MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_003198	TTC	2	6	1129546	1129551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24002	NC_003198	ATG	2	6	1129584	1129589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760008
24003	NC_003198	CAC	2	6	1129622	1129627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16760008
24004	NC_003198	ATA	2	6	1129693	1129698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760008
24005	NC_003198	TGG	2	6	1129799	1129804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16760008
24006	NC_003198	TGG	2	6	1129856	1129861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16760008
24007	NC_003198	A	8	8	1129869	1129876	100 %	0 %	0 %	0 %	16760008
24008	NC_003198	AAACG	2	10	1129997	1130006	60 %	0 %	20 %	20 %	16760008
24009	NC_003198	TTA	2	6	1130014	1130019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16760008
24010	NC_003198	A	7	7	1130086	1130092	100 %	0 %	0 %	0 %	16760008
24011	NC_003198	ATT	2	6	1130107	1130112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16760008
24012	NC_003198	TAA	2	6	1130114	1130119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760008
24013	NC_003198	ATT	2	6	1130131	1130136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16760008
24014	NC_003198	T	7	7	1130135	1130141	0 %	100 %	0 %	0 %	16760008
24015	NC_003198	GAA	2	6	1130183	1130188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16760008
24016	NC_003198	AAT	2	6	1130241	1130246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760008
24017	NC_003198	GAA	2	6	1130339	1130344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16760008
24018	NC_003198	AAC	2	6	1130371	1130376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760008
24019	NC_003198	GGT	2	6	1130433	1130438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16760008
24020	NC_003198	CAAAA	2	10	1130458	1130467	80 %	0 %	0 %	20 %	16760008
24021	NC_003198	ATAA	2	8	1130502	1130509	75 %	25 %	0 %	0 %	16760008
24022	NC_003198	A	6	6	1130508	1130513	100 %	0 %	0 %	0 %	16760008
24023	NC_003198	AT	3	6	1130555	1130560	50 %	50 %	0 %	0 %	16760008
24024	NC_003198	AAC	2	6	1130572	1130577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760008
24025	NC_003198	TGA	2	6	1130609	1130614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760008
24026	NC_003198	TGG	2	6	1130627	1130632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16760008
24027	NC_003198	CCT	2	6	1130668	1130673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16760008
24028	NC_003198	TAA	2	6	1130698	1130703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760008
24029	NC_003198	AAT	2	6	1130704	1130709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760008
24030	NC_003198	T	6	6	1130709	1130714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24031	NC_003198	TCT	2	6	1130771	1130776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760009
24032	NC_003198	TCA	2	6	1130802	1130807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760009
24033	NC_003198	TAA	2	6	1130864	1130869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760009
24034	NC_003198	GAG	2	6	1130941	1130946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16760009
24035	NC_003198	TCG	2	6	1130980	1130985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760009
24036	NC_003198	TTATAA	2	12	1131011	1131022	50 %	50 %	0 %	0 %	16760009
24037	NC_003198	TTTTG	2	10	1131035	1131044	0 %	80 %	20 %	0 %	16760009
24038	NC_003198	ATG	3	9	1131184	1131192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760009
24039	NC_003198	TA	3	6	1131216	1131221	50 %	50 %	0 %	0 %	16760009
24040	NC_003198	TGA	2	6	1131233	1131238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760009
24041	NC_003198	TGGA	2	8	1131264	1131271	25 %	25 %	50 %	0 %	16760009
24042	NC_003198	AAATT	2	10	1131280	1131289	60 %	40 %	0 %	0 %	16760009
24043	NC_003198	A	7	7	1131297	1131303	100 %	0 %	0 %	0 %	16760009
24044	NC_003198	ATA	2	6	1131391	1131396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760009
24045	NC_003198	GA	3	6	1131402	1131407	50 %	0 %	50 %	0 %	16760009
24046	NC_003198	GAT	2	6	1131577	1131582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24047	NC_003198	AATT	2	8	1131679	1131686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24048	NC_003198	TTC	2	6	1131741	1131746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760010
24049	NC_003198	A	7	7	1131775	1131781	100 %	0 %	0 %	0 %	16760010
24050	NC_003198	CTG	2	6	1131951	1131956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760010
24051	NC_003198	ATG	2	6	1131984	1131989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760010
24052	NC_003198	AGCG	2	8	1132154	1132161	25 %	0 %	50 %	25 %	16760010
24053	NC_003198	CAT	2	6	1132193	1132198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760010
24054	NC_003198	AGC	2	6	1132199	1132204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760010
24055	NC_003198	TGC	2	6	1132244	1132249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760010
24056	NC_003198	T	7	7	1132250	1132256	0 %	100 %	0 %	0 %	16760010
24057	NC_003198	GAA	2	6	1132323	1132328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16760010
24058	NC_003198	TATT	2	8	1132435	1132442	25 %	75 %	0 %	0 %	16760010
24059	NC_003198	GTTCT	2	10	1132443	1132452	0 %	60 %	20 %	20 %	16760010
24060	NC_003198	CGG	3	9	1132546	1132554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760010
24061	NC_003198	GAA	2	6	1132613	1132618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16760010
24062	NC_003198	TCT	2	6	1132634	1132639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760010
24063	NC_003198	ATT	2	6	1132687	1132692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16760010
24064	NC_003198	CTG	2	6	1132695	1132700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760010
24065	NC_003198	ACT	2	6	1132771	1132776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760010
24066	NC_003198	TTAT	2	8	1132810	1132817	25 %	75 %	0 %	0 %	16760010
24067	NC_003198	TGC	2	6	1132823	1132828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760010
24068	NC_003198	ATTCA	2	10	1132841	1132850	40 %	40 %	0 %	20 %	16760010
24069	NC_003198	GGC	2	6	1132853	1132858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760010
24070	NC_003198	GCGCT	2	10	1132888	1132897	0 %	20 %	40 %	40 %	16760010
24071	NC_003198	TTG	2	6	1132906	1132911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16760010
24072	NC_003198	CAA	2	6	1132924	1132929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760010
24073	NC_003198	ATT	2	6	1132938	1132943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16760010
24074	NC_003198	CGT	2	6	1132974	1132979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760010
24075	NC_003198	CAA	2	6	1132993	1132998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760010
24076	NC_003198	ATG	2	6	1133020	1133025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760011
