MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_003198	CAG	2	6	1175610	1175615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760058
25002	NC_003198	AAC	2	6	1175709	1175714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25003	NC_003198	CAT	2	6	1175739	1175744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760059
25004	NC_003198	CGC	2	6	1175781	1175786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760059
25005	NC_003198	TAA	2	6	1175811	1175816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760059
25006	NC_003198	CAA	2	6	1175820	1175825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760059
25007	NC_003198	GGC	2	6	1175893	1175898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760059
25008	NC_003198	ATG	2	6	1175942	1175947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760059
25009	NC_003198	GC	3	6	1175972	1175977	0 %	0 %	50 %	50 %	16760059
25010	NC_003198	AGC	2	6	1175986	1175991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760059
25011	NC_003198	CTG	2	6	1176034	1176039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760059
25012	NC_003198	T	7	7	1176078	1176084	0 %	100 %	0 %	0 %	16760059
25013	NC_003198	GCG	2	6	1176124	1176129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760059
25014	NC_003198	ACC	2	6	1176178	1176183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16760059
25015	NC_003198	CAA	2	6	1176249	1176254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760059
25016	NC_003198	CGG	2	6	1176405	1176410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760059
25017	NC_003198	GGC	2	6	1176474	1176479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760059
25018	NC_003198	CCGAC	2	10	1176494	1176503	20 %	0 %	20 %	60 %	16760059
25019	NC_003198	GCC	2	6	1176532	1176537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760059
25020	NC_003198	CGG	2	6	1176582	1176587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760059
25021	NC_003198	CGTTC	2	10	1176596	1176605	0 %	40 %	20 %	40 %	16760059
25022	NC_003198	GTTGGC	2	12	1176642	1176653	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	16760059
25023	NC_003198	GCA	2	6	1176675	1176680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760059
25024	NC_003198	CTT	2	6	1176720	1176725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760059
25025	NC_003198	GGT	2	6	1176741	1176746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16760059
25026	NC_003198	TAA	2	6	1176759	1176764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760059
25027	NC_003198	GGT	2	6	1176795	1176800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16760059
25028	NC_003198	ACC	2	6	1176883	1176888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16760059
25029	NC_003198	CAA	2	6	1176896	1176901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760059
25030	NC_003198	TCT	2	6	1176978	1176983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760059
25031	NC_003198	TCG	2	6	1177004	1177009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760059
25032	NC_003198	CAA	2	6	1177152	1177157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760059
25033	NC_003198	CAG	2	6	1177224	1177229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760059
25034	NC_003198	CAC	2	6	1177230	1177235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16760059
25035	NC_003198	CGA	2	6	1177296	1177301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760059
25036	NC_003198	CAG	2	6	1177327	1177332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760059
25037	NC_003198	TAT	2	6	1177333	1177338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16760059
25038	NC_003198	GAT	2	6	1177436	1177441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760060
25039	NC_003198	CGATC	2	10	1177541	1177550	20 %	20 %	20 %	40 %	16760060
25040	NC_003198	GTA	2	6	1177566	1177571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760060
25041	NC_003198	CAGGCG	2	12	1177578	1177589	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16760060
25042	NC_003198	GAA	2	6	1177644	1177649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16760060
25043	NC_003198	TCAG	2	8	1177657	1177664	25 %	25 %	25 %	25 %	16760060
25044	NC_003198	GAC	2	6	1177667	1177672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760060
25045	NC_003198	A	6	6	1177693	1177698	100 %	0 %	0 %	0 %	16760060
25046	NC_003198	CGA	2	6	1177727	1177732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760060
25047	NC_003198	CG	3	6	1177737	1177742	0 %	0 %	50 %	50 %	16760060
25048	NC_003198	TGA	2	6	1177780	1177785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760060
25049	NC_003198	GCG	2	6	1177845	1177850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760060
25050	NC_003198	GGT	2	6	1177869	1177874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16760060
25051	NC_003198	GGC	2	6	1177881	1177886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760060
25052	NC_003198	CAG	2	6	1177902	1177907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760060
25053	NC_003198	CGCA	2	8	1177916	1177923	25 %	0 %	25 %	50 %	16760060
25054	NC_003198	GAAAAA	2	12	1178079	1178090	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	16760060
25055	NC_003198	GCC	2	6	1178097	1178102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760060
25056	NC_003198	A	6	6	1178126	1178131	100 %	0 %	0 %	0 %	16760060
25057	NC_003198	TAA	2	6	1178138	1178143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760060
25058	NC_003198	TCC	2	6	1178280	1178285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16760060
25059	NC_003198	GGC	2	6	1178300	1178305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760060
25060	NC_003198	T	6	6	1178445	1178450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25061	NC_003198	TTA	2	6	1178510	1178515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25062	NC_003198	CAA	2	6	1178568	1178573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25063	NC_003198	GA	3	6	1178685	1178690	50 %	0 %	50 %	0 %	16760061
25064	NC_003198	GCA	2	6	1178706	1178711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760061
25065	NC_003198	TG	3	6	1178724	1178729	0 %	50 %	50 %	0 %	16760061
25066	NC_003198	TGT	2	6	1178762	1178767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16760061
