	CCA	2	6	84930	84935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466772
1578	NC_003385	CAA	2	6	84955	84960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466772
1579	NC_003385	CAG	2	6	85011	85016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_003385	CAG	2	6	85057	85062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_003385	CATCC	2	10	85063	85072	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1582	NC_003385	AG	3	6	85073	85078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_003385	AGG	2	6	85081	85086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_003385	GTC	2	6	85103	85108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_003385	TGG	2	6	85119	85124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_003385	AGT	2	6	85126	85131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_003385	TG	3	6	85255	85260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_003385	AC	3	6	85276	85281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_003385	TCT	2	6	85303	85308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_003385	TTC	2	6	85385	85390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_003385	AAG	2	6	85471	85476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_003385	AGCC	2	8	85539	85546	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_003385	ACTT	2	8	85639	85646	25 %	50 %	0 %	25 %	18466774
1594	NC_003385	GGC	2	6	85704	85709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466774
1595	NC_003385	CA	3	6	85727	85732	50 %	0 %	0 %	50 %	18466774
1596	NC_003385	GGC	2	6	85794	85799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466774
1597	NC_003385	CTT	2	6	85839	85844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466774
1598	NC_003385	ATCC	2	8	85855	85862	25 %	25 %	0 %	50 %	18466774
1599	NC_003385	CAT	2	6	85977	85982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466774
1600	NC_003385	TTG	2	6	85993	85998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466774
1601	NC_003385	GCCCG	2	10	86067	86076	0 %	0 %	40 %	60 %	18466774
1602	NC_003385	TGG	2	6	86176	86181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466774
1603	NC_003385	GTC	2	6	86242	86247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466774
1604	NC_003385	CG	3	6	86264	86269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_003385	CGA	2	6	86273	86278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_003385	T	8	8	86279	86286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_003385	CGTG	2	8	86297	86304	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_003385	T	6	6	86318	86323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_003385	AGAAA	2	10	86324	86333	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_003385	ACTT	2	8	86335	86342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_003385	TAA	2	6	86357	86362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_003385	CTGAA	2	10	86366	86375	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1613	NC_003385	CGAA	2	8	86376	86383	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_003385	GTGA	2	8	86384	86391	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_003385	CGAA	2	8	86401	86408	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_003385	TC	3	6	86643	86648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_003385	CCCA	2	8	86742	86749	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1618	NC_003385	AATC	2	8	86767	86774	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_003385	ATT	2	6	86834	86839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466776
1620	NC_003385	GATT	2	8	86842	86849	25 %	50 %	25 %	0 %	18466776
1621	NC_003385	TGA	2	6	86894	86899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466776
1622	NC_003385	GCT	2	6	86912	86917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466776
1623	NC_003385	CCA	2	6	86918	86923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466776
1624	NC_003385	TGAA	2	8	86940	86947	50 %	25 %	25 %	0 %	18466776
1625	NC_003385	TCA	2	6	86996	87001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466776
1626	NC_003385	ACG	2	6	87043	87048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466776
1627	NC_003385	TCG	2	6	87050	87055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466776
1628	NC_003385	GTT	2	6	87157	87162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_003385	TA	4	8	87194	87201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_003385	AAT	2	6	87202	87207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1632	NC_003385	AT	3	6	87224	87229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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