24077	NC_003198	ATT	2	6	1133215	1133220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16760011
24078	NC_003198	TTAC	2	8	1133232	1133239	25 %	50 %	0 %	25 %	16760011
24079	NC_003198	GCG	2	6	1133257	1133262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760011
24080	NC_003198	AAG	2	6	1133345	1133350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16760011
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24082	NC_003198	TCA	2	6	1133417	1133422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760011
24083	NC_003198	GAA	2	6	1133502	1133507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16760011
24084	NC_003198	TCA	2	6	1133570	1133575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760011
24085	NC_003198	GGC	2	6	1133604	1133609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760011
24086	NC_003198	TGA	2	6	1133643	1133648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760011
24087	NC_003198	GAT	2	6	1133650	1133655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760011
24088	NC_003198	ATC	2	6	1133712	1133717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760011
24089	NC_003198	TAA	2	6	1133801	1133806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760011
24090	NC_003198	A	7	7	1133815	1133821	100 %	0 %	0 %	0 %	16760011
24091	NC_003198	GGA	2	6	1133850	1133855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16760011
24092	NC_003198	TGA	2	6	1133856	1133861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760011
24093	NC_003198	TCG	2	6	1133862	1133867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760011
24094	NC_003198	GATG	2	8	1133889	1133896	25 %	25 %	50 %	0 %	16760011
24095	NC_003198	TCA	2	6	1133944	1133949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760011
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24098	NC_003198	GCG	2	6	1134037	1134042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760011
24099	NC_003198	TGC	2	6	1134066	1134071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760011
24100	NC_003198	TTC	2	6	1134078	1134083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760011
24101	NC_003198	TGG	2	6	1134141	1134146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24102	NC_003198	GCGCT	2	10	1134162	1134171	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24103	NC_003198	GCC	2	6	1134204	1134209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24104	NC_003198	A	7	7	1134238	1134244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24105	NC_003198	G	7	7	1134287	1134293	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24106	NC_003198	GC	3	6	1134334	1134339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24107	NC_003198	CGGT	2	8	1134377	1134384	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24108	NC_003198	C	6	6	1134394	1134399	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24109	NC_003198	G	7	7	1134472	1134478	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24110	NC_003198	GC	3	6	1134519	1134524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24111	NC_003198	CGGT	2	8	1134562	1134569	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24112	NC_003198	C	6	6	1134579	1134584	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24113	NC_003198	G	7	7	1134657	1134663	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24114	NC_003198	GC	3	6	1134704	1134709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24115	NC_003198	CGGT	2	8	1134747	1134754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24116	NC_003198	C	6	6	1134764	1134769	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24117	NC_003198	G	7	7	1134842	1134848	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24118	NC_003198	GC	3	6	1134889	1134894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24119	NC_003198	CGGT	2	8	1134932	1134939	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24120	NC_003198	C	6	6	1134949	1134954	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24121	NC_003198	G	7	7	1135027	1135033	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24122	NC_003198	AC	3	6	1135061	1135066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24123	NC_003198	TCAA	2	8	1135165	1135172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24124	NC_003198	T	6	6	1135174	1135179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24125	NC_003198	A	8	8	1135180	1135187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24126	NC_003198	TAA	2	6	1135223	1135228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24128	NC_003198	TGC	2	6	1135269	1135274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24229	NC_003198	ATAAA	2	10	1140699	1140708	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24232	NC_003198	TGT	2	6	1140876	1140881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24233	NC_003198	T	7	7	1140889	1140895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24234	NC_003198	A	6	6	1140949	1140954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24235	NC_003198	TAA	2	6	1140967	1140972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24237	NC_003198	ATTTT	2	10	1141017	1141026	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24238	NC_003198	T	6	6	1141023	1141028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24239	NC_003198	A	9	9	1141072	1141080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24240	NC_003198	GT	3	6	1141085	1141090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24241	NC_003198	C	6	6	1141109	1141114	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24242	NC_003198	GGC	2	6	1141140	1141145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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24244	NC_003198	T	6	6	1141167	1141172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24248	NC_003198	TTA	2	6	1141289	1141294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24485	NC_003198	CGC	2	6	1152290	1152295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760031
24486	NC_003198	AG	3	6	1152300	1152305	50 %	0 %	50 %	0 %	16760031
24487	NC_003198	CAG	2	6	1152384	1152389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760031
24488	NC_003198	TAA	2	6	1152393	1152398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760031
24489	NC_003198	CG	3	6	1152399	1152404	0 %	0 %	50 %	50 %	16760031
24490	NC_003198	GC	3	6	1152590	1152595	0 %	0 %	50 %	50 %	16760031
24491	NC_003198	AG	3	6	1152626	1152631	50 %	0 %	50 %	0 %	16760031
24492	NC_003198	A	6	6	1152670	1152675	100 %	0 %	0 %	0 %	16760031
24493	NC_003198	CAGCC	2	10	1152676	1152685	20 %	0 %	20 %	60 %	16760031
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24495	NC_003198	ATC	2	6	1152770	1152775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24496	NC_003198	TAATTA	2	12	1152795	1152806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24497	NC_003198	GCG	2	6	1152931	1152936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760032
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