25067	NC_003198	CCG	2	6	1178798	1178803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760061
25068	NC_003198	GT	3	6	1178811	1178816	0 %	50 %	50 %	0 %	16760061
25069	NC_003198	AGT	2	6	1178846	1178851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760061
25070	NC_003198	GTAA	2	8	1179045	1179052	50 %	25 %	25 %	0 %	16760061
25071	NC_003198	AG	3	6	1179106	1179111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25072	NC_003198	GGA	2	6	1179148	1179153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25073	NC_003198	TATT	2	8	1179154	1179161	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25074	NC_003198	CGTA	2	8	1179213	1179220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25075	NC_003198	CCCG	2	8	1179225	1179232	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25076	NC_003198	A	8	8	1179298	1179305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25077	NC_003198	CAT	2	6	1179340	1179345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760062
25078	NC_003198	CTG	2	6	1179404	1179409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760062
25079	NC_003198	GGAA	2	8	1179428	1179435	50 %	0 %	50 %	0 %	16760062
25080	NC_003198	GC	3	6	1179503	1179508	0 %	0 %	50 %	50 %	16760062
25081	NC_003198	CCA	2	6	1179554	1179559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16760062
25082	NC_003198	TCT	2	6	1179583	1179588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760062
25083	NC_003198	CCGCTT	2	12	1179608	1179619	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	16760062
25084	NC_003198	TCT	3	9	1179625	1179633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760062
25085	NC_003198	CGACAA	2	12	1179638	1179649	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	16760062
25086	NC_003198	CGG	2	6	1179686	1179691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760062
25087	NC_003198	TCA	2	6	1179769	1179774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760062
25088	NC_003198	GAC	2	6	1179816	1179821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760062
25089	NC_003198	GCT	2	6	1179971	1179976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760062
25090	NC_003198	CAA	2	6	1179980	1179985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760062
25091	NC_003198	GGAC	2	8	1180000	1180007	25 %	0 %	50 %	25 %	16760062
25092	NC_003198	GCGACG	2	12	1180110	1180121	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16760062
25093	NC_003198	CGG	2	6	1180153	1180158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760062
25094	NC_003198	TAT	2	6	1180178	1180183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16760062
25095	NC_003198	ATC	2	6	1180200	1180205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760062
25096	NC_003198	TCG	2	6	1180306	1180311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760062
25097	NC_003198	ACG	2	6	1180312	1180317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760062
25098	NC_003198	CTG	2	6	1180404	1180409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760062
25099	NC_003198	TTC	2	6	1180416	1180421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760062
25100	NC_003198	TTC	2	6	1180446	1180451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760062
25101	NC_003198	CTG	2	6	1180473	1180478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760062
25102	NC_003198	TCA	2	6	1180492	1180497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760062
25103	NC_003198	GCG	3	9	1180500	1180508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760062
25104	NC_003198	TGC	2	6	1180534	1180539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760062
25105	NC_003198	CCG	2	6	1180562	1180567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760062
25106	NC_003198	CTG	2	6	1180572	1180577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760062
25107	NC_003198	CG	3	6	1180586	1180591	0 %	0 %	50 %	50 %	16760062
25108	NC_003198	TGC	3	9	1180603	1180611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760062
25109	NC_003198	ACG	2	6	1180626	1180631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760062
25110	NC_003198	TCG	2	6	1180636	1180641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760062
25111	NC_003198	CGC	2	6	1180649	1180654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760062
25112	NC_003198	CGTT	2	8	1180690	1180697	0 %	50 %	25 %	25 %	16760062
25113	NC_003198	GTT	2	6	1180710	1180715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16760062
25114	NC_003198	CGA	2	6	1180729	1180734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760062
25115	NC_003198	CTG	2	6	1180737	1180742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760062
25116	NC_003198	TTC	2	6	1180755	1180760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760062
25117	NC_003198	TTC	2	6	1180794	1180799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760062
25118	NC_003198	GTT	2	6	1180811	1180816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16760062
25119	NC_003198	GCT	2	6	1180859	1180864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760062
25120	NC_003198	CGG	2	6	1180865	1180870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760062
25121	NC_003198	CCG	2	6	1180904	1180909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760062
25122	NC_003198	CTT	2	6	1180997	1181002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760062
25123	NC_003198	CTT	2	6	1181021	1181026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760062
25124	NC_003198	GCA	2	6	1181039	1181044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760062
25125	NC_003198	TTC	2	6	1181064	1181069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760062
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25127	NC_003198	CCGT	2	8	1181174	1181181	0 %	25 %	25 %	50 %	16760062
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25147	NC_003198	CGC	2	6	1182201	1182206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760062
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25149	NC_003198	CTT	2	6	1182224	1182229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760062
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25153	NC_003198	CTG	2	6	1182513	1182518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760062
