MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18 plasmid pHCM1

Total Repeats: 4181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_003384	CTTT	2	8	184027	184034	0 %	75 %	0 %	25 %	18466627
3502	NC_003384	CAA	2	6	184150	184155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466627
3503	NC_003384	ATGTT	2	10	184266	184275	20 %	60 %	20 %	0 %	18466627
3504	NC_003384	TTGG	2	8	184287	184294	0 %	50 %	50 %	0 %	18466627
3505	NC_003384	AG	3	6	184407	184412	50 %	0 %	50 %	0 %	18466627
3506	NC_003384	TGT	2	6	184441	184446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_003384	ATT	2	6	184450	184455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_003384	CTTAA	2	10	184502	184511	40 %	40 %	0 %	20 %	18466628
3509	NC_003384	TCA	2	6	184539	184544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466628
3510	NC_003384	TCT	2	6	184614	184619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466628
3511	NC_003384	GTT	2	6	184645	184650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466628
3512	NC_003384	GAA	2	6	184654	184659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466628
3513	NC_003384	CTTT	2	8	184681	184688	0 %	75 %	0 %	25 %	18466628
3514	NC_003384	ACC	2	6	184712	184717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466628
3515	NC_003384	CGT	2	6	184747	184752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466628
3516	NC_003384	ATT	2	6	184824	184829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466628
3517	NC_003384	ATC	2	6	184875	184880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_003384	TGT	2	6	184939	184944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_003384	CAT	2	6	184949	184954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_003384	TGA	2	6	185152	185157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466629
3521	NC_003384	CAG	2	6	185249	185254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466629
3522	NC_003384	TCG	2	6	185262	185267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466629
3523	NC_003384	CAG	2	6	185276	185281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466629
3524	NC_003384	CTT	2	6	185310	185315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466629
3525	NC_003384	CCA	2	6	185353	185358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466629
3526	NC_003384	GGC	2	6	185450	185455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466629
3527	NC_003384	TCG	2	6	185601	185606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466629
3528	NC_003384	TGT	2	6	185631	185636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_003384	TGAA	2	8	185645	185652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_003384	CTC	2	6	185829	185834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18466630
3531	NC_003384	T	6	6	185848	185853	0 %	100 %	0 %	0 %	18466630
3532	NC_003384	TGA	2	6	185877	185882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466630
3533	NC_003384	CTTT	2	8	185952	185959	0 %	75 %	0 %	25 %	18466630
3534	NC_003384	ACG	2	6	186000	186005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466630
3535	NC_003384	ACTG	2	8	186031	186038	25 %	25 %	25 %	25 %	18466630
3536	NC_003384	TCG	2	6	186054	186059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466630
3537	NC_003384	TCA	2	6	186295	186300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466631
3538	NC_003384	CAA	2	6	186308	186313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466631
3539	NC_003384	CCA	2	6	186319	186324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466631
3540	NC_003384	AGC	2	6	186403	186408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466631
3541	NC_003384	ATT	2	6	186451	186456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466631
3542	NC_003384	TAG	2	6	186553	186558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466631
3543	NC_003384	GCT	2	6	186593	186598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466631
3544	NC_003384	GCA	2	6	186684	186689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466631
3545	NC_003384	TGG	2	6	186692	186697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466631
3546	NC_003384	GTC	2	6	186702	186707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466631
3547	NC_003384	A	6	6	186729	186734	100 %	0 %	0 %	0 %	18466631
3548	NC_003384	CTG	2	6	186735	186740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466631
3549	NC_003384	TCA	2	6	186745	186750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466631
3550	NC_003384	ATC	2	6	186810	186815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466631
3551	NC_003384	CCT	2	6	186933	186938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18466631
3552	NC_003384	ACA	2	6	186944	186949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466631
3553	NC_003384	AGC	2	6	187092	187097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466631
3554	NC_003384	CAG	2	6	187124	187129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466631
3555	NC_003384	GGCG	2	8	187235	187242	0 %	0 %	75 %	25 %	18466631
3556	NC_003384	AGC	2	6	187273	187278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466631
3557	NC_003384	TGA	2	6	187324	187329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466631
3558	NC_003384	CT	3	6	187364	187369	0 %	50 %	0 %	50 %	18466631
3559	NC_003384	TCA	2	6	187391	187396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466631
3560	NC_003384	GTC	2	6	187461	187466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466631
3561	NC_003384	GGAA	2	8	187511	187518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_003384	ATGA	2	8	187588	187595	50 %	25 %	25 %	0 %	18466632
