MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_003198	CAT	2	6	1224999	1225004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760103
26003	NC_003198	GAA	2	6	1225152	1225157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16760103
26004	NC_003198	GCT	2	6	1225205	1225210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760103
26005	NC_003198	AAT	2	6	1225218	1225223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760103
26006	NC_003198	GGCGC	2	10	1225358	1225367	0 %	0 %	60 %	40 %	16760103
26007	NC_003198	GGC	2	6	1225449	1225454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760103
26008	NC_003198	CGG	2	6	1225482	1225487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26009	NC_003198	GCC	2	6	1225546	1225551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760104
26010	NC_003198	AGGA	2	8	1225561	1225568	50 %	0 %	50 %	0 %	16760104
26011	NC_003198	T	6	6	1225658	1225663	0 %	100 %	0 %	0 %	16760104
26012	NC_003198	CCG	2	6	1225708	1225713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760104
26013	NC_003198	CGG	2	6	1225770	1225775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760104
26014	NC_003198	CGG	2	6	1225779	1225784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760104
26015	NC_003198	GA	3	6	1225811	1225816	50 %	0 %	50 %	0 %	16760104
26016	NC_003198	TGAT	2	8	1225852	1225859	25 %	50 %	25 %	0 %	16760104
26017	NC_003198	CAT	2	6	1225869	1225874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760104
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26019	NC_003198	GTA	2	6	1225947	1225952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760104
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26021	NC_003198	AAT	2	6	1226124	1226129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760104
26022	NC_003198	ATA	2	6	1226230	1226235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760104
26023	NC_003198	CAT	2	6	1226240	1226245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760104
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26032	NC_003198	TG	3	6	1226724	1226729	0 %	50 %	50 %	0 %	16760105
26033	NC_003198	CG	4	8	1226821	1226828	0 %	0 %	50 %	50 %	16760105
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26035	NC_003198	GC	3	6	1226868	1226873	0 %	0 %	50 %	50 %	16760105
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26044	NC_003198	CGCT	2	8	1227390	1227397	0 %	25 %	25 %	50 %	16760105
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26055	NC_003198	CGTT	2	8	1227823	1227830	0 %	50 %	25 %	25 %	16760105
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26233	NC_003198	T	7	7	1237100	1237106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26234	NC_003198	TCC	2	6	1237186	1237191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26235	NC_003198	TAA	2	6	1237202	1237207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26239	NC_003198	TCG	2	6	1237377	1237382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760116
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26354	NC_003198	GGC	2	6	1243547	1243552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760121
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26356	NC_003198	TCTT	2	8	1243620	1243627	0 %	75 %	0 %	25 %	16760121
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26477	NC_003198	GAT	2	6	1250335	1250340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760125
26478	NC_003198	CGG	2	6	1250344	1250349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760125
26479	NC_003198	CGT	2	6	1250396	1250401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760125
26480	NC_003198	CCA	2	6	1250424	1250429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16760125
26481	NC_003198	TC	3	6	1250452	1250457	0 %	50 %	0 %	50 %	16760125
26482	NC_003198	GC	3	6	1250475	1250480	0 %	0 %	50 %	50 %	16760125
26483	NC_003198	CTG	2	6	1250486	1250491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760125
26484	NC_003198	ATG	2	6	1250531	1250536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760125
26485	NC_003198	CAGT	2	8	1250555	1250562	25 %	25 %	25 %	25 %	16760125
26486	NC_003198	TC	3	6	1250747	1250752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26487	NC_003198	CGG	2	6	1250772	1250777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26488	NC_003198	T	7	7	1250780	1250786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26489	NC_003198	GCA	2	6	1250805	1250810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26490	NC_003198	CCG	2	6	1250826	1250831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26491	NC_003198	T	6	6	1250917	1250922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26492	NC_003198	GAT	2	6	1250937	1250942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26493	NC_003198	GCA	2	6	1250943	1250948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26494	NC_003198	TCA	2	6	1250994	1250999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760126
26495	NC_003198	ATA	3	9	1251009	1251017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760126
26496	NC_003198	AT	3	6	1251022	1251027	50 %	50 %	0 %	0 %	16760126
26497	NC_003198	GCT	2	6	1251048	1251053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760126
26498	NC_003198	GAG	2	6	1251060	1251065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16760126
26499	NC_003198	C	6	6	1251072	1251077	0 %	0 %	0 %	100 %	16760126
26500	NC_003198	AGA	2	6	1251083	1251088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16760126

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