25154	NC_003198	ATT	2	6	1182558	1182563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25155	NC_003198	GAC	2	6	1182572	1182577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25156	NC_003198	AGC	2	6	1182730	1182735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760063
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25162	NC_003198	TAA	2	6	1183008	1183013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25163	NC_003198	TG	3	6	1183078	1183083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25164	NC_003198	C	6	6	1183113	1183118	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25165	NC_003198	TTG	2	6	1183147	1183152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16760064
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25188	NC_003198	GCGA	2	8	1184576	1184583	25 %	0 %	50 %	25 %	16760065
25189	NC_003198	GCA	2	6	1184607	1184612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760065
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25194	NC_003198	T	6	6	1184747	1184752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25195	NC_003198	ATG	2	6	1184770	1184775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25197	NC_003198	ATT	2	6	1184868	1184873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25199	NC_003198	CA	3	6	1185195	1185200	50 %	0 %	0 %	50 %	16760066
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25206	NC_003198	ACA	2	6	1185524	1185529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760067
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25213	NC_003198	CGA	2	6	1185813	1185818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25221	NC_003198	GTC	2	6	1186336	1186341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760068
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25225	NC_003198	A	6	6	1186600	1186605	100 %	0 %	0 %	0 %	16760068
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25227	NC_003198	GCT	2	6	1186617	1186622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760068
25228	NC_003198	TTA	2	6	1186624	1186629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16760068
25229	NC_003198	A	6	6	1186643	1186648	100 %	0 %	0 %	0 %	16760068
25230	NC_003198	CTGT	2	8	1186698	1186705	0 %	50 %	25 %	25 %	16760068
25231	NC_003198	ATA	2	6	1186899	1186904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760068
25232	NC_003198	GCC	2	6	1186921	1186926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25233	NC_003198	TA	3	6	1186954	1186959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25234	NC_003198	ATT	2	6	1186994	1186999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16760069
25235	NC_003198	A	6	6	1187049	1187054	100 %	0 %	0 %	0 %	16760069
25236	NC_003198	CGC	2	6	1187113	1187118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760069
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25238	NC_003198	CG	3	6	1187162	1187167	0 %	0 %	50 %	50 %	16760069
25239	NC_003198	GCAT	2	8	1187233	1187240	25 %	25 %	25 %	25 %	16760069
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25340	NC_003198	GCT	2	6	1192494	1192499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760075
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25344	NC_003198	AGCG	2	8	1192817	1192824	25 %	0 %	50 %	25 %	16760075
25345	NC_003198	ATT	2	6	1192921	1192926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16760075
25346	NC_003198	TTA	2	6	1192976	1192981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16760075
25347	NC_003198	GCC	2	6	1193118	1193123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760075
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25350	NC_003198	GCCA	2	8	1193242	1193249	25 %	0 %	25 %	50 %	16760075
25351	NC_003198	A	7	7	1193282	1193288	100 %	0 %	0 %	0 %	16760075
25352	NC_003198	GC	3	6	1193342	1193347	0 %	0 %	50 %	50 %	16760076
25353	NC_003198	GTG	3	9	1193351	1193359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16760076
25354	NC_003198	AAG	2	6	1193437	1193442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16760076
25355	NC_003198	CGA	2	6	1193470	1193475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760076
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25477	NC_003198	TCA	2	6	1199426	1199431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25478	NC_003198	CTG	2	6	1199451	1199456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25479	NC_003198	TTC	2	6	1199562	1199567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25480	NC_003198	GTC	2	6	1199587	1199592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25481	NC_003198	GGC	2	6	1199628	1199633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25482	NC_003198	GCG	2	6	1199677	1199682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25483	NC_003198	CGG	2	6	1199704	1199709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25484	NC_003198	TGAA	2	8	1199713	1199720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25485	NC_003198	CTTG	2	8	1199736	1199743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25486	NC_003198	T	6	6	1199880	1199885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25487	NC_003198	TAA	2	6	1199951	1199956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25488	NC_003198	TAT	2	6	1200046	1200051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25489	NC_003198	CGT	2	6	1200064	1200069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760080
25490	NC_003198	AGA	2	6	1200073	1200078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16760080
25491	NC_003198	ATT	2	6	1200095	1200100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16760080
25492	NC_003198	CGT	2	6	1200101	1200106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760080
25493	NC_003198	ATT	2	6	1200191	1200196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16760080
25494	NC_003198	TGACG	2	10	1200223	1200232	20 %	20 %	40 %	20 %	16760080
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25496	NC_003198	GGC	2	6	1200271	1200276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760080
25497	NC_003198	AAG	2	6	1200291	1200296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16760080
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25499	NC_003198	GCC	2	6	1200387	1200392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760080
25500	NC_003198	TGC	3	9	1200464	1200472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760081

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