3563	NC_003384	CGT	2	6	187596	187601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466632
3564	NC_003384	ATA	2	6	187627	187632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466632
3565	NC_003384	ACGC	2	8	187781	187788	25 %	0 %	25 %	50 %	18466632
3566	NC_003384	GTT	2	6	187791	187796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466632
3567	NC_003384	GAA	2	6	187797	187802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466632
3568	NC_003384	TCA	2	6	187817	187822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466632
3569	NC_003384	TTG	2	6	187825	187830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466632
3570	NC_003384	CGC	2	6	187884	187889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466632
3571	NC_003384	AGA	2	6	187940	187945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466632
3572	NC_003384	CAA	2	6	187979	187984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466632
3573	NC_003384	TTTTCT	2	12	188134	188145	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	18466632
3574	NC_003384	T	6	6	188179	188184	0 %	100 %	0 %	0 %	18466632
3575	NC_003384	AGC	2	6	188196	188201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466632
3576	NC_003384	TCG	2	6	188215	188220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466632
3577	NC_003384	AGCC	2	8	188267	188274	25 %	0 %	25 %	50 %	18466632
3578	NC_003384	TAATT	2	10	188320	188329	40 %	60 %	0 %	0 %	18466632
3579	NC_003384	GTTA	2	8	188361	188368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_003384	ATT	2	6	188407	188412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_003384	GGA	2	6	188431	188436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_003384	GCA	2	6	188549	188554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466633
3583	NC_003384	TTG	2	6	188567	188572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466633
3584	NC_003384	AT	3	6	188667	188672	50 %	50 %	0 %	0 %	18466633
3585	NC_003384	GAA	2	6	188757	188762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466633
3586	NC_003384	AAC	2	6	188763	188768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466633
3587	NC_003384	GACTAT	2	12	188800	188811	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	18466633
3588	NC_003384	CGT	2	6	188866	188871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466633
3589	NC_003384	A	6	6	188898	188903	100 %	0 %	0 %	0 %	18466633
3590	NC_003384	CAG	2	6	188908	188913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466633
3591	NC_003384	TGA	2	6	189052	189057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466633
3592	NC_003384	ACCA	2	8	189072	189079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3593	NC_003384	CCT	2	6	189120	189125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18466634
3594	NC_003384	CAC	2	6	189305	189310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466634
3595	NC_003384	CAG	2	6	189329	189334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466634
3596	NC_003384	AC	3	6	189376	189381	50 %	0 %	0 %	50 %	18466634
3597	NC_003384	AG	3	6	189400	189405	50 %	0 %	50 %	0 %	18466634
3598	NC_003384	CCA	2	6	189412	189417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466634
3599	NC_003384	TAA	2	6	189450	189455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466634
3600	NC_003384	GGA	2	6	189457	189462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466634
3601	NC_003384	TCT	2	6	189535	189540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466634
3602	NC_003384	CAA	2	6	189581	189586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466635
3603	NC_003384	CAT	2	6	189779	189784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466635
3604	NC_003384	T	7	7	189789	189795	0 %	100 %	0 %	0 %	18466635
3605	NC_003384	TCTG	2	8	189811	189818	0 %	50 %	25 %	25 %	18466635
3606	NC_003384	AGC	2	6	189819	189824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466635
3607	NC_003384	CTG	2	6	189841	189846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466635
3608	NC_003384	GCA	2	6	189886	189891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466635
3609	NC_003384	AACC	2	8	189905	189912	50 %	0 %	0 %	50 %	18466635
3610	NC_003384	CCA	2	6	189914	189919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466635
3611	NC_003384	AGGC	2	8	190127	190134	25 %	0 %	50 %	25 %	18466636
3612	NC_003384	CAT	2	6	190191	190196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466636
3613	NC_003384	TTGA	2	8	190277	190284	25 %	50 %	25 %	0 %	18466636
3614	NC_003384	CT	3	6	190537	190542	0 %	50 %	0 %	50 %	18466636
3615	NC_003384	TTC	2	6	190616	190621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466636
3616	NC_003384	GCA	2	6	190625	190630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466636
3617	NC_003384	ATG	2	6	190701	190706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466636
3618	NC_003384	A	6	6	190763	190768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_003384	C	6	6	190798	190803	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3620	NC_003384	A	8	8	190810	190817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_003384	GAC	2	6	190822	190827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_003384	ACC	2	6	190881	190886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466637
3623	NC_003384	T	6	6	190956	190961	0 %	100 %	0 %	0 %	18466637
3624	NC_003384	TAA	2	6	191031	191036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466637
3625	NC_003384	TGGG	2	8	191155	191162	0 %	25 %	75 %	0 %	18466637
3626	NC_003384	TGG	2	6	191167	191172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466637
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